Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7M1D5

Protein Details
Accession W7M1D5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPKATTPSASRQTRRHNPLEHydrophilic
24-47TATGILKNKPSKRRSKGGDDEEENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-36KR
Subcellular Location(s) cyto 13, cyto_nucl 11.5, nucl 8, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007955  Bystin  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
KEGG fvr:FVEG_06200  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05291  Bystin  
Amino Acid Sequences MPKATTPSASRQTRRHNPLEDDITATGILKNKPSKRRSKGGDDEEENFVDDRASRTILRIGRELAEEENAGKAVAKPTVDTFGYDSRFDDEAEEENKVYDDDEAWGEDEEVVEEIEVDPNDLDMYRKFMPDEEDDLLKHGWDLKPTGEEQGESVNLADLILEKIAAHEAAQERRENNLGPPDEEDYELPPKVIEVYTKVGQILSRYKSGPLPKPFKILPTIPHWEDIIAITEPDKWSTNACYQATRIFVSSKPHIVQRFLEMVILDRVREDIYETKKLNVHLFNSLKKALYKPAAFFKGFLFPLVGSGTCTLREAHIISAVLTRISIPVLHSAAALKGLCDIAAQEASHGTEGGGATNIFIKALLEKKYALPFQVIDALVFHFLRFRSVDPASVQVGDAMSGLNEGDARTKLPVIWHQSLLAFAQRYKGDVTEDQREALLDLLLTHGHAAIGPEVRRELLAGRGRGVPLEPQGPALDGDDTMLID
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.8
3 0.78
4 0.75
5 0.77
6 0.74
7 0.65
8 0.58
9 0.5
10 0.42
11 0.34
12 0.28
13 0.22
14 0.21
15 0.21
16 0.24
17 0.33
18 0.41
19 0.51
20 0.59
21 0.68
22 0.71
23 0.8
24 0.8
25 0.82
26 0.84
27 0.84
28 0.84
29 0.77
30 0.72
31 0.66
32 0.58
33 0.49
34 0.39
35 0.29
36 0.2
37 0.16
38 0.15
39 0.14
40 0.16
41 0.15
42 0.17
43 0.24
44 0.26
45 0.29
46 0.29
47 0.29
48 0.28
49 0.3
50 0.29
51 0.24
52 0.22
53 0.19
54 0.17
55 0.16
56 0.14
57 0.12
58 0.11
59 0.11
60 0.12
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.16
65 0.2
66 0.2
67 0.19
68 0.2
69 0.24
70 0.26
71 0.25
72 0.24
73 0.23
74 0.24
75 0.23
76 0.21
77 0.16
78 0.18
79 0.19
80 0.2
81 0.16
82 0.16
83 0.16
84 0.14
85 0.13
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.07
109 0.08
110 0.07
111 0.12
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.15
116 0.19
117 0.21
118 0.25
119 0.22
120 0.22
121 0.22
122 0.24
123 0.22
124 0.18
125 0.15
126 0.15
127 0.14
128 0.15
129 0.16
130 0.15
131 0.18
132 0.19
133 0.22
134 0.17
135 0.16
136 0.15
137 0.16
138 0.14
139 0.12
140 0.11
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.08
155 0.11
156 0.15
157 0.18
158 0.2
159 0.2
160 0.22
161 0.24
162 0.21
163 0.2
164 0.24
165 0.23
166 0.21
167 0.22
168 0.23
169 0.22
170 0.22
171 0.2
172 0.15
173 0.17
174 0.16
175 0.14
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.09
181 0.09
182 0.14
183 0.15
184 0.16
185 0.16
186 0.15
187 0.15
188 0.17
189 0.21
190 0.18
191 0.2
192 0.2
193 0.21
194 0.25
195 0.31
196 0.36
197 0.39
198 0.43
199 0.42
200 0.46
201 0.45
202 0.43
203 0.41
204 0.34
205 0.29
206 0.29
207 0.33
208 0.29
209 0.29
210 0.27
211 0.23
212 0.21
213 0.18
214 0.14
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.08
223 0.09
224 0.12
225 0.15
226 0.19
227 0.2
228 0.19
229 0.19
230 0.21
231 0.22
232 0.19
233 0.17
234 0.13
235 0.14
236 0.18
237 0.19
238 0.2
239 0.2
240 0.23
241 0.24
242 0.24
243 0.23
244 0.22
245 0.22
246 0.19
247 0.19
248 0.14
249 0.14
250 0.15
251 0.14
252 0.1
253 0.08
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.12
259 0.17
260 0.23
261 0.24
262 0.26
263 0.28
264 0.3
265 0.32
266 0.29
267 0.26
268 0.28
269 0.31
270 0.31
271 0.32
272 0.32
273 0.28
274 0.27
275 0.27
276 0.24
277 0.27
278 0.26
279 0.25
280 0.31
281 0.34
282 0.33
283 0.32
284 0.29
285 0.28
286 0.26
287 0.24
288 0.18
289 0.13
290 0.14
291 0.14
292 0.13
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.09
299 0.08
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.12
307 0.12
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.12
322 0.11
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.06
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.09
345 0.09
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.09
350 0.14
351 0.17
352 0.17
353 0.18
354 0.22
355 0.27
356 0.28
357 0.26
358 0.23
359 0.21
360 0.21
361 0.25
362 0.22
363 0.16
364 0.16
365 0.16
366 0.16
367 0.16
368 0.14
369 0.11
370 0.11
371 0.14
372 0.14
373 0.15
374 0.19
375 0.2
376 0.23
377 0.22
378 0.25
379 0.24
380 0.23
381 0.21
382 0.16
383 0.15
384 0.12
385 0.11
386 0.07
387 0.06
388 0.05
389 0.05
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.08
394 0.08
395 0.1
396 0.11
397 0.12
398 0.13
399 0.17
400 0.24
401 0.29
402 0.33
403 0.33
404 0.33
405 0.32
406 0.32
407 0.29
408 0.27
409 0.2
410 0.17
411 0.21
412 0.2
413 0.22
414 0.22
415 0.22
416 0.22
417 0.27
418 0.32
419 0.35
420 0.35
421 0.35
422 0.33
423 0.32
424 0.28
425 0.22
426 0.17
427 0.08
428 0.07
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.07
433 0.07
434 0.06
435 0.07
436 0.08
437 0.1
438 0.15
439 0.16
440 0.18
441 0.19
442 0.19
443 0.19
444 0.19
445 0.17
446 0.21
447 0.28
448 0.27
449 0.29
450 0.32
451 0.32
452 0.32
453 0.32
454 0.27
455 0.24
456 0.26
457 0.24
458 0.22
459 0.23
460 0.23
461 0.22
462 0.19
463 0.16
464 0.12
465 0.13