Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3S4E4

Protein Details
Accession E3S4E4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
375-397ATASTSTVRRGRKRKSTVLEAEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
339-366RLKRAEEAAAKEAKANAKGQGKRGQKGK
384-389RGRKRK
Subcellular Location(s) nucl 8.5, cyto_nucl 8.5, cyto 7.5, mito 7, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG pte:PTT_17416  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
Amino Acid Sequences MDETGVMLSMLGSVKVLVSKDDKRTYRGARVKRTTVTAIECISADSRYLNPMIIWPATTHRSNWTTFPTPGWHYACNESGYTDSNISLQWLERVFDLETKEFANGRPRVLILDGFGTHETLKILEYCFANNIALCRLPSYTSHKLQPCDVAVFGPLKTAYREQVERLERGGVNAIGKEHFTYLYKPARERAFTAKNIKAGFAASGLFPFNPDRVLRTVPKPPAEPTPVVTNEAPSQDDAVLQTPITPVSADSLMLLQDLILKKDAHALDETSKQNLQRHLLKLAKATQLSLTKSALQHNHIQLLMAVDNEAKPRRSTRADILEKGSGQVFSYEHLQNRRLKRAEEAAAKEAKANAKGQGKRGQKGKNTVQETAEATASTSTVRRGRKRKSTVLEAEAGRSMPKGKAARVSDMEAAEAGGAPWIAPVARMY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.1
3 0.11
4 0.12
5 0.19
6 0.26
7 0.35
8 0.44
9 0.46
10 0.48
11 0.57
12 0.61
13 0.65
14 0.67
15 0.68
16 0.7
17 0.76
18 0.78
19 0.73
20 0.71
21 0.65
22 0.6
23 0.55
24 0.48
25 0.41
26 0.35
27 0.31
28 0.27
29 0.24
30 0.19
31 0.15
32 0.13
33 0.12
34 0.14
35 0.15
36 0.14
37 0.13
38 0.15
39 0.19
40 0.17
41 0.17
42 0.15
43 0.2
44 0.24
45 0.25
46 0.24
47 0.27
48 0.3
49 0.32
50 0.34
51 0.37
52 0.37
53 0.37
54 0.38
55 0.36
56 0.36
57 0.42
58 0.42
59 0.37
60 0.34
61 0.37
62 0.37
63 0.34
64 0.3
65 0.24
66 0.22
67 0.22
68 0.21
69 0.18
70 0.15
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.13
75 0.11
76 0.12
77 0.12
78 0.13
79 0.12
80 0.14
81 0.14
82 0.16
83 0.19
84 0.17
85 0.17
86 0.17
87 0.18
88 0.17
89 0.19
90 0.25
91 0.24
92 0.24
93 0.24
94 0.24
95 0.23
96 0.24
97 0.22
98 0.14
99 0.14
100 0.13
101 0.14
102 0.14
103 0.13
104 0.11
105 0.12
106 0.11
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.09
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.12
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.11
125 0.14
126 0.22
127 0.27
128 0.3
129 0.37
130 0.4
131 0.41
132 0.42
133 0.42
134 0.35
135 0.3
136 0.26
137 0.19
138 0.17
139 0.16
140 0.14
141 0.12
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.13
146 0.14
147 0.17
148 0.18
149 0.19
150 0.27
151 0.29
152 0.28
153 0.27
154 0.29
155 0.24
156 0.24
157 0.24
158 0.16
159 0.14
160 0.13
161 0.13
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.16
170 0.22
171 0.24
172 0.25
173 0.29
174 0.32
175 0.32
176 0.33
177 0.35
178 0.35
179 0.38
180 0.45
181 0.42
182 0.42
183 0.41
184 0.38
185 0.3
186 0.24
187 0.19
188 0.12
189 0.1
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.1
200 0.12
201 0.15
202 0.17
203 0.2
204 0.27
205 0.29
206 0.31
207 0.31
208 0.3
209 0.33
210 0.33
211 0.31
212 0.25
213 0.27
214 0.26
215 0.27
216 0.25
217 0.21
218 0.19
219 0.19
220 0.18
221 0.12
222 0.12
223 0.09
224 0.1
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.04
235 0.06
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.04
244 0.07
245 0.08
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.11
250 0.17
251 0.17
252 0.15
253 0.16
254 0.16
255 0.17
256 0.24
257 0.25
258 0.21
259 0.23
260 0.24
261 0.28
262 0.29
263 0.32
264 0.32
265 0.34
266 0.39
267 0.41
268 0.4
269 0.39
270 0.41
271 0.41
272 0.34
273 0.32
274 0.29
275 0.3
276 0.3
277 0.29
278 0.25
279 0.23
280 0.25
281 0.29
282 0.28
283 0.27
284 0.31
285 0.31
286 0.33
287 0.29
288 0.27
289 0.23
290 0.21
291 0.18
292 0.11
293 0.1
294 0.08
295 0.09
296 0.13
297 0.15
298 0.15
299 0.17
300 0.2
301 0.26
302 0.31
303 0.34
304 0.39
305 0.47
306 0.51
307 0.53
308 0.53
309 0.5
310 0.45
311 0.42
312 0.34
313 0.24
314 0.18
315 0.16
316 0.12
317 0.1
318 0.15
319 0.18
320 0.21
321 0.26
322 0.31
323 0.37
324 0.44
325 0.52
326 0.5
327 0.48
328 0.49
329 0.53
330 0.55
331 0.55
332 0.53
333 0.5
334 0.49
335 0.48
336 0.44
337 0.4
338 0.36
339 0.31
340 0.28
341 0.29
342 0.35
343 0.38
344 0.43
345 0.49
346 0.52
347 0.56
348 0.62
349 0.64
350 0.62
351 0.68
352 0.71
353 0.72
354 0.7
355 0.67
356 0.6
357 0.55
358 0.5
359 0.43
360 0.34
361 0.24
362 0.19
363 0.16
364 0.14
365 0.12
366 0.11
367 0.14
368 0.2
369 0.29
370 0.39
371 0.48
372 0.58
373 0.68
374 0.76
375 0.81
376 0.82
377 0.84
378 0.83
379 0.78
380 0.75
381 0.65
382 0.59
383 0.5
384 0.42
385 0.32
386 0.25
387 0.22
388 0.17
389 0.23
390 0.25
391 0.27
392 0.36
393 0.39
394 0.46
395 0.47
396 0.5
397 0.46
398 0.42
399 0.39
400 0.3
401 0.26
402 0.19
403 0.15
404 0.1
405 0.07
406 0.06
407 0.05
408 0.05
409 0.06
410 0.05