Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7LTX1

Protein Details
Accession W7LTX1    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-46EQKALAERKRTKQRIEEIKEHydrophilic
167-231MGIHDEKKKEKSRRREDRPDRHRRRHRHRSADPDDRHHRRRRSDSRSRSPRRRDDSREGRHRRGRBasic
246-278SEDREPRREHRSRHERPRDERPRESRRDFRRSYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
173-285KKKEKSRRREDRPDRHRRRHRHRSADPDDRHHRRRRSDSRSRSPRRRDDSREGRHRRGRDDSREDRSRRRHDDSEDREPRREHRSRHERPRDERPRESRRDFRRSYPDSRDRR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG fvr:FVEG_00182  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGGGDLNLKKSFHPALRRNQQAVWDEEQKALAERKRTKQRIEEIKEELKNEEVQRQLEAAGGKKRVDRVDWMYQGPNDGEGGTTEESEAYLLGKRRIDHLIKGTEHKKLEKEAGAESFMALQNANTARDTAAKIRDDPLLAIKRQEQAAYEAMMNDPIKRRQLLSSMGIHDEKKKEKSRRREDRPDRHRRRHRHRSADPDDRHHRRRRSDSRSRSPRRRDDSREGRHRRGRDDSREDRSRRRHDDSEDREPRREHRSRHERPRDERPRESRRDFRRSYPDSRDRRPRYNEEDDKAKEEERQRKLAAMQSAATELDEDRAKRLTALEQQEAAAREADDKARERVGDRSFVNKLHQQVGHKGLADRMGGSRRGYQRDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.57
3 0.67
4 0.75
5 0.73
6 0.68
7 0.68
8 0.63
9 0.6
10 0.55
11 0.52
12 0.45
13 0.43
14 0.41
15 0.34
16 0.33
17 0.35
18 0.32
19 0.35
20 0.42
21 0.51
22 0.61
23 0.68
24 0.71
25 0.74
26 0.8
27 0.81
28 0.8
29 0.77
30 0.73
31 0.75
32 0.7
33 0.63
34 0.54
35 0.45
36 0.44
37 0.39
38 0.37
39 0.33
40 0.3
41 0.3
42 0.29
43 0.26
44 0.23
45 0.23
46 0.22
47 0.24
48 0.27
49 0.27
50 0.3
51 0.35
52 0.35
53 0.35
54 0.37
55 0.38
56 0.44
57 0.46
58 0.46
59 0.44
60 0.41
61 0.41
62 0.35
63 0.28
64 0.19
65 0.15
66 0.12
67 0.09
68 0.12
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.06
77 0.09
78 0.11
79 0.15
80 0.18
81 0.18
82 0.22
83 0.29
84 0.31
85 0.32
86 0.36
87 0.4
88 0.4
89 0.47
90 0.46
91 0.45
92 0.46
93 0.44
94 0.4
95 0.37
96 0.4
97 0.36
98 0.34
99 0.31
100 0.3
101 0.27
102 0.25
103 0.21
104 0.18
105 0.15
106 0.13
107 0.1
108 0.08
109 0.11
110 0.12
111 0.13
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.14
116 0.16
117 0.16
118 0.2
119 0.2
120 0.21
121 0.23
122 0.24
123 0.22
124 0.21
125 0.24
126 0.24
127 0.23
128 0.23
129 0.24
130 0.25
131 0.25
132 0.25
133 0.18
134 0.17
135 0.18
136 0.17
137 0.15
138 0.12
139 0.12
140 0.14
141 0.13
142 0.12
143 0.14
144 0.16
145 0.18
146 0.18
147 0.2
148 0.18
149 0.22
150 0.24
151 0.24
152 0.25
153 0.24
154 0.26
155 0.26
156 0.25
157 0.26
158 0.26
159 0.27
160 0.31
161 0.38
162 0.46
163 0.53
164 0.63
165 0.7
166 0.77
167 0.83
168 0.86
169 0.89
170 0.9
171 0.92
172 0.93
173 0.92
174 0.92
175 0.92
176 0.91
177 0.91
178 0.91
179 0.9
180 0.9
181 0.86
182 0.86
183 0.85
184 0.84
185 0.76
186 0.73
187 0.72
188 0.69
189 0.71
190 0.68
191 0.67
192 0.64
193 0.72
194 0.74
195 0.75
196 0.78
197 0.8
198 0.83
199 0.88
200 0.89
201 0.89
202 0.88
203 0.88
204 0.85
205 0.83
206 0.81
207 0.8
208 0.81
209 0.81
210 0.83
211 0.81
212 0.81
213 0.79
214 0.75
215 0.69
216 0.68
217 0.67
218 0.65
219 0.67
220 0.66
221 0.68
222 0.73
223 0.71
224 0.71
225 0.72
226 0.72
227 0.69
228 0.69
229 0.66
230 0.64
231 0.71
232 0.7
233 0.72
234 0.72
235 0.67
236 0.64
237 0.61
238 0.58
239 0.57
240 0.56
241 0.51
242 0.52
243 0.6
244 0.66
245 0.76
246 0.82
247 0.81
248 0.81
249 0.87
250 0.87
251 0.83
252 0.83
253 0.81
254 0.81
255 0.81
256 0.82
257 0.8
258 0.79
259 0.81
260 0.75
261 0.74
262 0.74
263 0.71
264 0.72
265 0.72
266 0.73
267 0.71
268 0.76
269 0.79
270 0.76
271 0.79
272 0.78
273 0.77
274 0.75
275 0.78
276 0.77
277 0.71
278 0.72
279 0.65
280 0.61
281 0.55
282 0.47
283 0.43
284 0.44
285 0.49
286 0.46
287 0.5
288 0.47
289 0.47
290 0.5
291 0.49
292 0.44
293 0.37
294 0.32
295 0.26
296 0.27
297 0.24
298 0.2
299 0.15
300 0.11
301 0.12
302 0.14
303 0.14
304 0.15
305 0.17
306 0.17
307 0.17
308 0.19
309 0.21
310 0.27
311 0.32
312 0.34
313 0.33
314 0.33
315 0.36
316 0.36
317 0.31
318 0.24
319 0.18
320 0.16
321 0.18
322 0.21
323 0.22
324 0.23
325 0.25
326 0.27
327 0.28
328 0.28
329 0.34
330 0.35
331 0.37
332 0.35
333 0.39
334 0.4
335 0.41
336 0.45
337 0.42
338 0.42
339 0.42
340 0.45
341 0.43
342 0.47
343 0.51
344 0.48
345 0.46
346 0.43
347 0.38
348 0.38
349 0.34
350 0.28
351 0.27
352 0.29
353 0.29
354 0.31
355 0.37
356 0.4
357 0.46