Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RI22

Protein Details
Accession E3RI22    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-129GVAPRAKMNQQRSRRFRAAREAKEKDHydrophilic
776-797VEKALYRKGQQKHKIDPAKSRAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.5, cyto 9.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
GO:0051984  P:positive regulation of chromosome segregation  
GO:0106354  P:tRNA surveillance  
KEGG pte:PTT_07622  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPAMFRWLSQKYPKIVSTVQEELPKKVGDAVIPVDRTGPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDKPAPKTEADMMMAIFEYTDRVVGMVRPRKLLYMAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAREAKEKDEERAEFQKILNSQKASRGEDIDTLEEVMEKTWDSNAITPGTPFMHLLAESLQYWCAYKFTTDPSWKDMKVIISDASVPGEGEHKIMNFIRSQRAMPTHDPNTSHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFKVLREDVFYDSGKDKVCTRCGRKGHIRTNCEFPEDEKKLTEEEAAEEWATSEHQLKPYIWLHTNVLREYLAVEMDTPKRTFKYDLERSLDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIRDQGIDLLISIWRDLAAEMDDYVTKDGYPDMRRVQQIMSALATREAGIFKKRKEVSDRQAANRARREAQSNAHKRQRTDNDGVSAPGFKRAKETTDTYTSAGIVFFDPKDAQSKEVRDVHKDIMHTRDSQSNKSAAARLKELLKAKADGTSLPEPEQTPDSEPALESASGTETPVQLGKRKLDEVDDLDNGTPGRNTPVVPQSPTQAAQPPKKDDSPPEDTIMLWEDGYEERYYEQKFHVAPNDIAFRNKVARQYAEGLCWVLAYYMQGCPSWTWYFPHHYAPFAADFVGLEDMDPRKLFEKGVPFHPYEQLMGVLPAASNHAIPEPFRVLMEDPNSSIVDFYPEDFPIDLNGKKFAWQGVAVLPFIDEKRLLEAMGTKYPELSDDERKRNEFGKETLMFSQESGLFDDVEKALYRKGQQKHKIDPAKSRALHGDIEPHDLFVMDSQLVPPFDADGTTDFEITQDRSMRVYYEMPSVSSSRAHKSVLLEGVKLPKPALQPGEAESVRRSNERGGFRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.52
3 0.52
4 0.52
5 0.49
6 0.48
7 0.45
8 0.44
9 0.46
10 0.46
11 0.43
12 0.44
13 0.4
14 0.33
15 0.32
16 0.29
17 0.22
18 0.24
19 0.26
20 0.28
21 0.28
22 0.28
23 0.27
24 0.26
25 0.27
26 0.3
27 0.29
28 0.26
29 0.28
30 0.29
31 0.29
32 0.3
33 0.31
34 0.28
35 0.26
36 0.23
37 0.21
38 0.2
39 0.17
40 0.16
41 0.13
42 0.1
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.12
49 0.18
50 0.21
51 0.21
52 0.28
53 0.37
54 0.45
55 0.53
56 0.55
57 0.53
58 0.5
59 0.53
60 0.5
61 0.45
62 0.37
63 0.3
64 0.25
65 0.21
66 0.2
67 0.17
68 0.12
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.11
77 0.21
78 0.27
79 0.3
80 0.33
81 0.34
82 0.36
83 0.37
84 0.37
85 0.32
86 0.31
87 0.29
88 0.26
89 0.26
90 0.24
91 0.25
92 0.23
93 0.18
94 0.12
95 0.14
96 0.2
97 0.28
98 0.38
99 0.46
100 0.55
101 0.65
102 0.73
103 0.79
104 0.82
105 0.8
106 0.77
107 0.78
108 0.78
109 0.78
110 0.8
111 0.77
112 0.72
113 0.74
114 0.69
115 0.63
116 0.6
117 0.52
118 0.47
119 0.47
120 0.46
121 0.39
122 0.38
123 0.39
124 0.35
125 0.4
126 0.39
127 0.37
128 0.36
129 0.41
130 0.47
131 0.45
132 0.44
133 0.4
134 0.36
135 0.36
136 0.36
137 0.3
138 0.25
139 0.21
140 0.18
141 0.16
142 0.14
143 0.11
144 0.09
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.1
149 0.1
150 0.13
151 0.16
152 0.17
153 0.18
154 0.17
155 0.19
156 0.18
157 0.17
158 0.14
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.12
163 0.11
164 0.12
165 0.11
166 0.12
167 0.12
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.09
173 0.1
174 0.12
175 0.17
176 0.25
177 0.31
178 0.33
179 0.38
180 0.43
181 0.41
182 0.41
183 0.38
184 0.33
185 0.29
186 0.28
187 0.23
188 0.18
189 0.19
190 0.18
191 0.15
192 0.12
193 0.1
194 0.08
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.1
199 0.09
200 0.12
201 0.14
202 0.15
203 0.17
204 0.2
205 0.25
206 0.26
207 0.27
208 0.28
209 0.32
210 0.36
211 0.37
212 0.42
213 0.4
214 0.42
215 0.43
216 0.4
217 0.42
218 0.37
219 0.32
220 0.25
221 0.21
222 0.18
223 0.17
224 0.14
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.03
232 0.02
233 0.03
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.07
238 0.08
239 0.13
240 0.15
241 0.15
242 0.18
243 0.22
244 0.25
245 0.26
246 0.27
247 0.25
248 0.27
249 0.26
250 0.25
251 0.22
252 0.21
253 0.2
254 0.19
255 0.21
256 0.23
257 0.31
258 0.37
259 0.43
260 0.49
261 0.52
262 0.6
263 0.65
264 0.7
265 0.72
266 0.72
267 0.72
268 0.66
269 0.7
270 0.63
271 0.55
272 0.45
273 0.39
274 0.4
275 0.37
276 0.35
277 0.28
278 0.28
279 0.26
280 0.26
281 0.24
282 0.14
283 0.13
284 0.13
285 0.13
286 0.12
287 0.11
288 0.1
289 0.09
290 0.09
291 0.07
292 0.1
293 0.11
294 0.13
295 0.16
296 0.16
297 0.21
298 0.24
299 0.27
300 0.26
301 0.26
302 0.26
303 0.29
304 0.32
305 0.26
306 0.25
307 0.2
308 0.18
309 0.17
310 0.14
311 0.09
312 0.07
313 0.07
314 0.09
315 0.12
316 0.14
317 0.14
318 0.16
319 0.16
320 0.18
321 0.21
322 0.22
323 0.3
324 0.36
325 0.42
326 0.46
327 0.46
328 0.45
329 0.47
330 0.42
331 0.32
332 0.24
333 0.18
334 0.13
335 0.12
336 0.11
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.11
351 0.12
352 0.13
353 0.12
354 0.13
355 0.12
356 0.12
357 0.11
358 0.07
359 0.05
360 0.04
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.06
380 0.11
381 0.12
382 0.15
383 0.18
384 0.22
385 0.23
386 0.24
387 0.24
388 0.21
389 0.21
390 0.18
391 0.16
392 0.12
393 0.12
394 0.11
395 0.1
396 0.08
397 0.07
398 0.07
399 0.08
400 0.13
401 0.17
402 0.18
403 0.27
404 0.28
405 0.31
406 0.38
407 0.46
408 0.47
409 0.53
410 0.56
411 0.5
412 0.58
413 0.58
414 0.56
415 0.52
416 0.48
417 0.41
418 0.38
419 0.39
420 0.34
421 0.37
422 0.42
423 0.45
424 0.5
425 0.54
426 0.54
427 0.52
428 0.58
429 0.57
430 0.54
431 0.5
432 0.45
433 0.41
434 0.39
435 0.38
436 0.29
437 0.24
438 0.17
439 0.19
440 0.18
441 0.15
442 0.19
443 0.19
444 0.21
445 0.23
446 0.27
447 0.24
448 0.28
449 0.29
450 0.26
451 0.25
452 0.22
453 0.19
454 0.16
455 0.12
456 0.07
457 0.07
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.12
463 0.12
464 0.15
465 0.18
466 0.2
467 0.24
468 0.31
469 0.32
470 0.3
471 0.33
472 0.34
473 0.32
474 0.31
475 0.27
476 0.25
477 0.26
478 0.24
479 0.23
480 0.26
481 0.26
482 0.27
483 0.28
484 0.25
485 0.24
486 0.24
487 0.26
488 0.23
489 0.23
490 0.22
491 0.21
492 0.22
493 0.26
494 0.27
495 0.25
496 0.24
497 0.23
498 0.21
499 0.23
500 0.21
501 0.17
502 0.19
503 0.2
504 0.19
505 0.18
506 0.19
507 0.17
508 0.18
509 0.19
510 0.14
511 0.14
512 0.15
513 0.15
514 0.14
515 0.13
516 0.13
517 0.13
518 0.12
519 0.09
520 0.07
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.08
525 0.07
526 0.07
527 0.1
528 0.11
529 0.14
530 0.17
531 0.19
532 0.21
533 0.22
534 0.23
535 0.22
536 0.24
537 0.23
538 0.24
539 0.22
540 0.2
541 0.19
542 0.19
543 0.17
544 0.14
545 0.1
546 0.07
547 0.09
548 0.09
549 0.1
550 0.13
551 0.2
552 0.22
553 0.25
554 0.25
555 0.25
556 0.26
557 0.26
558 0.24
559 0.23
560 0.28
561 0.32
562 0.37
563 0.4
564 0.41
565 0.44
566 0.45
567 0.44
568 0.45
569 0.46
570 0.43
571 0.4
572 0.36
573 0.32
574 0.31
575 0.28
576 0.21
577 0.13
578 0.1
579 0.09
580 0.09
581 0.11
582 0.1
583 0.08
584 0.08
585 0.12
586 0.13
587 0.14
588 0.15
589 0.17
590 0.19
591 0.21
592 0.26
593 0.26
594 0.26
595 0.28
596 0.33
597 0.29
598 0.29
599 0.26
600 0.23
601 0.24
602 0.25
603 0.26
604 0.24
605 0.25
606 0.27
607 0.32
608 0.32
609 0.29
610 0.27
611 0.23
612 0.19
613 0.17
614 0.14
615 0.08
616 0.07
617 0.06
618 0.07
619 0.07
620 0.08
621 0.09
622 0.1
623 0.1
624 0.15
625 0.16
626 0.16
627 0.17
628 0.2
629 0.27
630 0.28
631 0.36
632 0.33
633 0.32
634 0.31
635 0.31
636 0.29
637 0.22
638 0.2
639 0.11
640 0.1
641 0.1
642 0.1
643 0.08
644 0.06
645 0.09
646 0.1
647 0.12
648 0.12
649 0.12
650 0.13
651 0.14
652 0.15
653 0.16
654 0.24
655 0.26
656 0.33
657 0.37
658 0.37
659 0.38
660 0.4
661 0.37
662 0.29
663 0.26
664 0.2
665 0.16
666 0.14
667 0.12
668 0.09
669 0.07
670 0.07
671 0.08
672 0.07
673 0.07
674 0.07
675 0.09
676 0.1
677 0.11
678 0.15
679 0.15
680 0.15
681 0.15
682 0.17
683 0.16
684 0.2
685 0.23
686 0.2
687 0.18
688 0.2
689 0.2
690 0.18
691 0.17
692 0.12
693 0.13
694 0.12
695 0.13
696 0.13
697 0.13
698 0.15
699 0.15
700 0.15
701 0.14
702 0.18
703 0.18
704 0.17
705 0.19
706 0.18
707 0.2
708 0.22
709 0.2
710 0.19
711 0.17
712 0.18
713 0.19
714 0.21
715 0.19
716 0.17
717 0.16
718 0.15
719 0.15
720 0.15
721 0.11
722 0.1
723 0.14
724 0.14
725 0.14
726 0.13
727 0.18
728 0.21
729 0.25
730 0.26
731 0.22
732 0.22
733 0.23
734 0.23
735 0.23
736 0.23
737 0.29
738 0.36
739 0.45
740 0.5
741 0.52
742 0.54
743 0.54
744 0.55
745 0.49
746 0.44
747 0.44
748 0.41
749 0.42
750 0.41
751 0.38
752 0.32
753 0.27
754 0.28
755 0.21
756 0.2
757 0.19
758 0.17
759 0.16
760 0.16
761 0.18
762 0.15
763 0.14
764 0.14
765 0.12
766 0.14
767 0.18
768 0.23
769 0.29
770 0.37
771 0.47
772 0.55
773 0.63
774 0.71
775 0.77
776 0.81
777 0.79
778 0.81
779 0.78
780 0.79
781 0.71
782 0.65
783 0.59
784 0.53
785 0.49
786 0.4
787 0.41
788 0.32
789 0.38
790 0.35
791 0.3
792 0.27
793 0.24
794 0.23
795 0.15
796 0.16
797 0.09
798 0.09
799 0.1
800 0.13
801 0.14
802 0.14
803 0.13
804 0.12
805 0.12
806 0.11
807 0.12
808 0.1
809 0.15
810 0.15
811 0.16
812 0.14
813 0.14
814 0.17
815 0.17
816 0.21
817 0.2
818 0.2
819 0.21
820 0.22
821 0.23
822 0.24
823 0.25
824 0.23
825 0.25
826 0.25
827 0.25
828 0.27
829 0.27
830 0.26
831 0.28
832 0.29
833 0.29
834 0.31
835 0.31
836 0.32
837 0.34
838 0.39
839 0.41
840 0.39
841 0.34
842 0.35
843 0.42
844 0.42
845 0.39
846 0.33
847 0.3
848 0.31
849 0.37
850 0.37
851 0.32
852 0.31
853 0.33
854 0.42
855 0.38
856 0.37
857 0.33
858 0.34
859 0.35
860 0.35
861 0.34
862 0.33
863 0.4