Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7MRB2

Protein Details
Accession W7MRB2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
167-187HDPEERRRRNQENRSRYRDRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
190-199HHRGGQGRRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5, mito 1, pero 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
KEGG fvr:FVEG_07359  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDLDIEMDDAVDTVHDAPILDIGRDDILQPDEPEEPGEVAEDEPPTDDSKTLIPTKIHIKGVDSLHTTDIKTYVKAHFGDVDRIEWIDDSSANLLFPSEPTARDAIVALSSVPVADATALAIGETLPAKPFEGKPEISLQVRFAVQSDKKEVGAALRSRYYLLHPEHDPEERRRRNQENRSRYRDRDDGHHRGGQGRRRRASDDDVETFEASMYDDAPRPTRRRRDSDIEERPRSYARENQGKELFSGRKTQRDRSASPRRDNDGDDLMGERASSSGNRARARDLKDHISSSNNSKELFPTKKSIKQFGGGNLDTLERAIGSARLKDEDRPKIVSVPNARGDGNSFNIRGTASQQGSGEGFAIKGAASANARELFPAKLGSSNTGKELFGGGRSKQRQKAEDLFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.07
4 0.07
5 0.12
6 0.13
7 0.12
8 0.11
9 0.12
10 0.12
11 0.13
12 0.13
13 0.11
14 0.14
15 0.16
16 0.16
17 0.18
18 0.18
19 0.18
20 0.19
21 0.17
22 0.14
23 0.12
24 0.13
25 0.11
26 0.1
27 0.12
28 0.12
29 0.11
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.15
37 0.21
38 0.23
39 0.26
40 0.25
41 0.28
42 0.36
43 0.41
44 0.42
45 0.37
46 0.36
47 0.38
48 0.41
49 0.42
50 0.37
51 0.32
52 0.31
53 0.32
54 0.3
55 0.24
56 0.25
57 0.21
58 0.2
59 0.22
60 0.22
61 0.25
62 0.26
63 0.26
64 0.28
65 0.29
66 0.34
67 0.31
68 0.29
69 0.25
70 0.24
71 0.23
72 0.17
73 0.15
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.15
88 0.16
89 0.15
90 0.15
91 0.15
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.03
104 0.03
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.03
110 0.04
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.1
117 0.11
118 0.16
119 0.2
120 0.2
121 0.22
122 0.26
123 0.29
124 0.28
125 0.28
126 0.23
127 0.2
128 0.2
129 0.18
130 0.14
131 0.19
132 0.19
133 0.21
134 0.25
135 0.24
136 0.23
137 0.24
138 0.23
139 0.18
140 0.22
141 0.21
142 0.2
143 0.2
144 0.2
145 0.2
146 0.21
147 0.2
148 0.21
149 0.21
150 0.23
151 0.22
152 0.24
153 0.26
154 0.3
155 0.31
156 0.32
157 0.41
158 0.43
159 0.48
160 0.53
161 0.6
162 0.66
163 0.73
164 0.76
165 0.76
166 0.79
167 0.82
168 0.81
169 0.75
170 0.71
171 0.66
172 0.57
173 0.55
174 0.54
175 0.53
176 0.5
177 0.49
178 0.44
179 0.44
180 0.47
181 0.46
182 0.45
183 0.47
184 0.46
185 0.46
186 0.49
187 0.47
188 0.47
189 0.45
190 0.42
191 0.35
192 0.34
193 0.32
194 0.29
195 0.25
196 0.19
197 0.13
198 0.08
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.07
203 0.08
204 0.12
205 0.17
206 0.22
207 0.3
208 0.39
209 0.45
210 0.5
211 0.56
212 0.61
213 0.65
214 0.71
215 0.74
216 0.73
217 0.7
218 0.63
219 0.58
220 0.51
221 0.44
222 0.37
223 0.33
224 0.31
225 0.38
226 0.38
227 0.43
228 0.45
229 0.44
230 0.41
231 0.4
232 0.35
233 0.27
234 0.35
235 0.31
236 0.36
237 0.39
238 0.45
239 0.48
240 0.52
241 0.55
242 0.56
243 0.65
244 0.65
245 0.69
246 0.68
247 0.64
248 0.61
249 0.58
250 0.52
251 0.44
252 0.35
253 0.28
254 0.23
255 0.18
256 0.15
257 0.13
258 0.09
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.09
263 0.14
264 0.2
265 0.24
266 0.25
267 0.3
268 0.37
269 0.42
270 0.45
271 0.45
272 0.45
273 0.46
274 0.47
275 0.42
276 0.4
277 0.37
278 0.36
279 0.38
280 0.33
281 0.3
282 0.29
283 0.31
284 0.35
285 0.38
286 0.34
287 0.36
288 0.4
289 0.47
290 0.51
291 0.54
292 0.49
293 0.49
294 0.5
295 0.49
296 0.51
297 0.44
298 0.4
299 0.34
300 0.31
301 0.26
302 0.22
303 0.15
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.09
308 0.1
309 0.13
310 0.15
311 0.18
312 0.19
313 0.26
314 0.34
315 0.39
316 0.41
317 0.42
318 0.42
319 0.46
320 0.47
321 0.48
322 0.46
323 0.45
324 0.45
325 0.44
326 0.42
327 0.36
328 0.37
329 0.32
330 0.31
331 0.28
332 0.23
333 0.21
334 0.22
335 0.22
336 0.2
337 0.2
338 0.23
339 0.2
340 0.22
341 0.22
342 0.24
343 0.24
344 0.23
345 0.21
346 0.13
347 0.11
348 0.08
349 0.08
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.09
354 0.1
355 0.11
356 0.16
357 0.18
358 0.18
359 0.19
360 0.2
361 0.18
362 0.18
363 0.2
364 0.16
365 0.19
366 0.2
367 0.24
368 0.28
369 0.29
370 0.3
371 0.3
372 0.29
373 0.25
374 0.27
375 0.23
376 0.23
377 0.26
378 0.26
379 0.34
380 0.43
381 0.51
382 0.56
383 0.63
384 0.62
385 0.66