Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7MZ04

Protein Details
Accession W7MZ04    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MPLHRAAVRRNRSHSCRRRCSPLQRSSWIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
171-186KKAVDKAREKARVKKL
Subcellular Location(s) mito 18, nucl 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034104  Lsm1  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR044642  PTHR15588  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0000932  C:P-body  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
KEGG fvr:FVEG_11552  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
CDD cd01728  LSm1  
Amino Acid Sequences MPLHRAAVRRNRSHSCRRRCSPLQRSSWISQTVRLRHGTSLFLFPVHERRVGLDKKQGEREGSCADDCIIAEKLMVALRDGRKLIGVLRSWDQFANLVLQSTVERIFAPSPESAGSDRPTGLYADINHGIFLVRGENVLLLGEIDLDRDDDPPPGFEPGDLDVVKKLAEEKKAVDKAREKARVKKLAKQGFEGENIGEIVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.82
3 0.83
4 0.81
5 0.83
6 0.83
7 0.86
8 0.86
9 0.85
10 0.82
11 0.78
12 0.79
13 0.72
14 0.69
15 0.65
16 0.55
17 0.52
18 0.52
19 0.5
20 0.48
21 0.48
22 0.43
23 0.39
24 0.4
25 0.37
26 0.31
27 0.29
28 0.25
29 0.22
30 0.21
31 0.19
32 0.25
33 0.23
34 0.23
35 0.19
36 0.22
37 0.3
38 0.33
39 0.35
40 0.35
41 0.4
42 0.43
43 0.5
44 0.49
45 0.44
46 0.42
47 0.42
48 0.37
49 0.33
50 0.27
51 0.21
52 0.19
53 0.16
54 0.15
55 0.13
56 0.11
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.09
63 0.07
64 0.11
65 0.12
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.16
72 0.15
73 0.14
74 0.14
75 0.16
76 0.17
77 0.18
78 0.17
79 0.16
80 0.12
81 0.11
82 0.11
83 0.09
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.12
102 0.13
103 0.11
104 0.12
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.13
112 0.15
113 0.14
114 0.13
115 0.13
116 0.12
117 0.1
118 0.1
119 0.07
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.03
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.1
139 0.11
140 0.12
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.14
145 0.14
146 0.18
147 0.17
148 0.16
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.13
153 0.17
154 0.16
155 0.2
156 0.22
157 0.25
158 0.35
159 0.43
160 0.45
161 0.47
162 0.5
163 0.54
164 0.62
165 0.68
166 0.63
167 0.66
168 0.74
169 0.77
170 0.74
171 0.75
172 0.75
173 0.74
174 0.73
175 0.68
176 0.64
177 0.58
178 0.57
179 0.49
180 0.39
181 0.31