Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7MMC8

Protein Details
Accession W7MMC8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-263RDEMRSHSRSRSRSRNRSQSDSRSRSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-152RKLRRRG
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG fvr:FVEG_06470  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSRNKDTVHADARRFLDERGSNVSVAPNGLNPATIMEKAVKDRIVDSYFYKEQCFALNEADIVDRVVEHVNFIGGTYGVTQKPSPFLCLAFKLLELSPSDAVLMEYLKYGGEAFKYLRALACFYFRLTRQAKDVYQMLEPFLEDRRKLRRRGRAGVVLTFMDEFVDELLTKERVCGTSLWKMPKREVLEDLEILEPRVSPLGDLEDLLEEEDEAEKENGTREESGEISDRDDMEVDRDEMRSHSRSRSRSRNRSQSDSRSRSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.4
3 0.39
4 0.35
5 0.36
6 0.37
7 0.36
8 0.32
9 0.31
10 0.33
11 0.24
12 0.23
13 0.2
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.11
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.16
25 0.19
26 0.23
27 0.22
28 0.21
29 0.22
30 0.26
31 0.26
32 0.25
33 0.25
34 0.29
35 0.31
36 0.32
37 0.31
38 0.27
39 0.25
40 0.27
41 0.26
42 0.2
43 0.19
44 0.18
45 0.17
46 0.16
47 0.16
48 0.12
49 0.1
50 0.08
51 0.06
52 0.07
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.09
65 0.09
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.16
70 0.17
71 0.18
72 0.16
73 0.17
74 0.19
75 0.2
76 0.21
77 0.18
78 0.17
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.13
83 0.14
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.09
88 0.09
89 0.07
90 0.07
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.14
109 0.12
110 0.12
111 0.14
112 0.14
113 0.21
114 0.22
115 0.22
116 0.23
117 0.26
118 0.25
119 0.25
120 0.27
121 0.2
122 0.2
123 0.19
124 0.16
125 0.13
126 0.12
127 0.1
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.16
132 0.26
133 0.31
134 0.4
135 0.47
136 0.53
137 0.59
138 0.66
139 0.69
140 0.66
141 0.63
142 0.56
143 0.5
144 0.4
145 0.32
146 0.25
147 0.18
148 0.1
149 0.07
150 0.06
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.07
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.15
164 0.22
165 0.27
166 0.35
167 0.39
168 0.41
169 0.42
170 0.48
171 0.47
172 0.42
173 0.41
174 0.37
175 0.35
176 0.33
177 0.33
178 0.27
179 0.23
180 0.21
181 0.17
182 0.12
183 0.09
184 0.1
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.06
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.15
208 0.14
209 0.16
210 0.16
211 0.18
212 0.19
213 0.18
214 0.18
215 0.19
216 0.19
217 0.17
218 0.17
219 0.15
220 0.14
221 0.17
222 0.16
223 0.16
224 0.16
225 0.16
226 0.18
227 0.23
228 0.24
229 0.26
230 0.34
231 0.41
232 0.49
233 0.58
234 0.67
235 0.72
236 0.79
237 0.86
238 0.88
239 0.87
240 0.88
241 0.88
242 0.88
243 0.88