Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7MDF8

Protein Details
Accession W7MDF8    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-107QNIDAVPKTKRQPKKKKANIHTPQARQVNHydrophilic
481-504EVEGRESRKKKGWQRVQHDLNNNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-95KTKRQPKKKK
150-157KPAAKPPP
487-491SRKKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG fvr:FVEG_09069  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSIAQLSQLLPLPDDELKQVLGYASTLSTTEAAEHFGNLLGDSPQAIEFISSFNARRQTSAPGTSPYSNAAAPPEPQSQNIDAVPKTKRQPKKKKANIHTPQARQVNDYAAPAGTTYSKKDLSLDYIPQRSSAPSSNNASRSNTPKPDPKPAAKPPPKQHASAGYLIGEGPSKPKPKSTPVSRSSTPKPAPSTKISIAGGMPMAGASTAISDLDAAIRALEISTNPTLENSKSRKCNCVATRHPLQGAAPNCLSCGKVICMKEGLGPCTFCGSPLLTPDDVQAMVRELKEERGRERMAANRDANRRADIARTPAPFTQPRGNDGASLSDAEAKARAHRDKLLNFQAQNARRTTVRDEAADFDVGGALTGTGSMWATPEERARELKRQQKVLREMEWNARPDYEKRKQVVSIDVVGGKVVRKMAAVERPVTPESDEDPVDNGVLAETSANKKSGRGGGAFSGNPLLGALIKPVFDAKGKGAEVEGRESRKKKGWQRVQHDLNNNEEVILDGGVQGHDRSDEPACG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.17
4 0.16
5 0.16
6 0.16
7 0.13
8 0.11
9 0.1
10 0.1
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.1
15 0.1
16 0.09
17 0.11
18 0.1
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.12
23 0.13
24 0.13
25 0.11
26 0.12
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.07
35 0.07
36 0.08
37 0.11
38 0.12
39 0.13
40 0.18
41 0.26
42 0.26
43 0.28
44 0.29
45 0.34
46 0.38
47 0.42
48 0.41
49 0.38
50 0.42
51 0.41
52 0.4
53 0.34
54 0.3
55 0.25
56 0.23
57 0.22
58 0.19
59 0.19
60 0.24
61 0.28
62 0.27
63 0.29
64 0.32
65 0.3
66 0.32
67 0.32
68 0.31
69 0.24
70 0.28
71 0.3
72 0.32
73 0.38
74 0.45
75 0.53
76 0.6
77 0.71
78 0.76
79 0.85
80 0.88
81 0.91
82 0.92
83 0.93
84 0.91
85 0.91
86 0.89
87 0.83
88 0.82
89 0.77
90 0.68
91 0.59
92 0.51
93 0.45
94 0.36
95 0.32
96 0.24
97 0.17
98 0.16
99 0.14
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.14
104 0.18
105 0.19
106 0.19
107 0.21
108 0.22
109 0.25
110 0.27
111 0.32
112 0.34
113 0.37
114 0.37
115 0.36
116 0.35
117 0.3
118 0.29
119 0.27
120 0.25
121 0.26
122 0.32
123 0.36
124 0.4
125 0.41
126 0.42
127 0.42
128 0.45
129 0.48
130 0.48
131 0.47
132 0.51
133 0.53
134 0.59
135 0.61
136 0.61
137 0.62
138 0.66
139 0.72
140 0.73
141 0.78
142 0.76
143 0.8
144 0.76
145 0.69
146 0.63
147 0.6
148 0.54
149 0.47
150 0.4
151 0.29
152 0.26
153 0.24
154 0.21
155 0.13
156 0.09
157 0.1
158 0.14
159 0.19
160 0.19
161 0.25
162 0.29
163 0.37
164 0.46
165 0.53
166 0.57
167 0.59
168 0.65
169 0.63
170 0.66
171 0.62
172 0.62
173 0.55
174 0.5
175 0.5
176 0.49
177 0.5
178 0.48
179 0.49
180 0.41
181 0.43
182 0.38
183 0.33
184 0.27
185 0.23
186 0.19
187 0.12
188 0.1
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.11
216 0.19
217 0.21
218 0.26
219 0.34
220 0.36
221 0.4
222 0.41
223 0.49
224 0.46
225 0.51
226 0.51
227 0.5
228 0.54
229 0.51
230 0.49
231 0.4
232 0.36
233 0.32
234 0.27
235 0.24
236 0.18
237 0.16
238 0.16
239 0.16
240 0.16
241 0.1
242 0.1
243 0.08
244 0.13
245 0.13
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.18
250 0.18
251 0.19
252 0.15
253 0.14
254 0.13
255 0.15
256 0.15
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.09
261 0.11
262 0.14
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.1
269 0.09
270 0.07
271 0.09
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.13
276 0.18
277 0.2
278 0.2
279 0.25
280 0.26
281 0.26
282 0.28
283 0.3
284 0.31
285 0.36
286 0.37
287 0.38
288 0.42
289 0.44
290 0.42
291 0.37
292 0.34
293 0.27
294 0.27
295 0.22
296 0.23
297 0.25
298 0.25
299 0.26
300 0.26
301 0.3
302 0.29
303 0.31
304 0.33
305 0.28
306 0.3
307 0.31
308 0.3
309 0.26
310 0.24
311 0.22
312 0.15
313 0.15
314 0.12
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.12
319 0.1
320 0.13
321 0.19
322 0.21
323 0.21
324 0.27
325 0.33
326 0.35
327 0.43
328 0.47
329 0.46
330 0.44
331 0.47
332 0.49
333 0.47
334 0.48
335 0.41
336 0.35
337 0.31
338 0.34
339 0.32
340 0.31
341 0.29
342 0.26
343 0.27
344 0.28
345 0.29
346 0.26
347 0.21
348 0.14
349 0.12
350 0.11
351 0.09
352 0.06
353 0.04
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.04
361 0.05
362 0.06
363 0.08
364 0.12
365 0.14
366 0.17
367 0.23
368 0.27
369 0.35
370 0.43
371 0.49
372 0.52
373 0.59
374 0.62
375 0.65
376 0.7
377 0.67
378 0.64
379 0.61
380 0.57
381 0.57
382 0.57
383 0.5
384 0.42
385 0.38
386 0.36
387 0.36
388 0.43
389 0.43
390 0.45
391 0.45
392 0.48
393 0.5
394 0.5
395 0.51
396 0.45
397 0.39
398 0.33
399 0.32
400 0.27
401 0.25
402 0.22
403 0.16
404 0.14
405 0.12
406 0.1
407 0.09
408 0.12
409 0.18
410 0.24
411 0.26
412 0.27
413 0.29
414 0.33
415 0.33
416 0.32
417 0.27
418 0.22
419 0.21
420 0.22
421 0.21
422 0.17
423 0.18
424 0.17
425 0.16
426 0.14
427 0.11
428 0.07
429 0.07
430 0.06
431 0.05
432 0.08
433 0.12
434 0.14
435 0.17
436 0.17
437 0.18
438 0.23
439 0.29
440 0.3
441 0.27
442 0.28
443 0.3
444 0.35
445 0.34
446 0.29
447 0.25
448 0.21
449 0.19
450 0.16
451 0.12
452 0.08
453 0.08
454 0.1
455 0.09
456 0.1
457 0.1
458 0.11
459 0.13
460 0.14
461 0.16
462 0.16
463 0.22
464 0.22
465 0.22
466 0.23
467 0.26
468 0.26
469 0.31
470 0.34
471 0.33
472 0.42
473 0.44
474 0.49
475 0.53
476 0.61
477 0.64
478 0.69
479 0.74
480 0.76
481 0.82
482 0.87
483 0.88
484 0.87
485 0.86
486 0.79
487 0.74
488 0.66
489 0.57
490 0.46
491 0.36
492 0.28
493 0.2
494 0.16
495 0.1
496 0.07
497 0.08
498 0.09
499 0.1
500 0.09
501 0.08
502 0.1
503 0.1
504 0.13