Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

W7LWC0

Protein Details
Accession W7LWC0    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-74SEAPAKKRKRNEDDAADLKKAKKEKRDKKYKKESRKERKDKRKNLQDLPEQDDBasic
94-123APVEADKPAKKDKKKKDKKLKTDESQPKDDBasic
131-157KEESKEESKKSKKDKKKQNKTSETTTTHydrophilic
260-289GGGGKTKQRQDKIKEKNRKLDENRAKRIERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-64AKKRKRNEDDAADLKKAKKEKRDKKYKKESRKERKDKRK
100-114KPAKKDKKKKDKKLK
135-148KEESKKSKKDKKKQ
263-316GKTKQRQDKIKEKNRKLDENRAKRIERERMAKEENKGKGDTRKAGEDGIHPSRR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG fvr:FVEG_02446  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MKSKRARETAEVDDKPIASVDSEAPAKKRKRNEDDAADLKKAKKEKRDKKYKKESRKERKDKRKNLQDLPEQDDDEEAAEDASMAEADDKPVDAPVEADKPAKKDKKKKDKKLKTDESQPKDDANTDSQPKEESKEESKKSKKDKKKQNKTSETTTTNDESAAGADAEAANGKGDRHIVFVGNLPFTATAETIKAHFASLNPVSVRCMSDPKDSKPCRGFAFVEFEKVWHMRTCLDKFHHSEFSDGVSYPRRINVELTAGGGGKTKQRQDKIKEKNRKLDENRAKRIERERMAKEENKGKGDTRKAGEDGIHPSRRAHIPGNRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.39
3 0.33
4 0.24
5 0.14
6 0.15
7 0.13
8 0.15
9 0.19
10 0.21
11 0.24
12 0.33
13 0.4
14 0.45
15 0.54
16 0.6
17 0.66
18 0.73
19 0.79
20 0.78
21 0.8
22 0.81
23 0.76
24 0.69
25 0.63
26 0.57
27 0.53
28 0.52
29 0.5
30 0.52
31 0.58
32 0.65
33 0.73
34 0.81
35 0.87
36 0.9
37 0.94
38 0.95
39 0.95
40 0.95
41 0.95
42 0.95
43 0.96
44 0.96
45 0.96
46 0.96
47 0.96
48 0.96
49 0.96
50 0.95
51 0.93
52 0.91
53 0.89
54 0.86
55 0.81
56 0.77
57 0.69
58 0.58
59 0.49
60 0.4
61 0.31
62 0.22
63 0.16
64 0.1
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.04
70 0.04
71 0.03
72 0.04
73 0.05
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.06
81 0.07
82 0.09
83 0.12
84 0.13
85 0.16
86 0.17
87 0.2
88 0.3
89 0.38
90 0.44
91 0.52
92 0.62
93 0.71
94 0.8
95 0.88
96 0.9
97 0.92
98 0.94
99 0.95
100 0.94
101 0.89
102 0.89
103 0.88
104 0.82
105 0.77
106 0.67
107 0.57
108 0.47
109 0.43
110 0.34
111 0.28
112 0.27
113 0.25
114 0.24
115 0.23
116 0.24
117 0.23
118 0.23
119 0.21
120 0.2
121 0.25
122 0.33
123 0.37
124 0.45
125 0.52
126 0.56
127 0.65
128 0.71
129 0.74
130 0.75
131 0.83
132 0.84
133 0.89
134 0.92
135 0.92
136 0.92
137 0.86
138 0.83
139 0.79
140 0.7
141 0.6
142 0.53
143 0.43
144 0.33
145 0.28
146 0.21
147 0.14
148 0.11
149 0.09
150 0.06
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.13
168 0.14
169 0.12
170 0.12
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.08
184 0.07
185 0.12
186 0.13
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.16
191 0.17
192 0.18
193 0.14
194 0.18
195 0.18
196 0.27
197 0.31
198 0.35
199 0.44
200 0.45
201 0.51
202 0.5
203 0.51
204 0.45
205 0.45
206 0.41
207 0.33
208 0.4
209 0.33
210 0.34
211 0.3
212 0.27
213 0.26
214 0.24
215 0.23
216 0.16
217 0.17
218 0.16
219 0.24
220 0.26
221 0.3
222 0.34
223 0.38
224 0.4
225 0.45
226 0.48
227 0.41
228 0.4
229 0.34
230 0.32
231 0.28
232 0.24
233 0.22
234 0.2
235 0.21
236 0.21
237 0.24
238 0.23
239 0.22
240 0.24
241 0.24
242 0.23
243 0.22
244 0.22
245 0.2
246 0.18
247 0.17
248 0.17
249 0.15
250 0.16
251 0.21
252 0.27
253 0.34
254 0.42
255 0.51
256 0.58
257 0.68
258 0.73
259 0.79
260 0.83
261 0.84
262 0.86
263 0.85
264 0.87
265 0.84
266 0.84
267 0.84
268 0.84
269 0.85
270 0.83
271 0.77
272 0.73
273 0.76
274 0.74
275 0.71
276 0.7
277 0.66
278 0.66
279 0.71
280 0.7
281 0.68
282 0.67
283 0.65
284 0.6
285 0.57
286 0.54
287 0.55
288 0.58
289 0.58
290 0.54
291 0.53
292 0.5
293 0.5
294 0.47
295 0.43
296 0.43
297 0.45
298 0.45
299 0.4
300 0.4
301 0.44
302 0.46
303 0.46
304 0.46