Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3S8M7

Protein Details
Accession E3S8M7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-41HDGGNKRAKGKKNWDMPRRYTADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-31PKKRKAESGGAHDGGNKRAKGKKN
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004114  THUMP_dom  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
KEGG pte:PTT_19348  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02926  THUMP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51165  THUMP  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MPGTENAPKKRKAESGGAHDGGNKRAKGKKNWDMPRRYTADRAIQPGDTGIWATCAMKKEAKSVNDLRDLFQEYATKLYGSAESNGPASDDDSDDEGGDIEAEIKKELADIRKPTTKPLFTSLKLDTQCLMFFRTRSPLEPVSFVHKICQDIADGAQPRNLSYVKRLTPITATDKATPEGLEAVAKQVLAPHFHGADQAGKKFAIRPSIRNNKVFLRDNVIRTIAALVGPNHKVDLKGYDVLILVEIYKNVLGMSVVGRDFDTLKRYNIDELRQPRASTRVEPKEEAKEAIVNGEQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.62
3 0.65
4 0.63
5 0.56
6 0.54
7 0.51
8 0.47
9 0.46
10 0.38
11 0.35
12 0.42
13 0.5
14 0.55
15 0.63
16 0.66
17 0.7
18 0.79
19 0.83
20 0.84
21 0.82
22 0.81
23 0.77
24 0.71
25 0.65
26 0.61
27 0.61
28 0.56
29 0.55
30 0.48
31 0.43
32 0.39
33 0.34
34 0.28
35 0.19
36 0.15
37 0.1
38 0.09
39 0.09
40 0.1
41 0.13
42 0.14
43 0.17
44 0.21
45 0.22
46 0.28
47 0.34
48 0.35
49 0.4
50 0.44
51 0.46
52 0.5
53 0.5
54 0.44
55 0.41
56 0.43
57 0.36
58 0.31
59 0.28
60 0.2
61 0.22
62 0.2
63 0.16
64 0.12
65 0.13
66 0.14
67 0.13
68 0.14
69 0.13
70 0.13
71 0.14
72 0.14
73 0.13
74 0.11
75 0.1
76 0.09
77 0.08
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.07
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.07
94 0.1
95 0.14
96 0.18
97 0.22
98 0.26
99 0.34
100 0.34
101 0.39
102 0.44
103 0.41
104 0.38
105 0.41
106 0.42
107 0.36
108 0.4
109 0.36
110 0.35
111 0.33
112 0.32
113 0.26
114 0.21
115 0.2
116 0.16
117 0.17
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.18
122 0.18
123 0.19
124 0.22
125 0.24
126 0.24
127 0.25
128 0.24
129 0.25
130 0.26
131 0.24
132 0.22
133 0.19
134 0.19
135 0.18
136 0.17
137 0.11
138 0.1
139 0.11
140 0.13
141 0.13
142 0.12
143 0.14
144 0.13
145 0.13
146 0.15
147 0.15
148 0.11
149 0.14
150 0.2
151 0.2
152 0.22
153 0.23
154 0.21
155 0.22
156 0.25
157 0.27
158 0.25
159 0.26
160 0.26
161 0.27
162 0.27
163 0.26
164 0.22
165 0.16
166 0.12
167 0.1
168 0.08
169 0.07
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.14
182 0.12
183 0.17
184 0.18
185 0.18
186 0.17
187 0.17
188 0.17
189 0.21
190 0.22
191 0.26
192 0.26
193 0.31
194 0.4
195 0.51
196 0.56
197 0.55
198 0.56
199 0.52
200 0.57
201 0.57
202 0.48
203 0.46
204 0.45
205 0.45
206 0.44
207 0.39
208 0.31
209 0.26
210 0.26
211 0.17
212 0.13
213 0.13
214 0.11
215 0.15
216 0.16
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.18
223 0.17
224 0.18
225 0.18
226 0.18
227 0.17
228 0.17
229 0.16
230 0.12
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.06
241 0.07
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.11
247 0.13
248 0.15
249 0.2
250 0.19
251 0.21
252 0.24
253 0.25
254 0.32
255 0.35
256 0.37
257 0.41
258 0.44
259 0.5
260 0.51
261 0.5
262 0.46
263 0.47
264 0.46
265 0.45
266 0.5
267 0.52
268 0.54
269 0.57
270 0.59
271 0.62
272 0.61
273 0.55
274 0.46
275 0.4
276 0.34
277 0.34