Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PCX6

Protein Details
Accession A0A1D8PCX6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-26LDKINPKLLRRIYRACRPTNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9.5, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008152  Clathrin_a/b/g-adaptin_app_Ig  
IPR013041  Clathrin_app_Ig-like_sf  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR008153  GAE_dom  
IPR004152  GAT_dom  
IPR038425  GAT_sf  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005802  C:trans-Golgi network  
GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0006895  P:Golgi to endosome transport  
GO:0006896  P:Golgi to vacuole transport  
GO:0043328  P:protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway  
KEGG cal:CAALFM_C103130CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02883  Alpha_adaptinC2  
PF03127  GAT  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50180  GAE  
PS50909  GAT  
PS50179  VHS  
CDD cd16998  VHS_GGA_fungi  
Amino Acid Sequences MSSSYSLDKINPKLLRRIYRACRPTNDEPNLALNLEICDYVNAKKGSAPRDAAIAVVKLISQRDPQTSELAIALLDNLVKNCGYPFHLQISRKEFLNELVKRFPERPPLRYTRVHRLILAQIEEWYQTICRTSKYKDDFGYIKDMHRLLSNKGYVFPEVKVEDVAVLNPNDNLKSLEELQQEESIVHSAKLQELIRRGRPQDLQEANKLMKIMAGFKDDNVKENKKQIKQDITRLTRKVEILGEMLTSIESQGGKIDDSSDEAIIELYSSVKSSQPIINKMIEQSSDHDDNEEDVNKLLALNESANNVINKFQLLKGGNVSEASKIKTGSASQELNLIDFDDAPEDVSASKEQGYTDLLSDLSNLTFSENNNATTASSSTNVNPLNLYGAGGSISLGGGSGFPTISNTPSIYQPTPSAAQGKQTSSSNFDLLADLNSPSPQLQSNTNSSSLDPFGLQFPATTPSQVTGQGEGYIRMIPINQTSNLKIEIGVKSSSANSLKGKILFSNLQTSTISNLKFLIAVPKSCKLELRPQTSDKIFGFNNHGIQQDFNIENPLSKQLKIKWKVEYQINGSANEETGVSVLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.64
3 0.65
4 0.71
5 0.71
6 0.75
7 0.8
8 0.78
9 0.77
10 0.77
11 0.78
12 0.79
13 0.76
14 0.68
15 0.61
16 0.58
17 0.51
18 0.43
19 0.33
20 0.23
21 0.19
22 0.16
23 0.14
24 0.11
25 0.1
26 0.12
27 0.14
28 0.2
29 0.2
30 0.19
31 0.23
32 0.28
33 0.32
34 0.37
35 0.38
36 0.32
37 0.35
38 0.34
39 0.31
40 0.28
41 0.24
42 0.17
43 0.14
44 0.14
45 0.12
46 0.14
47 0.15
48 0.18
49 0.22
50 0.26
51 0.3
52 0.31
53 0.33
54 0.31
55 0.29
56 0.25
57 0.21
58 0.15
59 0.12
60 0.1
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.09
69 0.11
70 0.14
71 0.17
72 0.2
73 0.26
74 0.33
75 0.36
76 0.43
77 0.48
78 0.46
79 0.44
80 0.42
81 0.35
82 0.34
83 0.41
84 0.38
85 0.36
86 0.39
87 0.4
88 0.43
89 0.44
90 0.43
91 0.44
92 0.46
93 0.47
94 0.5
95 0.55
96 0.58
97 0.64
98 0.66
99 0.66
100 0.68
101 0.65
102 0.57
103 0.54
104 0.52
105 0.48
106 0.43
107 0.32
108 0.25
109 0.23
110 0.23
111 0.19
112 0.14
113 0.1
114 0.09
115 0.12
116 0.13
117 0.16
118 0.2
119 0.23
120 0.32
121 0.38
122 0.44
123 0.42
124 0.46
125 0.45
126 0.44
127 0.49
128 0.4
129 0.36
130 0.35
131 0.33
132 0.28
133 0.3
134 0.3
135 0.25
136 0.31
137 0.32
138 0.28
139 0.31
140 0.32
141 0.29
142 0.28
143 0.25
144 0.23
145 0.2
146 0.2
147 0.16
148 0.15
149 0.14
150 0.12
151 0.13
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.11
156 0.12
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.1
161 0.13
162 0.14
163 0.2
164 0.2
165 0.22
166 0.23
167 0.22
168 0.22
169 0.19
170 0.17
171 0.13
172 0.12
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.14
178 0.15
179 0.17
180 0.23
181 0.28
182 0.34
183 0.39
184 0.39
185 0.4
186 0.43
187 0.42
188 0.46
189 0.46
190 0.43
191 0.41
192 0.43
193 0.38
194 0.36
195 0.33
196 0.23
197 0.18
198 0.15
199 0.15
200 0.13
201 0.17
202 0.16
203 0.17
204 0.25
205 0.24
206 0.27
207 0.3
208 0.33
209 0.31
210 0.4
211 0.48
212 0.45
213 0.51
214 0.54
215 0.58
216 0.58
217 0.64
218 0.65
219 0.64
220 0.65
221 0.61
222 0.56
223 0.49
224 0.45
225 0.38
226 0.29
227 0.23
228 0.17
229 0.16
230 0.13
231 0.1
232 0.09
233 0.07
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.06
245 0.08
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.06
259 0.07
260 0.09
261 0.12
262 0.16
263 0.19
264 0.21
265 0.22
266 0.22
267 0.22
268 0.21
269 0.18
270 0.15
271 0.14
272 0.16
273 0.16
274 0.16
275 0.15
276 0.14
277 0.15
278 0.15
279 0.14
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.12
301 0.13
302 0.14
303 0.15
304 0.15
305 0.15
306 0.15
307 0.15
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.13
316 0.14
317 0.17
318 0.16
319 0.15
320 0.19
321 0.18
322 0.17
323 0.17
324 0.14
325 0.1
326 0.09
327 0.09
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.1
342 0.09
343 0.1
344 0.09
345 0.09
346 0.08
347 0.09
348 0.08
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.07
354 0.08
355 0.13
356 0.14
357 0.15
358 0.15
359 0.15
360 0.14
361 0.14
362 0.15
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.16
368 0.16
369 0.15
370 0.14
371 0.13
372 0.14
373 0.13
374 0.13
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.04
381 0.04
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.06
391 0.07
392 0.08
393 0.1
394 0.1
395 0.11
396 0.14
397 0.19
398 0.17
399 0.18
400 0.18
401 0.2
402 0.2
403 0.21
404 0.23
405 0.19
406 0.25
407 0.27
408 0.28
409 0.27
410 0.28
411 0.28
412 0.29
413 0.31
414 0.24
415 0.21
416 0.2
417 0.18
418 0.16
419 0.15
420 0.11
421 0.1
422 0.1
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.1
427 0.11
428 0.12
429 0.16
430 0.2
431 0.25
432 0.28
433 0.29
434 0.29
435 0.27
436 0.27
437 0.23
438 0.2
439 0.15
440 0.13
441 0.13
442 0.13
443 0.12
444 0.1
445 0.1
446 0.13
447 0.13
448 0.13
449 0.11
450 0.12
451 0.14
452 0.16
453 0.16
454 0.15
455 0.15
456 0.17
457 0.17
458 0.17
459 0.16
460 0.15
461 0.13
462 0.11
463 0.11
464 0.1
465 0.14
466 0.16
467 0.18
468 0.2
469 0.22
470 0.24
471 0.25
472 0.23
473 0.21
474 0.22
475 0.21
476 0.21
477 0.2
478 0.18
479 0.18
480 0.19
481 0.23
482 0.2
483 0.22
484 0.22
485 0.25
486 0.29
487 0.3
488 0.31
489 0.27
490 0.3
491 0.3
492 0.3
493 0.34
494 0.31
495 0.31
496 0.3
497 0.29
498 0.27
499 0.29
500 0.27
501 0.19
502 0.19
503 0.17
504 0.17
505 0.17
506 0.22
507 0.2
508 0.25
509 0.29
510 0.35
511 0.38
512 0.39
513 0.42
514 0.38
515 0.46
516 0.5
517 0.54
518 0.55
519 0.55
520 0.62
521 0.6
522 0.61
523 0.51
524 0.47
525 0.39
526 0.36
527 0.4
528 0.36
529 0.38
530 0.35
531 0.36
532 0.32
533 0.31
534 0.29
535 0.28
536 0.25
537 0.21
538 0.23
539 0.21
540 0.21
541 0.23
542 0.3
543 0.26
544 0.27
545 0.33
546 0.37
547 0.47
548 0.53
549 0.57
550 0.57
551 0.62
552 0.68
553 0.7
554 0.7
555 0.65
556 0.67
557 0.64
558 0.56
559 0.51
560 0.44
561 0.35
562 0.28
563 0.22
564 0.13