Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7MKM8

Protein Details
Accession W7MKM8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-121AADERKARGRSRFRSKRSRGDAMGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
72-74RPK
95-119SERAADERKARGRSRFRSKRSRGDA
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 7.5, cyto_nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
KEGG fvr:FVEG_08028  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MNRGRAAARGSRRGAAAASSRAAGENNATTSTPDVTDTPGSATPVPQSIAITSTRGGTTTRATRAPAAGRFRPKNIRRDEAERDSLARQEEQKASERAADERKARGRSRFRSKRSRGDAMGRGGFGRVISGASGPFSSGAAGSGGRGSGGWFGGGGGGGGGFGGGGGRGFKSDSKPGFAQASRSREARINADKLHVHTPEEDLDSEDEAMIEALNSRAVSVLPMGIYRREHKDEGVIVATTAELEAAENAQAIPSTPLKEEESLWVDGDADEPLLMDENAEDGGIWENDSKTPVIKKEPGLDDSMDLDIETKADAGDKDKQPSETPAPQTKKPKQDPEEAMIQTDLEILAHELGAVEISEGEEGKTEGPSNKDGRMYLFQFPPVLPPLKPITRPSSINKVKPEPGQGEDNVLESTPAAADTEPVDLINDKNIAGTNVPGFEDLERKAGFMSSLLSTGGMVGQLKVRKSGRVELDWGGSTMELNPATGMNFLTTAVIIEENDEKPRPGVIGGESIGMGKIMGRFVLAPKWDDEEDWEVSSEDLRIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.37
3 0.34
4 0.29
5 0.27
6 0.25
7 0.24
8 0.24
9 0.23
10 0.19
11 0.17
12 0.17
13 0.17
14 0.18
15 0.18
16 0.18
17 0.19
18 0.2
19 0.17
20 0.16
21 0.15
22 0.17
23 0.18
24 0.18
25 0.19
26 0.19
27 0.21
28 0.2
29 0.2
30 0.19
31 0.2
32 0.2
33 0.17
34 0.17
35 0.15
36 0.16
37 0.17
38 0.16
39 0.14
40 0.16
41 0.15
42 0.15
43 0.15
44 0.15
45 0.2
46 0.26
47 0.3
48 0.3
49 0.32
50 0.34
51 0.38
52 0.42
53 0.42
54 0.43
55 0.47
56 0.55
57 0.57
58 0.61
59 0.67
60 0.68
61 0.7
62 0.71
63 0.71
64 0.67
65 0.71
66 0.73
67 0.7
68 0.68
69 0.6
70 0.55
71 0.48
72 0.45
73 0.4
74 0.34
75 0.29
76 0.3
77 0.32
78 0.33
79 0.37
80 0.36
81 0.35
82 0.35
83 0.34
84 0.33
85 0.35
86 0.38
87 0.35
88 0.42
89 0.47
90 0.51
91 0.54
92 0.59
93 0.63
94 0.66
95 0.74
96 0.77
97 0.79
98 0.83
99 0.86
100 0.87
101 0.85
102 0.83
103 0.77
104 0.75
105 0.73
106 0.68
107 0.62
108 0.51
109 0.43
110 0.36
111 0.3
112 0.21
113 0.15
114 0.09
115 0.07
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.02
147 0.02
148 0.02
149 0.02
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.05
157 0.08
158 0.12
159 0.19
160 0.21
161 0.25
162 0.26
163 0.28
164 0.32
165 0.3
166 0.34
167 0.34
168 0.38
169 0.36
170 0.36
171 0.36
172 0.35
173 0.36
174 0.36
175 0.36
176 0.35
177 0.33
178 0.36
179 0.36
180 0.35
181 0.37
182 0.3
183 0.25
184 0.22
185 0.22
186 0.2
187 0.2
188 0.17
189 0.14
190 0.14
191 0.13
192 0.12
193 0.1
194 0.08
195 0.06
196 0.06
197 0.04
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.07
212 0.09
213 0.11
214 0.14
215 0.19
216 0.22
217 0.23
218 0.23
219 0.25
220 0.24
221 0.23
222 0.21
223 0.16
224 0.12
225 0.11
226 0.1
227 0.07
228 0.06
229 0.04
230 0.02
231 0.02
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.04
240 0.05
241 0.06
242 0.08
243 0.08
244 0.1
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.14
249 0.16
250 0.15
251 0.15
252 0.13
253 0.12
254 0.11
255 0.11
256 0.08
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.03
261 0.04
262 0.04
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.08
277 0.07
278 0.08
279 0.1
280 0.13
281 0.17
282 0.2
283 0.22
284 0.27
285 0.3
286 0.3
287 0.29
288 0.27
289 0.23
290 0.21
291 0.19
292 0.13
293 0.1
294 0.09
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.05
302 0.08
303 0.16
304 0.18
305 0.21
306 0.23
307 0.24
308 0.25
309 0.29
310 0.32
311 0.31
312 0.34
313 0.4
314 0.43
315 0.47
316 0.56
317 0.59
318 0.63
319 0.65
320 0.69
321 0.65
322 0.7
323 0.69
324 0.62
325 0.63
326 0.52
327 0.45
328 0.35
329 0.3
330 0.21
331 0.16
332 0.13
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.07
354 0.1
355 0.12
356 0.17
357 0.19
358 0.22
359 0.23
360 0.23
361 0.25
362 0.29
363 0.29
364 0.29
365 0.28
366 0.27
367 0.26
368 0.26
369 0.25
370 0.23
371 0.22
372 0.17
373 0.19
374 0.24
375 0.27
376 0.3
377 0.32
378 0.35
379 0.37
380 0.41
381 0.43
382 0.48
383 0.51
384 0.54
385 0.56
386 0.55
387 0.56
388 0.55
389 0.56
390 0.49
391 0.45
392 0.43
393 0.37
394 0.36
395 0.31
396 0.29
397 0.22
398 0.18
399 0.15
400 0.1
401 0.1
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.06
407 0.07
408 0.08
409 0.07
410 0.07
411 0.08
412 0.08
413 0.09
414 0.11
415 0.11
416 0.09
417 0.1
418 0.11
419 0.11
420 0.11
421 0.12
422 0.11
423 0.11
424 0.12
425 0.11
426 0.12
427 0.12
428 0.15
429 0.14
430 0.18
431 0.17
432 0.17
433 0.17
434 0.16
435 0.15
436 0.12
437 0.13
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.12
449 0.15
450 0.16
451 0.23
452 0.24
453 0.28
454 0.32
455 0.39
456 0.41
457 0.42
458 0.45
459 0.41
460 0.43
461 0.39
462 0.35
463 0.27
464 0.2
465 0.17
466 0.13
467 0.15
468 0.11
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.11
473 0.11
474 0.11
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.08
479 0.08
480 0.07
481 0.08
482 0.08
483 0.07
484 0.09
485 0.13
486 0.14
487 0.18
488 0.19
489 0.19
490 0.19
491 0.21
492 0.19
493 0.16
494 0.17
495 0.15
496 0.19
497 0.18
498 0.19
499 0.18
500 0.17
501 0.16
502 0.13
503 0.11
504 0.08
505 0.09
506 0.08
507 0.08
508 0.09
509 0.1
510 0.13
511 0.19
512 0.2
513 0.2
514 0.22
515 0.27
516 0.27
517 0.26
518 0.29
519 0.28
520 0.28
521 0.27
522 0.26
523 0.21
524 0.21
525 0.21