FuNGI

W7LC40

Protein Details

Accession

W7LC40

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
129-155	IDATEDKSNKERKRKRKNENDDLEGKY	Basic
422-441	FPPMLPRKLRVTRAKDPRKT	Hydrophilic
484-503	GRSAAVQQRHKKRPSTQGAS	Hydrophilic
533-560	PKDLKLGKKGKGKGRSGRPQNRGARRAA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
138-145	KERKRKRK
426-457	LPRKLRVTRAKDPRKTALAQERARGKNIVPNG
460-460	K
528-566	SKDGIPKDLKLGKKGKGKGRSGRPQNRGARRAAEWKKKS

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 7.5, cyto_mito 6, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	fvr:FVEG_00856 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MAKRSKSLTASSKAVDPTLDALFASSAGPVQAPVKSRYSTLVEQKVREPSKPRVQLEEQDADDEVLSEISEELSFEEDGPSDEEEEASDASEPEGESEDEQEEEEEEEEEEESSNEPMKDAPVELDDIIDATEDKSNKERKRKRKNENDDLEGKYLDKLVAEEEAERAGKRQKNDALNKTEKAVAEDDDAGNDSDIPVHETLAKDNKSSDLEKAARTVFLANVSTEAINSKTAKKALMAHLSSILDKDATPPQTIESLRFRSVAFSGGSLPKRAAYITKSLMDATTKSANAYVVYSTSAAARKAAAELNGTQVLERHLRVDSVAHPSPTDHRRCVFVGNLGFVDDETVLNTNADGNTTEKKKNKTPSDVEEGLWRTFSTQGKVENVRVVRDSKTRVGKGFAYVQFYDGNDVEAALLLDGKKFPPMLPRKLRVTRAKDPRKTALAQERARGKNIVPNGAAKSTKYKHKATPEEQSMAGRTSKLLGRSAAVQQRHKKRPSTQGASEDAQNIPSSIKGPEQFVFEGRRASSKDGIPKDLKLGKKGKGKGRSGRPQNRGARRAAEWKKKS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.34
3	0.27
4	0.24
5	0.2
6	0.19
7	0.13
8	0.12
9	0.12
10	0.12
11	0.1
12	0.07
13	0.07
14	0.07
15	0.07
16	0.07
17	0.09
18	0.12
19	0.16
20	0.2
21	0.24
22	0.25
23	0.26
24	0.3
25	0.35
26	0.38
27	0.44
28	0.5
29	0.51
30	0.52
31	0.56
32	0.62
33	0.58
34	0.57
35	0.54
36	0.54
37	0.6
38	0.66
39	0.64
40	0.62
41	0.65
42	0.66
43	0.67
44	0.64
45	0.54
46	0.46
47	0.43
48	0.35
49	0.29
50	0.22
51	0.15
52	0.08
53	0.07
54	0.06
55	0.06
56	0.06
57	0.06
58	0.05
59	0.06
60	0.08
61	0.08
62	0.08
63	0.09
64	0.08
65	0.1
66	0.12
67	0.12
68	0.11
69	0.11
70	0.11
71	0.1
72	0.11
73	0.1
74	0.09
75	0.09
76	0.07
77	0.07
78	0.09
79	0.08
80	0.08
81	0.1
82	0.1
83	0.1
84	0.11
85	0.12
86	0.11
87	0.12
88	0.11
89	0.1
90	0.1
91	0.1
92	0.08
93	0.08
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.08
98	0.07
99	0.08
100	0.08
101	0.11
102	0.11
103	0.1
104	0.11
105	0.12
106	0.12
107	0.12
108	0.12
109	0.1
110	0.12
111	0.12
112	0.11
113	0.1
114	0.09
115	0.08
116	0.07
117	0.06
118	0.06
119	0.09
120	0.1
121	0.12
122	0.19
123	0.28
124	0.35
125	0.47
126	0.56
127	0.63
128	0.75
129	0.83
130	0.87
131	0.9
132	0.93
133	0.93
134	0.91
135	0.87
136	0.82
137	0.74
138	0.65
139	0.54
140	0.44
141	0.33
142	0.26
143	0.19
144	0.12
145	0.09
146	0.08
147	0.09
148	0.09
149	0.09
150	0.09
151	0.1
152	0.11
153	0.1
154	0.12
155	0.18
156	0.21
157	0.23
158	0.3
159	0.35
160	0.44
161	0.53
162	0.59
163	0.61
164	0.63
165	0.62
166	0.56
167	0.52
168	0.42
169	0.36
170	0.29
171	0.21
172	0.18
173	0.19
174	0.17
175	0.14
176	0.15
177	0.12
178	0.1
179	0.09
180	0.07
181	0.06
182	0.06
183	0.08
184	0.07
185	0.07
186	0.09
187	0.1
188	0.13
189	0.2
190	0.2
191	0.18
192	0.19
193	0.21
194	0.22
195	0.23
196	0.22
197	0.22
198	0.23
199	0.23
200	0.25
201	0.23
202	0.2
203	0.2
204	0.19
205	0.12
206	0.12
207	0.12
208	0.09
209	0.1
210	0.1
211	0.09
212	0.08
213	0.09
214	0.08
215	0.09
216	0.11
217	0.12
218	0.14
219	0.15
220	0.16
221	0.17
222	0.21
223	0.24
224	0.3
225	0.29
226	0.27
227	0.28
228	0.28
229	0.27
230	0.22
231	0.16
232	0.09
233	0.08
234	0.1
235	0.12
236	0.13
237	0.14
238	0.13
239	0.14
240	0.18
241	0.19
242	0.2
243	0.2
244	0.22
245	0.23
246	0.24
247	0.23
248	0.2
249	0.2
250	0.19
251	0.14
252	0.11
253	0.12
254	0.16
255	0.17
256	0.16
257	0.16
258	0.14
259	0.14
260	0.14
261	0.13
262	0.1
263	0.14
264	0.16
265	0.17
266	0.17
267	0.17
268	0.17
269	0.16
270	0.14
271	0.13
272	0.13
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.11
277	0.11
278	0.11
279	0.08
280	0.06
281	0.07
282	0.07
283	0.06
284	0.08
285	0.09
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.09
291	0.1
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.11
296	0.12
297	0.12
298	0.1
299	0.1
300	0.12
301	0.12
302	0.12
303	0.11
304	0.1
305	0.1
306	0.1
307	0.11
308	0.12
309	0.17
310	0.18
311	0.17
312	0.17
313	0.18
314	0.24
315	0.29
316	0.31
317	0.27
318	0.27
319	0.3
320	0.31
321	0.32
322	0.27
323	0.25
324	0.22
325	0.2
326	0.19
327	0.16
328	0.15
329	0.13
330	0.12
331	0.07
332	0.06
333	0.05
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.07
342	0.08
343	0.13
344	0.17
345	0.24
346	0.28
347	0.33
348	0.4
349	0.48
350	0.54
351	0.58
352	0.6
353	0.6
354	0.63
355	0.6
356	0.53
357	0.5
358	0.45
359	0.36
360	0.3
361	0.24
362	0.17
363	0.2
364	0.21
365	0.18
366	0.18
367	0.2
368	0.25
369	0.28
370	0.29
371	0.3
372	0.29
373	0.28
374	0.27
375	0.27
376	0.25
377	0.27
378	0.3
379	0.32
380	0.39
381	0.4
382	0.39
383	0.4
384	0.38
385	0.37
386	0.41
387	0.36
388	0.33
389	0.3
390	0.3
391	0.28
392	0.27
393	0.26
394	0.18
395	0.17
396	0.11
397	0.11
398	0.09
399	0.08
400	0.08
401	0.05
402	0.06
403	0.05
404	0.06
405	0.07
406	0.07
407	0.08
408	0.09
409	0.1
410	0.19
411	0.27
412	0.37
413	0.45
414	0.51
415	0.59
416	0.66
417	0.74
418	0.74
419	0.74
420	0.74
421	0.76
422	0.81
423	0.79
424	0.78
425	0.76
426	0.72
427	0.66
428	0.64
429	0.63
430	0.62
431	0.58
432	0.58
433	0.61
434	0.57
435	0.58
436	0.51
437	0.41
438	0.38
439	0.39
440	0.38
441	0.3
442	0.31
443	0.32
444	0.35
445	0.35
446	0.3
447	0.35
448	0.34
449	0.43
450	0.45
451	0.48
452	0.51
453	0.61
454	0.69
455	0.66
456	0.72
457	0.69
458	0.66
459	0.61
460	0.55
461	0.47
462	0.39
463	0.34
464	0.24
465	0.18
466	0.18
467	0.2
468	0.2
469	0.21
470	0.2
471	0.2
472	0.24
473	0.31
474	0.35
475	0.38
476	0.45
477	0.52
478	0.61
479	0.69
480	0.72
481	0.73
482	0.74
483	0.79
484	0.8
485	0.8
486	0.76
487	0.73
488	0.72
489	0.67
490	0.6
491	0.52
492	0.42
493	0.34
494	0.27
495	0.2
496	0.15
497	0.14
498	0.13
499	0.12
500	0.17
501	0.18
502	0.21
503	0.23
504	0.27
505	0.27
506	0.3
507	0.33
508	0.29
509	0.31
510	0.29
511	0.33
512	0.31
513	0.35
514	0.37
515	0.38
516	0.46
517	0.46
518	0.53
519	0.51
520	0.49
521	0.53
522	0.54
523	0.53
524	0.52
525	0.55
526	0.55
527	0.61
528	0.68
529	0.69
530	0.72
531	0.77
532	0.78
533	0.82
534	0.84
535	0.86
536	0.88
537	0.86
538	0.86
539	0.87
540	0.87
541	0.82
542	0.77
543	0.72
544	0.67
545	0.71
546	0.71

W7LC40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer