FuNGI

Q5AGX1

Protein Details

Accession

Q5AGX1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
34-55	NSSDQPRKRRTMTQAPSRNGRE	Hydrophilic
831-850	IEDCKSKKVKHETIREKFVK	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0035861 C:site of double-strand break GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0003684 F:damaged DNA binding GO:0003697 F:single-stranded DNA binding GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
KEGG	cal:CAALFM_C701580WA -
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MTVPYKRKHDADSLFDARNGGEGVSEYMSQLLINSSDQPRKRRTMTQAPSRNGRESASETESISGADSDSDGESDDDEDDEDDDDDDEEEDDDDDVGSDPAKAGVIEKLTLKNFMCHDSFELKLGPQLNFIIGRNGSGKSAILTGISVGLGAKATDTNRGSTIRDLIKDGKSTSRITVVLKNEGSDAYKPDVFGKKIIIERKLQRSGSNTYSIKNEAGKVVSNKKSVLDEILYKFSITIDNPLAFLSQDKAREFLTSSSDKNKYEYFMDGAFITDILENYTSISNNVQVLDNKVRQAEEYTKVAKQEYKAIAKVHNAHRTNDALRNKLEMLNAKIYWFNVQTIEKKIDQENRQKDTCLQEIEQAKNQIDVCEKEIEAKIPRKDAADQQVKEVESQIKDIVEEFEGLRSKRSEMKSELEINKKETKKNIDEMNSLKEDITRTETKIEQERRRIQELQGGNKEKMAEELEKLNSEIDELESQLENLKKQLVEMQDNPDPELRSVSQQREKSRQKIADLQNQKRQLEKESVSKYSPWGSRMAELIKAIKRHPDWVQEPIGPIGSYIHVKNQYNNWKPLLSTILNKTLDSFIVTNEGDRSRLDRLLKQYQIRSNIIVKKTERLNYASGKADSAFTTVLDMLNVENDTILYALIDINSIEKNVIVESASEARDSCRRRNVQNSLVLFRKDSGHRMSYQNNTFRQDPIYYQNGMAKFGVANMSDLISDLQRELDEEHRHQNDLERRARSIKMKLDAKRDNLVSESRAIKRNLDQLKRNRSTLEDQLEVEVDYSNITTLEARIEDNNEQIRRLVALNEALLENLSQMNENYKDLKQQIEDCKSKKVKHETIREKFVKQLVEIETEIETQEDLKKRYLYKITELEDRIKRADDILAEGNRKLEEFVAKAEEHCSRDRVTIYPNDTQETIAQDYQETRFDLERAESALGTSLEEVLDQLEKAKAKCDKAEGELESLSSASRKLNAEVNARFNFLHTIIQSSIQEAKRTFEKAMWLRGFQGTLKFDFAEKTLQLNVQTGNDEKKRTVESLSGGEKSFSQIALLLSIWKVMNSRIRGLDEFDVYMDSVNRSISIKLLLKELKRYPKSQNIFITPQDIAVVGELNDKGVKIHKMSAPREE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.52
3	0.47
4	0.37
5	0.32
6	0.25
7	0.16
8	0.11
9	0.1
10	0.12
11	0.13
12	0.13
13	0.11
14	0.11
15	0.12
16	0.11
17	0.1
18	0.09
19	0.09
20	0.1
21	0.16
22	0.22
23	0.31
24	0.37
25	0.44
26	0.5
27	0.57
28	0.62
29	0.65
30	0.68
31	0.71
32	0.75
33	0.79
34	0.81
35	0.79
36	0.83
37	0.79
38	0.74
39	0.64
40	0.55
41	0.5
42	0.45
43	0.45
44	0.41
45	0.37
46	0.33
47	0.32
48	0.31
49	0.25
50	0.21
51	0.15
52	0.1
53	0.08
54	0.08
55	0.08
56	0.08
57	0.08
58	0.08
59	0.08
60	0.09
61	0.09
62	0.1
63	0.09
64	0.09
65	0.09
66	0.09
67	0.09
68	0.09
69	0.09
70	0.09
71	0.09
72	0.09
73	0.08
74	0.08
75	0.08
76	0.08
77	0.08
78	0.08
79	0.07
80	0.07
81	0.07
82	0.07
83	0.07
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.07
88	0.07
89	0.07
90	0.07
91	0.11
92	0.12
93	0.14
94	0.17
95	0.22
96	0.23
97	0.28
98	0.28
99	0.29
100	0.29
101	0.32
102	0.3
103	0.27
104	0.3
105	0.29
106	0.29
107	0.27
108	0.26
109	0.22
110	0.24
111	0.26
112	0.22
113	0.2
114	0.2
115	0.2
116	0.21
117	0.22
118	0.23
119	0.2
120	0.21
121	0.21
122	0.21
123	0.19
124	0.18
125	0.18
126	0.13
127	0.14
128	0.12
129	0.1
130	0.09
131	0.09
132	0.08
133	0.08
134	0.07
135	0.06
136	0.06
137	0.06
138	0.05
139	0.06
140	0.08
141	0.09
142	0.16
143	0.17
144	0.19
145	0.22
146	0.24
147	0.25
148	0.25
149	0.32
150	0.29
151	0.29
152	0.31
153	0.34
154	0.36
155	0.38
156	0.37
157	0.37
158	0.36
159	0.36
160	0.34
161	0.33
162	0.31
163	0.31
164	0.36
165	0.33
166	0.37
167	0.35
168	0.34
169	0.3
170	0.29
171	0.29
172	0.24
173	0.23
174	0.2
175	0.21
176	0.21
177	0.26
178	0.31
179	0.3
180	0.3
181	0.3
182	0.31
183	0.36
184	0.41
185	0.39
186	0.41
187	0.48
188	0.55
189	0.6
190	0.56
191	0.54
192	0.53
193	0.55
194	0.51
195	0.52
196	0.43
197	0.37
198	0.39
199	0.38
200	0.35
201	0.32
202	0.29
203	0.22
204	0.23
205	0.26
206	0.29
207	0.36
208	0.39
209	0.39
210	0.38
211	0.37
212	0.38
213	0.34
214	0.32
215	0.25
216	0.25
217	0.26
218	0.29
219	0.27
220	0.25
221	0.24
222	0.21
223	0.21
224	0.16
225	0.17
226	0.16
227	0.17
228	0.17
229	0.17
230	0.17
231	0.14
232	0.14
233	0.13
234	0.13
235	0.17
236	0.17
237	0.18
238	0.19
239	0.2
240	0.21
241	0.2
242	0.22
243	0.21
244	0.23
245	0.3
246	0.34
247	0.34
248	0.35
249	0.34
250	0.31
251	0.29
252	0.29
253	0.24
254	0.2
255	0.2
256	0.17
257	0.16
258	0.13
259	0.11
260	0.1
261	0.08
262	0.07
263	0.07
264	0.08
265	0.07
266	0.08
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.1
271	0.11
272	0.11
273	0.12
274	0.13
275	0.13
276	0.19
277	0.25
278	0.26
279	0.26
280	0.26
281	0.25
282	0.24
283	0.27
284	0.27
285	0.24
286	0.26
287	0.28
288	0.29
289	0.3
290	0.31
291	0.3
292	0.26
293	0.31
294	0.33
295	0.34
296	0.36
297	0.37
298	0.39
299	0.41
300	0.47
301	0.47
302	0.5
303	0.47
304	0.45
305	0.46
306	0.47
307	0.46
308	0.46
309	0.43
310	0.37
311	0.35
312	0.37
313	0.34
314	0.32
315	0.31
316	0.28
317	0.27
318	0.28
319	0.28
320	0.26
321	0.25
322	0.23
323	0.24
324	0.2
325	0.17
326	0.15
327	0.19
328	0.21
329	0.25
330	0.28
331	0.26
332	0.28
333	0.32
334	0.37
335	0.42
336	0.49
337	0.53
338	0.55
339	0.55
340	0.53
341	0.52
342	0.49
343	0.45
344	0.38
345	0.3
346	0.3
347	0.35
348	0.37
349	0.37
350	0.35
351	0.31
352	0.3
353	0.3
354	0.26
355	0.23
356	0.22
357	0.2
358	0.19
359	0.19
360	0.19
361	0.2
362	0.21
363	0.24
364	0.3
365	0.3
366	0.3
367	0.31
368	0.3
369	0.32
370	0.35
371	0.39
372	0.41
373	0.39
374	0.39
375	0.42
376	0.4
377	0.38
378	0.34
379	0.28
380	0.19
381	0.2
382	0.19
383	0.15
384	0.14
385	0.15
386	0.13
387	0.09
388	0.1
389	0.08
390	0.11
391	0.14
392	0.14
393	0.15
394	0.15
395	0.16
396	0.23
397	0.25
398	0.27
399	0.28
400	0.32
401	0.35
402	0.42
403	0.46
404	0.46
405	0.45
406	0.44
407	0.49
408	0.49
409	0.47
410	0.45
411	0.46
412	0.44
413	0.48
414	0.5
415	0.46
416	0.47
417	0.46
418	0.45
419	0.38
420	0.34
421	0.28
422	0.23
423	0.2
424	0.17
425	0.2
426	0.17
427	0.17
428	0.2
429	0.21
430	0.23
431	0.31
432	0.39
433	0.39
434	0.47
435	0.54
436	0.56
437	0.6
438	0.59
439	0.51
440	0.49
441	0.47
442	0.46
443	0.46
444	0.45
445	0.4
446	0.39
447	0.38
448	0.3
449	0.27
450	0.22
451	0.15
452	0.13
453	0.16
454	0.16
455	0.16
456	0.16
457	0.14
458	0.11
459	0.11
460	0.09
461	0.07
462	0.07
463	0.06
464	0.08
465	0.07
466	0.07
467	0.1
468	0.11
469	0.1
470	0.1
471	0.12
472	0.1
473	0.1
474	0.15
475	0.15
476	0.19
477	0.21
478	0.25
479	0.26
480	0.26
481	0.27
482	0.25
483	0.22
484	0.18
485	0.18
486	0.14
487	0.16
488	0.21
489	0.26
490	0.31
491	0.35
492	0.4
493	0.48
494	0.53
495	0.54
496	0.57
497	0.54
498	0.51
499	0.55
500	0.57
501	0.56
502	0.6
503	0.6
504	0.59
505	0.62
506	0.59
507	0.53
508	0.47
509	0.41
510	0.38
511	0.34
512	0.35
513	0.33
514	0.35
515	0.33
516	0.32
517	0.3
518	0.3
519	0.29
520	0.22
521	0.22
522	0.2
523	0.2
524	0.22
525	0.21
526	0.16
527	0.15
528	0.18
529	0.17
530	0.18
531	0.18
532	0.21
533	0.21
534	0.24
535	0.26
536	0.28
537	0.28
538	0.31
539	0.33
540	0.28
541	0.28
542	0.25
543	0.23
544	0.15
545	0.13
546	0.09
547	0.07
548	0.08
549	0.07
550	0.11
551	0.15
552	0.15
553	0.18
554	0.24
555	0.33
556	0.37
557	0.4
558	0.37
559	0.33
560	0.33
561	0.32
562	0.3
563	0.21
564	0.19
565	0.19
566	0.25
567	0.25
568	0.25
569	0.24
570	0.2
571	0.19
572	0.17
573	0.15
574	0.07
575	0.1
576	0.1
577	0.09
578	0.11
579	0.11
580	0.1
581	0.1
582	0.12
583	0.11
584	0.15
585	0.17
586	0.19
587	0.25
588	0.32
589	0.36
590	0.38
591	0.41
592	0.42
593	0.45
594	0.42
595	0.38
596	0.37
597	0.38
598	0.36
599	0.36
600	0.33
601	0.32
602	0.35
603	0.36
604	0.32
605	0.29
606	0.31
607	0.29
608	0.32
609	0.3
610	0.26
611	0.23
612	0.21
613	0.19
614	0.15
615	0.13
616	0.1
617	0.07
618	0.08
619	0.07
620	0.07
621	0.06
622	0.06
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.04
627	0.04
628	0.04
629	0.04
630	0.04
631	0.04
632	0.03
633	0.03
634	0.03
635	0.03
636	0.03
637	0.03
638	0.04
639	0.05
640	0.05
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.05
645	0.05
646	0.04
647	0.04
648	0.06
649	0.09
650	0.09
651	0.09
652	0.09
653	0.11
654	0.17
655	0.2
656	0.23
657	0.3
658	0.34
659	0.39
660	0.48
661	0.53
662	0.54
663	0.57
664	0.55
665	0.5
666	0.49
667	0.44
668	0.36
669	0.29
670	0.27
671	0.22
672	0.23
673	0.23
674	0.23
675	0.26
676	0.29
677	0.33
678	0.36
679	0.42
680	0.44
681	0.43
682	0.44
683	0.42
684	0.39
685	0.36
686	0.3
687	0.26
688	0.25
689	0.25
690	0.22
691	0.22
692	0.25
693	0.23
694	0.23
695	0.2
696	0.16
697	0.12
698	0.12
699	0.13
700	0.09
701	0.09
702	0.08
703	0.08
704	0.07
705	0.08
706	0.08
707	0.06
708	0.06
709	0.06
710	0.06
711	0.05
712	0.06
713	0.08
714	0.13
715	0.18
716	0.2
717	0.27
718	0.28
719	0.29
720	0.29
721	0.34
722	0.36
723	0.4
724	0.44
725	0.38
726	0.4
727	0.43
728	0.46
729	0.44
730	0.43
731	0.41
732	0.43
733	0.49
734	0.52
735	0.58
736	0.6
737	0.58
738	0.57
739	0.51
740	0.44
741	0.39
742	0.35
743	0.27
744	0.25
745	0.26
746	0.25
747	0.3
748	0.29
749	0.3
750	0.32
751	0.39
752	0.43
753	0.45
754	0.5
755	0.54
756	0.64
757	0.65
758	0.63
759	0.55
760	0.51
761	0.49
762	0.48
763	0.44
764	0.35
765	0.31
766	0.31
767	0.3
768	0.25
769	0.21
770	0.13
771	0.08
772	0.06
773	0.06
774	0.05
775	0.05
776	0.05
777	0.05
778	0.05
779	0.07
780	0.07
781	0.08
782	0.09
783	0.12
784	0.13
785	0.17
786	0.23
787	0.22
788	0.22
789	0.21
790	0.21
791	0.19
792	0.19
793	0.15
794	0.11
795	0.12
796	0.11
797	0.12
798	0.12
799	0.1
800	0.09
801	0.08
802	0.07
803	0.06
804	0.06
805	0.06
806	0.06
807	0.11
808	0.12
809	0.14
810	0.16
811	0.16
812	0.22
813	0.23
814	0.25
815	0.24
816	0.3
817	0.37
818	0.43
819	0.49
820	0.46
821	0.54
822	0.58
823	0.59
824	0.61
825	0.62
826	0.63
827	0.66
828	0.75
829	0.76
830	0.77
831	0.83
832	0.78
833	0.69
834	0.64
835	0.59
836	0.51
837	0.4
838	0.38
839	0.3
840	0.3
841	0.28
842	0.25
843	0.21
844	0.19
845	0.19
846	0.13
847	0.1
848	0.08
849	0.14
850	0.17
851	0.19
852	0.22
853	0.26
854	0.28
855	0.35
856	0.41
857	0.4
858	0.42
859	0.48
860	0.48
861	0.51
862	0.51
863	0.52
864	0.49
865	0.48
866	0.42
867	0.36
868	0.33
869	0.27
870	0.27
871	0.19
872	0.19
873	0.22
874	0.25
875	0.25
876	0.25
877	0.25
878	0.23
879	0.22
880	0.19
881	0.15
882	0.14
883	0.13
884	0.15
885	0.18
886	0.18
887	0.18
888	0.22
889	0.24
890	0.25
891	0.26
892	0.26
893	0.24
894	0.27
895	0.28
896	0.27
897	0.27
898	0.31
899	0.34
900	0.38
901	0.38
902	0.37
903	0.35
904	0.34
905	0.31
906	0.27
907	0.26
908	0.2
909	0.19
910	0.18
911	0.2
912	0.21
913	0.21
914	0.18
915	0.17
916	0.17
917	0.17
918	0.18
919	0.17
920	0.17
921	0.16
922	0.16
923	0.14
924	0.13
925	0.15
926	0.13
927	0.12
928	0.11
929	0.09
930	0.08
931	0.08
932	0.08
933	0.06
934	0.07
935	0.06
936	0.08
937	0.11
938	0.14
939	0.15
940	0.22
941	0.27
942	0.3
943	0.34
944	0.38
945	0.38
946	0.4
947	0.46
948	0.41
949	0.38
950	0.35
951	0.31
952	0.25
953	0.21
954	0.17
955	0.11
956	0.11
957	0.09
958	0.13
959	0.14
960	0.16
961	0.23
962	0.28
963	0.36
964	0.39
965	0.46
966	0.42
967	0.43
968	0.4
969	0.35
970	0.33
971	0.26
972	0.25
973	0.18
974	0.21
975	0.2
976	0.23
977	0.22
978	0.22
979	0.28
980	0.26
981	0.3
982	0.27
983	0.3
984	0.31
985	0.34
986	0.33
987	0.27
988	0.35
989	0.36
990	0.45
991	0.45
992	0.41
993	0.41
994	0.42
995	0.41
996	0.34
997	0.35
998	0.28
999	0.27
1000	0.28
1001	0.25
1002	0.24
1003	0.24
1004	0.23
1005	0.22
1006	0.2
1007	0.2
1008	0.21
1009	0.23
1010	0.23
1011	0.24
1012	0.24
1013	0.21
1014	0.23
1015	0.23
1016	0.29
1017	0.31
1018	0.33
1019	0.31
1020	0.34
1021	0.36
1022	0.35
1023	0.35
1024	0.31
1025	0.3
1026	0.35
1027	0.38
1028	0.36
1029	0.33
1030	0.32
1031	0.29
1032	0.28
1033	0.26
1034	0.18
1035	0.14
1036	0.14
1037	0.14
1038	0.15
1039	0.15
1040	0.13
1041	0.12
1042	0.14
1043	0.14
1044	0.13
1045	0.13
1046	0.17
1047	0.25
1048	0.26
1049	0.31
1050	0.33
1051	0.37
1052	0.38
1053	0.41
1054	0.4
1055	0.34
1056	0.31
1057	0.27
1058	0.24
1059	0.19
1060	0.19
1061	0.16
1062	0.13
1063	0.12
1064	0.12
1065	0.12
1066	0.13
1067	0.13
1068	0.14
1069	0.2
1070	0.23
1071	0.23
1072	0.31
1073	0.36
1074	0.38
1075	0.46
1076	0.53
1077	0.57
1078	0.58
1079	0.62
1080	0.64
1081	0.68
1082	0.71
1083	0.71
1084	0.71
1085	0.68
1086	0.67
1087	0.64
1088	0.59
1089	0.48
1090	0.42
1091	0.34
1092	0.26
1093	0.18
1094	0.14
1095	0.13
1096	0.09
1097	0.13
1098	0.12
1099	0.13
1100	0.13
1101	0.13
1102	0.14
1103	0.18
1104	0.23
1105	0.22
1106	0.29
1107	0.32
1108	0.41

Q5AGX1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer