FuNGI

E3RT52

Protein Details

Accession

E3RT52

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
560-587	RSAPTKEAPSRAKRLRKARMPKDYEEGK	Basic
593-621	RWLPMRDRSYYRPKGRKGKKRAEGLTQGG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
560-614	RSAPTKEAPSRAKRLRKARMPKDYEEGKKVDPERWLPMRDRSYYRPKGRKGKKRA
633-652	QEKKAGVDKGKGKKKGKGKW

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto_nucl 11.333, cyto 9.5, mito_nucl 8.833, mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013699 Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd IPR026270 SRP72 IPR031545 SRP_TPR-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005783 C:endoplasmic reticulum GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
KEGG	pte:PTT_12159 -
Pfam	View protein in Pfam PF08492 SRP72 PF17004 SRP_TPR_like

Amino Acid Sequences

MAATAKSLSSLLAQASIEDHDEVLKAANAAIKKSKSDQDAQHTKAVALLHLDRYEDALTVFEATKELQAKARFEYAYALYKTGNATKAVEVVETAGPDSGRGMKHMLAQAAYRSENFAQATKIYKELADQNDEREEYDIRINSGAVDAQLEWTGQGELAQKKQPTREDLEVFETAFNAACGSISRNEFGQAHVCLKRAKDLCNALSDLSEEEKQAELLPITVQQVYVLIQLGKLDEAEELATKIPFADIKELSTRYIAQVNSIAASKKLSNPYLSHRLFHASPQPPITDQHFSYQSNILRQDEYVMSLLSQKVDGVASSTEKVIAASPAPSLSPAVNMAAVLNAAAHARNAETEKAALKEIVPLLEKRPNDVGLILTITHLYVITNNYAAATHLLESFFKRLEQSGSASDLDARFSPGLIATIVSLYAQQGRPGASKNELAKAADYWRKPHKSKTEAPSKSLMVAAGTALLDTHNLENVKSAGDIFKGLYDQDNDDRAAIAGLVAAYSITDPSSIPAELLSYLPEANRLVSDIDAVELEKVGVPLGTLTSVNLGAVSQKRSAPTKEAPSRAKRLRKARMPKDYEEGKKVDPERWLPMRDRSYYRPKGRKGKKRAEGLTQGGVVENEKGTPAAQEKKAGVDKGKGKKKGKGKW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.14
3	0.14
4	0.14
5	0.13
6	0.13
7	0.1
8	0.11
9	0.11
10	0.11
11	0.11
12	0.09
13	0.1
14	0.14
15	0.14
16	0.18
17	0.25
18	0.26
19	0.29
20	0.34
21	0.4
22	0.42
23	0.49
24	0.53
25	0.56
26	0.63
27	0.63
28	0.63
29	0.57
30	0.51
31	0.46
32	0.39
33	0.29
34	0.24
35	0.24
36	0.22
37	0.23
38	0.24
39	0.21
40	0.23
41	0.22
42	0.17
43	0.15
44	0.11
45	0.1
46	0.12
47	0.12
48	0.1
49	0.1
50	0.1
51	0.15
52	0.17
53	0.18
54	0.22
55	0.26
56	0.28
57	0.31
58	0.35
59	0.31
60	0.29
61	0.32
62	0.29
63	0.32
64	0.31
65	0.29
66	0.24
67	0.25
68	0.27
69	0.28
70	0.27
71	0.21
72	0.22
73	0.21
74	0.24
75	0.23
76	0.2
77	0.16
78	0.16
79	0.15
80	0.13
81	0.12
82	0.11
83	0.1
84	0.1
85	0.11
86	0.13
87	0.12
88	0.14
89	0.16
90	0.16
91	0.22
92	0.25
93	0.25
94	0.22
95	0.23
96	0.24
97	0.25
98	0.25
99	0.2
100	0.21
101	0.19
102	0.22
103	0.22
104	0.21
105	0.19
106	0.2
107	0.24
108	0.22
109	0.23
110	0.2
111	0.19
112	0.2
113	0.26
114	0.28
115	0.3
116	0.3
117	0.31
118	0.35
119	0.35
120	0.32
121	0.27
122	0.24
123	0.19
124	0.24
125	0.21
126	0.18
127	0.18
128	0.18
129	0.16
130	0.15
131	0.13
132	0.08
133	0.08
134	0.07
135	0.08
136	0.08
137	0.08
138	0.07
139	0.07
140	0.07
141	0.06
142	0.08
143	0.13
144	0.15
145	0.19
146	0.25
147	0.27
148	0.3
149	0.36
150	0.39
151	0.39
152	0.42
153	0.46
154	0.44
155	0.43
156	0.45
157	0.39
158	0.35
159	0.29
160	0.23
161	0.16
162	0.13
163	0.11
164	0.06
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.07
169	0.11
170	0.12
171	0.13
172	0.13
173	0.16
174	0.16
175	0.17
176	0.19
177	0.17
178	0.21
179	0.22
180	0.24
181	0.24
182	0.24
183	0.31
184	0.3
185	0.31
186	0.33
187	0.37
188	0.37
189	0.38
190	0.38
191	0.3
192	0.28
193	0.25
194	0.19
195	0.15
196	0.14
197	0.11
198	0.11
199	0.11
200	0.11
201	0.11
202	0.1
203	0.08
204	0.07
205	0.08
206	0.08
207	0.09
208	0.09
209	0.08
210	0.07
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.06
216	0.06
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.06
221	0.05
222	0.04
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.07
233	0.07
234	0.12
235	0.11
236	0.14
237	0.18
238	0.18
239	0.19
240	0.18
241	0.18
242	0.15
243	0.18
244	0.16
245	0.14
246	0.15
247	0.14
248	0.14
249	0.14
250	0.13
251	0.09
252	0.11
253	0.11
254	0.14
255	0.18
256	0.19
257	0.2
258	0.22
259	0.29
260	0.37
261	0.37
262	0.33
263	0.3
264	0.32
265	0.3
266	0.3
267	0.32
268	0.25
269	0.26
270	0.27
271	0.27
272	0.24
273	0.26
274	0.27
275	0.22
276	0.2
277	0.22
278	0.23
279	0.23
280	0.24
281	0.27
282	0.25
283	0.25
284	0.26
285	0.23
286	0.2
287	0.19
288	0.2
289	0.15
290	0.14
291	0.11
292	0.09
293	0.08
294	0.09
295	0.1
296	0.08
297	0.07
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.06
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.06
311	0.06
312	0.05
313	0.05
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.05
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.04
336	0.05
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.09
342	0.1
343	0.11
344	0.1
345	0.08
346	0.1
347	0.11
348	0.11
349	0.11
350	0.11
351	0.14
352	0.19
353	0.18
354	0.18
355	0.2
356	0.19
357	0.18
358	0.18
359	0.15
360	0.1
361	0.11
362	0.09
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.05
367	0.05
368	0.04
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.06
379	0.06
380	0.07
381	0.07
382	0.08
383	0.09
384	0.11
385	0.1
386	0.1
387	0.1
388	0.1
389	0.12
390	0.13
391	0.14
392	0.14
393	0.17
394	0.16
395	0.16
396	0.17
397	0.15
398	0.14
399	0.12
400	0.12
401	0.09
402	0.09
403	0.09
404	0.07
405	0.08
406	0.07
407	0.07
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.09
415	0.09
416	0.1
417	0.11
418	0.13
419	0.14
420	0.16
421	0.18
422	0.17
423	0.22
424	0.23
425	0.26
426	0.26
427	0.25
428	0.23
429	0.22
430	0.26
431	0.27
432	0.26
433	0.28
434	0.37
435	0.44
436	0.46
437	0.53
438	0.57
439	0.59
440	0.67
441	0.7
442	0.72
443	0.67
444	0.68
445	0.63
446	0.54
447	0.47
448	0.38
449	0.29
450	0.18
451	0.15
452	0.12
453	0.08
454	0.07
455	0.06
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.06
460	0.06
461	0.08
462	0.09
463	0.09
464	0.11
465	0.11
466	0.11
467	0.1
468	0.11
469	0.09
470	0.09
471	0.1
472	0.09
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.11
477	0.12
478	0.15
479	0.17
480	0.19
481	0.18
482	0.18
483	0.18
484	0.16
485	0.14
486	0.1
487	0.07
488	0.05
489	0.05
490	0.04
491	0.04
492	0.03
493	0.03
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.06
500	0.08
501	0.08
502	0.08
503	0.08
504	0.09
505	0.09
506	0.09
507	0.09
508	0.08
509	0.08
510	0.08
511	0.11
512	0.1
513	0.1
514	0.1
515	0.1
516	0.1
517	0.1
518	0.11
519	0.09
520	0.09
521	0.08
522	0.08
523	0.07
524	0.06
525	0.07
526	0.07
527	0.07
528	0.06
529	0.06
530	0.05
531	0.05
532	0.06
533	0.07
534	0.06
535	0.06
536	0.08
537	0.08
538	0.08
539	0.07
540	0.07
541	0.11
542	0.14
543	0.17
544	0.18
545	0.21
546	0.24
547	0.29
548	0.33
549	0.35
550	0.39
551	0.47
552	0.53
553	0.59
554	0.65
555	0.68
556	0.75
557	0.77
558	0.8
559	0.78
560	0.8
561	0.82
562	0.84
563	0.87
564	0.87
565	0.89
566	0.86
567	0.82
568	0.8
569	0.79
570	0.75
571	0.71
572	0.64
573	0.55
574	0.56
575	0.53
576	0.49
577	0.46
578	0.44
579	0.46
580	0.49
581	0.51
582	0.48
583	0.55
584	0.57
585	0.57
586	0.59
587	0.59
588	0.63
589	0.69
590	0.75
591	0.75
592	0.79
593	0.83
594	0.88
595	0.9
596	0.9
597	0.91
598	0.89
599	0.9
600	0.86
601	0.85
602	0.83
603	0.77
604	0.71
605	0.61
606	0.52
607	0.42
608	0.36
609	0.28
610	0.21
611	0.16
612	0.11
613	0.11
614	0.11
615	0.1
616	0.14
617	0.19
618	0.26
619	0.28
620	0.33
621	0.34
622	0.41
623	0.47
624	0.48
625	0.45
626	0.46
627	0.52
628	0.58
629	0.67
630	0.68
631	0.69
632	0.73

E3RT52

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer