FuNGI

Q5A2B9

Protein Details

Accession

Q5A2B9

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
33-54	KQNLIRQQQQQQQQQQQQQQQQ	Hydrophilic
481-504	QNQPAPKRAKKETKKQLQAKAQAQ	Hydrophilic
669-694	QLQLIHQKRRLQQQQQQQQQQQQQQA	Hydrophilic
726-751	QSKPVTTSPEVKKKRTYQKKKNAPAN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
486-495	PKRAKKETKK
738-746	KKRTYQKKK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	cal:CAALFM_C105430WA -
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MIKSEVLSGSASKTVGNSISNGTTVSTQNQGGKQNLIRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQLKHRTALQNYHFASTSEEILKKYSKYPASMSLHIFETHYRFNNSQDSQVIPKDSPMIKDFMKHVLKEQIPVEMCELIKDFAIRPYDGCIILQVYDHRNMVKTAVLQNRSTSSPSKDQDKKQQMVVSKPRTYRTLLRPTSLSIYYDLLYHTDSALHRFTDYLSLQMESEILTATNRELNLSVPLNPYNYDHLRPEPEPSGDMSQNSDEEIDQVKFQHRDAVEQPRRKIHQDEMVLHKSSEYEELMLLLSNKHKRPDDCSDKRLVVVSTSALPGSSLTGTSNTSTGTAAATPTPTSTTASAASQSSKQTTADGASTTDTKGKKGDKANGTSANQASASPTSVHPPIPTIPQNSVRATGQFMRLRLIEEIRKKRELEKLQQEAKIQAQANAIQSDSVPPSQQLAPQNTINSPVVTEPTKRSSPAAQNQPAPKRAKKETKKQLQAKAQAQAKAQAQAKAKVQTETPGPTPVQGQNSLSGPSVVNGSNVTSTANTPTMNNQSSLQQPSQASQPQIGSLNNNQQSQSQQQQQKNPQQTLQQQQQQQIFQNSLTPEEQKVYKQIQQNMATLAMMGQSGVTPTGQQLTPQQKQQAIQQAKNLQQQLFQRFPLYFQRMKQLQLIHQKRRLQQQQQQQQQQQQQQASNSSGGNQNNSSNQAAPQTQQFNQALPSTSEQSKPVTTSPEVKKKRTYQKKKNAPAN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.17
3	0.18
4	0.17
5	0.18
6	0.19
7	0.19
8	0.19
9	0.17
10	0.18
11	0.18
12	0.19
13	0.19
14	0.21
15	0.26
16	0.31
17	0.35
18	0.35
19	0.4
20	0.41
21	0.46
22	0.51
23	0.53
24	0.55
25	0.56
26	0.63
27	0.65
28	0.7
29	0.72
30	0.73
31	0.76
32	0.79
33	0.8
34	0.8
35	0.81
36	0.8
37	0.79
38	0.78
39	0.77
40	0.76
41	0.76
42	0.74
43	0.73
44	0.74
45	0.74
46	0.7
47	0.65
48	0.66
49	0.64
50	0.65
51	0.67
52	0.62
53	0.62
54	0.59
55	0.57
56	0.49
57	0.42
58	0.39
59	0.31
60	0.3
61	0.27
62	0.27
63	0.25
64	0.28
65	0.31
66	0.28
67	0.31
68	0.35
69	0.34
70	0.36
71	0.39
72	0.45
73	0.48
74	0.51
75	0.49
76	0.43
77	0.41
78	0.38
79	0.35
80	0.29
81	0.27
82	0.28
83	0.29
84	0.31
85	0.3
86	0.34
87	0.42
88	0.4
89	0.4
90	0.36
91	0.35
92	0.35
93	0.37
94	0.36
95	0.27
96	0.26
97	0.3
98	0.29
99	0.3
100	0.28
101	0.28
102	0.26
103	0.29
104	0.3
105	0.33
106	0.36
107	0.33
108	0.35
109	0.4
110	0.41
111	0.41
112	0.4
113	0.37
114	0.33
115	0.34
116	0.32
117	0.25
118	0.24
119	0.21
120	0.22
121	0.15
122	0.14
123	0.14
124	0.13
125	0.15
126	0.18
127	0.17
128	0.16
129	0.2
130	0.22
131	0.21
132	0.2
133	0.17
134	0.15
135	0.15
136	0.16
137	0.15
138	0.16
139	0.19
140	0.2
141	0.2
142	0.2
143	0.2
144	0.2
145	0.18
146	0.18
147	0.24
148	0.3
149	0.33
150	0.32
151	0.34
152	0.36
153	0.35
154	0.35
155	0.31
156	0.29
157	0.34
158	0.36
159	0.44
160	0.49
161	0.54
162	0.62
163	0.68
164	0.65
165	0.62
166	0.63
167	0.58
168	0.59
169	0.62
170	0.6
171	0.58
172	0.59
173	0.57
174	0.55
175	0.55
176	0.54
177	0.53
178	0.55
179	0.51
180	0.5
181	0.48
182	0.47
183	0.47
184	0.4
185	0.31
186	0.22
187	0.21
188	0.18
189	0.18
190	0.15
191	0.12
192	0.11
193	0.11
194	0.09
195	0.11
196	0.11
197	0.14
198	0.15
199	0.14
200	0.14
201	0.14
202	0.14
203	0.17
204	0.16
205	0.15
206	0.14
207	0.15
208	0.14
209	0.14
210	0.14
211	0.08
212	0.08
213	0.06
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.06
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.09
222	0.09
223	0.13
224	0.14
225	0.15
226	0.15
227	0.17
228	0.17
229	0.17
230	0.18
231	0.2
232	0.22
233	0.22
234	0.22
235	0.24
236	0.28
237	0.28
238	0.3
239	0.27
240	0.25
241	0.23
242	0.23
243	0.25
244	0.21
245	0.21
246	0.19
247	0.17
248	0.16
249	0.16
250	0.14
251	0.09
252	0.1
253	0.12
254	0.1
255	0.1
256	0.11
257	0.16
258	0.16
259	0.16
260	0.2
261	0.18
262	0.22
263	0.26
264	0.36
265	0.4
266	0.46
267	0.48
268	0.5
269	0.53
270	0.52
271	0.5
272	0.44
273	0.43
274	0.42
275	0.44
276	0.45
277	0.46
278	0.44
279	0.4
280	0.35
281	0.28
282	0.23
283	0.2
284	0.12
285	0.09
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.07
292	0.12
293	0.17
294	0.19
295	0.23
296	0.27
297	0.28
298	0.34
299	0.43
300	0.49
301	0.5
302	0.52
303	0.53
304	0.49
305	0.49
306	0.43
307	0.33
308	0.23
309	0.17
310	0.14
311	0.1
312	0.1
313	0.09
314	0.07
315	0.07
316	0.06
317	0.07
318	0.06
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.07
323	0.08
324	0.08
325	0.07
326	0.08
327	0.07
328	0.07
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.07
337	0.07
338	0.08
339	0.08
340	0.1
341	0.1
342	0.1
343	0.11
344	0.1
345	0.11
346	0.12
347	0.12
348	0.12
349	0.12
350	0.12
351	0.12
352	0.12
353	0.11
354	0.1
355	0.09
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.13
361	0.12
362	0.12
363	0.16
364	0.17
365	0.23
366	0.27
367	0.35
368	0.36
369	0.4
370	0.44
371	0.46
372	0.44
373	0.42
374	0.36
375	0.29
376	0.24
377	0.19
378	0.16
379	0.11
380	0.11
381	0.09
382	0.09
383	0.11
384	0.12
385	0.12
386	0.11
387	0.12
388	0.13
389	0.16
390	0.19
391	0.18
392	0.21
393	0.25
394	0.29
395	0.28
396	0.28
397	0.24
398	0.22
399	0.22
400	0.21
401	0.22
402	0.21
403	0.21
404	0.21
405	0.21
406	0.21
407	0.2
408	0.21
409	0.2
410	0.27
411	0.35
412	0.38
413	0.41
414	0.41
415	0.44
416	0.5
417	0.52
418	0.52
419	0.54
420	0.58
421	0.59
422	0.61
423	0.57
424	0.5
425	0.44
426	0.4
427	0.31
428	0.25
429	0.21
430	0.21
431	0.22
432	0.2
433	0.19
434	0.13
435	0.13
436	0.12
437	0.12
438	0.1
439	0.08
440	0.08
441	0.11
442	0.12
443	0.16
444	0.19
445	0.22
446	0.24
447	0.26
448	0.27
449	0.25
450	0.27
451	0.24
452	0.18
453	0.15
454	0.12
455	0.13
456	0.13
457	0.15
458	0.15
459	0.2
460	0.21
461	0.21
462	0.23
463	0.27
464	0.34
465	0.4
466	0.47
467	0.46
468	0.51
469	0.57
470	0.61
471	0.62
472	0.59
473	0.55
474	0.51
475	0.56
476	0.61
477	0.63
478	0.69
479	0.72
480	0.77
481	0.83
482	0.85
483	0.85
484	0.83
485	0.83
486	0.76
487	0.73
488	0.67
489	0.61
490	0.53
491	0.49
492	0.42
493	0.4
494	0.37
495	0.35
496	0.33
497	0.34
498	0.37
499	0.38
500	0.38
501	0.32
502	0.3
503	0.28
504	0.28
505	0.27
506	0.25
507	0.22
508	0.21
509	0.2
510	0.23
511	0.24
512	0.24
513	0.23
514	0.22
515	0.21
516	0.22
517	0.23
518	0.19
519	0.17
520	0.13
521	0.11
522	0.13
523	0.11
524	0.1
525	0.09
526	0.1
527	0.09
528	0.09
529	0.1
530	0.08
531	0.09
532	0.11
533	0.12
534	0.12
535	0.12
536	0.17
537	0.23
538	0.23
539	0.24
540	0.22
541	0.23
542	0.28
543	0.32
544	0.28
545	0.26
546	0.25
547	0.25
548	0.3
549	0.31
550	0.27
551	0.25
552	0.25
553	0.22
554	0.24
555	0.24
556	0.22
557	0.23
558	0.31
559	0.33
560	0.34
561	0.32
562	0.31
563	0.34
564	0.36
565	0.38
566	0.38
567	0.42
568	0.47
569	0.56
570	0.64
571	0.7
572	0.73
573	0.69
574	0.63
575	0.62
576	0.64
577	0.64
578	0.63
579	0.61
580	0.57
581	0.6
582	0.61
583	0.57
584	0.54
585	0.48
586	0.41
587	0.34
588	0.34
589	0.28
590	0.26
591	0.25
592	0.21
593	0.2
594	0.21
595	0.23
596	0.21
597	0.26
598	0.28
599	0.32
600	0.37
601	0.43
602	0.48
603	0.5
604	0.5
605	0.46
606	0.42
607	0.35
608	0.28
609	0.21
610	0.13
611	0.09
612	0.07
613	0.05
614	0.04
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.05
619	0.06
620	0.1
621	0.1
622	0.12
623	0.2
624	0.29
625	0.33
626	0.38
627	0.43
628	0.43
629	0.44
630	0.5
631	0.52
632	0.51
633	0.49
634	0.52
635	0.54
636	0.57
637	0.62
638	0.6
639	0.5
640	0.48
641	0.52
642	0.52
643	0.48
644	0.43
645	0.39
646	0.35
647	0.38
648	0.42
649	0.42
650	0.39
651	0.37
652	0.46
653	0.46
654	0.48
655	0.5
656	0.45
657	0.46
658	0.53
659	0.61
660	0.6
661	0.66
662	0.7
663	0.72
664	0.77
665	0.79
666	0.78
667	0.76
668	0.78
669	0.8
670	0.83
671	0.87
672	0.83
673	0.82
674	0.81
675	0.8
676	0.77
677	0.72
678	0.66
679	0.6
680	0.57
681	0.51
682	0.44
683	0.37
684	0.32
685	0.32
686	0.3
687	0.3
688	0.29
689	0.29
690	0.3
691	0.34
692	0.33
693	0.28
694	0.28
695	0.29
696	0.28
697	0.27
698	0.31
699	0.33
700	0.32
701	0.39
702	0.39
703	0.35
704	0.36
705	0.37
706	0.32
707	0.3
708	0.32
709	0.29
710	0.31
711	0.32
712	0.31
713	0.32
714	0.32
715	0.32
716	0.31
717	0.32
718	0.32
719	0.4
720	0.48
721	0.55
722	0.6
723	0.63
724	0.7
725	0.74
726	0.81
727	0.83
728	0.85
729	0.85
730	0.89
731	0.94

Q5A2B9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer