Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7LQH5

Protein Details
Accession W7LQH5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
363-382GIGPRKRKATDVFMKPRKRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
365-382GPRKRKATDVFMKPRKRA
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG fvr:FVEG_01245  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPPKSLLELATAACIKNIRELDSVGDYLPYKAVRLLLLKIDNAKQLRTIELNSPQIQGETGEVWLKLIKHEFPMEVKQKAYKPPNPTKWYRVYEKYRSDHQQALLESEAKLKNALMGLKEDKEKNTSKIVDDRRLLPRGGRVGPKKAWGFGARDPNGSTLAFNRGSRTKTHNGASVMRKVRRETKEIASIHGALSRPTQASNAITKLRKAPAAMVGDYQRAAKPTIRPPLPPPPKSAVSDVVETHEARAQYISDSDSEDGDDLFDDELPANRRKASSHVSLSPMKKPAAGHSDSTSKVRRTGLLSNSYKGPKPQTTTSSRPRVVPSAGKSLSPAPQQKHISLSPEPTEQSSPTRLTNTRPTPGIGPRKRKATDVFMKPRKRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.18
3 0.24
4 0.25
5 0.24
6 0.25
7 0.26
8 0.28
9 0.3
10 0.3
11 0.23
12 0.23
13 0.2
14 0.18
15 0.21
16 0.17
17 0.14
18 0.15
19 0.16
20 0.17
21 0.19
22 0.21
23 0.24
24 0.27
25 0.28
26 0.31
27 0.33
28 0.36
29 0.35
30 0.34
31 0.31
32 0.3
33 0.32
34 0.3
35 0.3
36 0.29
37 0.35
38 0.4
39 0.38
40 0.38
41 0.34
42 0.31
43 0.29
44 0.23
45 0.17
46 0.12
47 0.11
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.13
52 0.13
53 0.15
54 0.17
55 0.18
56 0.19
57 0.22
58 0.23
59 0.25
60 0.34
61 0.37
62 0.36
63 0.36
64 0.39
65 0.41
66 0.49
67 0.54
68 0.52
69 0.56
70 0.64
71 0.72
72 0.74
73 0.75
74 0.73
75 0.74
76 0.73
77 0.71
78 0.7
79 0.68
80 0.7
81 0.73
82 0.7
83 0.68
84 0.68
85 0.65
86 0.61
87 0.55
88 0.51
89 0.42
90 0.41
91 0.34
92 0.29
93 0.24
94 0.25
95 0.24
96 0.18
97 0.18
98 0.15
99 0.15
100 0.16
101 0.17
102 0.12
103 0.16
104 0.18
105 0.21
106 0.25
107 0.25
108 0.25
109 0.29
110 0.31
111 0.29
112 0.33
113 0.32
114 0.31
115 0.38
116 0.43
117 0.45
118 0.44
119 0.47
120 0.46
121 0.47
122 0.44
123 0.37
124 0.35
125 0.33
126 0.35
127 0.37
128 0.35
129 0.39
130 0.4
131 0.45
132 0.42
133 0.37
134 0.37
135 0.32
136 0.32
137 0.31
138 0.39
139 0.34
140 0.34
141 0.34
142 0.31
143 0.3
144 0.25
145 0.2
146 0.12
147 0.15
148 0.16
149 0.15
150 0.17
151 0.19
152 0.21
153 0.23
154 0.29
155 0.29
156 0.32
157 0.34
158 0.35
159 0.35
160 0.39
161 0.4
162 0.41
163 0.42
164 0.41
165 0.42
166 0.4
167 0.46
168 0.44
169 0.45
170 0.41
171 0.39
172 0.44
173 0.42
174 0.42
175 0.34
176 0.31
177 0.27
178 0.24
179 0.2
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.1
185 0.11
186 0.1
187 0.12
188 0.13
189 0.15
190 0.19
191 0.19
192 0.2
193 0.23
194 0.24
195 0.23
196 0.21
197 0.2
198 0.21
199 0.23
200 0.22
201 0.2
202 0.2
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.13
207 0.11
208 0.13
209 0.14
210 0.18
211 0.24
212 0.33
213 0.33
214 0.35
215 0.39
216 0.49
217 0.55
218 0.51
219 0.49
220 0.47
221 0.48
222 0.49
223 0.46
224 0.4
225 0.33
226 0.33
227 0.29
228 0.25
229 0.24
230 0.22
231 0.2
232 0.16
233 0.14
234 0.12
235 0.12
236 0.1
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.08
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.09
255 0.13
256 0.16
257 0.16
258 0.18
259 0.19
260 0.19
261 0.25
262 0.28
263 0.31
264 0.33
265 0.36
266 0.4
267 0.46
268 0.48
269 0.48
270 0.46
271 0.39
272 0.36
273 0.33
274 0.34
275 0.35
276 0.34
277 0.32
278 0.31
279 0.36
280 0.35
281 0.39
282 0.38
283 0.33
284 0.34
285 0.33
286 0.33
287 0.33
288 0.39
289 0.4
290 0.45
291 0.46
292 0.45
293 0.49
294 0.49
295 0.46
296 0.43
297 0.43
298 0.39
299 0.42
300 0.46
301 0.48
302 0.53
303 0.6
304 0.65
305 0.68
306 0.64
307 0.62
308 0.6
309 0.57
310 0.54
311 0.53
312 0.48
313 0.48
314 0.46
315 0.43
316 0.4
317 0.39
318 0.4
319 0.4
320 0.43
321 0.36
322 0.45
323 0.49
324 0.49
325 0.51
326 0.48
327 0.45
328 0.42
329 0.44
330 0.39
331 0.39
332 0.38
333 0.35
334 0.35
335 0.32
336 0.33
337 0.32
338 0.31
339 0.3
340 0.36
341 0.35
342 0.39
343 0.47
344 0.49
345 0.5
346 0.49
347 0.48
348 0.48
349 0.55
350 0.6
351 0.59
352 0.62
353 0.64
354 0.72
355 0.71
356 0.71
357 0.68
358 0.68
359 0.68
360 0.69
361 0.73
362 0.74