Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

W7M3F4

Protein Details
Accession W7M3F4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-302AQEEREKKQREERERQRIERERQREKDQEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
256-297KRREEEERKQKEEEDRIAQEEREKKQREERERQRIERERQRE
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019258  Mediator_Med4  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG fvr:FVEG_06276  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10018  Med4  
Amino Acid Sequences MDKYIDGRFERLEKALANLIDSVTKYHPSIQQGEELNLADQELSRGLEEVQTHQNNYLRIQQLRESSNALDTQIRDTLSNLATTRKDIVTTQTTTFPSGPSYPIAYEELLNYARRISKTTMPPAGTIKAAPPTPDVPEVQTPGGQTPAAQTPGPESQAASIMTPSAPASSQVQSPAVINGTPAVSQEPATQQSSMSANTVLPSEWTQFLNPLTDQIFLPWPNDLQLGAGSLAANQLLQEQGIDPKGYDPAEEEERKRREEEERKQKEEEDRIAQEEREKKQREERERQRIERERQREKDQEAWRRASLVGGPAAPGEQRSPTGPPQQKAQFQFTNLDDLDDDDDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.31
3 0.27
4 0.25
5 0.22
6 0.21
7 0.2
8 0.2
9 0.2
10 0.17
11 0.19
12 0.19
13 0.23
14 0.27
15 0.3
16 0.35
17 0.33
18 0.38
19 0.37
20 0.38
21 0.35
22 0.3
23 0.26
24 0.2
25 0.19
26 0.12
27 0.1
28 0.1
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.09
33 0.09
34 0.12
35 0.13
36 0.16
37 0.24
38 0.26
39 0.27
40 0.3
41 0.33
42 0.32
43 0.33
44 0.37
45 0.33
46 0.33
47 0.35
48 0.36
49 0.39
50 0.4
51 0.39
52 0.34
53 0.29
54 0.3
55 0.27
56 0.24
57 0.21
58 0.19
59 0.2
60 0.2
61 0.2
62 0.17
63 0.17
64 0.2
65 0.18
66 0.2
67 0.17
68 0.19
69 0.19
70 0.21
71 0.23
72 0.19
73 0.19
74 0.17
75 0.22
76 0.24
77 0.26
78 0.26
79 0.28
80 0.28
81 0.3
82 0.29
83 0.24
84 0.21
85 0.2
86 0.19
87 0.16
88 0.17
89 0.14
90 0.16
91 0.17
92 0.15
93 0.14
94 0.13
95 0.14
96 0.14
97 0.14
98 0.12
99 0.13
100 0.16
101 0.16
102 0.19
103 0.2
104 0.26
105 0.32
106 0.38
107 0.42
108 0.39
109 0.4
110 0.4
111 0.38
112 0.31
113 0.24
114 0.19
115 0.17
116 0.17
117 0.16
118 0.15
119 0.15
120 0.17
121 0.19
122 0.18
123 0.17
124 0.18
125 0.19
126 0.17
127 0.17
128 0.15
129 0.13
130 0.14
131 0.11
132 0.09
133 0.09
134 0.11
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.13
139 0.15
140 0.16
141 0.14
142 0.12
143 0.1
144 0.13
145 0.13
146 0.1
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.1
159 0.11
160 0.1
161 0.11
162 0.1
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.1
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.13
180 0.14
181 0.13
182 0.12
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.1
194 0.11
195 0.12
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.12
201 0.11
202 0.11
203 0.14
204 0.12
205 0.13
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.07
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.09
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.14
237 0.21
238 0.25
239 0.28
240 0.35
241 0.38
242 0.4
243 0.4
244 0.39
245 0.42
246 0.49
247 0.57
248 0.59
249 0.65
250 0.67
251 0.68
252 0.69
253 0.67
254 0.64
255 0.59
256 0.55
257 0.48
258 0.47
259 0.47
260 0.43
261 0.42
262 0.42
263 0.41
264 0.44
265 0.46
266 0.47
267 0.55
268 0.64
269 0.67
270 0.71
271 0.76
272 0.78
273 0.83
274 0.84
275 0.85
276 0.85
277 0.85
278 0.84
279 0.83
280 0.83
281 0.81
282 0.83
283 0.81
284 0.76
285 0.76
286 0.75
287 0.76
288 0.72
289 0.7
290 0.62
291 0.56
292 0.5
293 0.43
294 0.35
295 0.29
296 0.24
297 0.19
298 0.19
299 0.17
300 0.17
301 0.16
302 0.14
303 0.12
304 0.12
305 0.13
306 0.16
307 0.2
308 0.26
309 0.36
310 0.43
311 0.43
312 0.5
313 0.56
314 0.62
315 0.63
316 0.65
317 0.59
318 0.54
319 0.58
320 0.5
321 0.49
322 0.41
323 0.37
324 0.29
325 0.26
326 0.26