FuNGI

W7MDY8

Protein Details

Accession

W7MDY8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
12-39	EGEVLAPQPKRPKKQGGKTRQHQNSGID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-26	KRPKKQ

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto 7, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
KEGG	fvr:FVEG_06472 -
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MAAKRDLEALDEGEVLAPQPKRPKKQGGKTRQHQNSGIDPTWGQKYVFAGNGHTTTIPEGEEDDFEDDSEAMAYLNSVRQEANGIPHLLVAPKVQIGPQLPPELRNDDQEQDEQPIDRSVYNNGVGDSRGWYEDGAYMAMPDNAAEDDDYEGGECPDDYDEECDEESALNEAYFASVMDQYLRLRSILHADLPSNAVSRVVKARLKTDAPAENQSAAIATWSRLLRETDPHPLQVALMSKDTTLRILRILLGGKFLRQGYTLPERTSRWIWALLARMPDKGELNHTEIGWIRDLGRRAVLLGRSLAEMAALREELAEGGLGAHEAVDGSSSDEEVLADPEDMEVEGAISSGQDEDEPTPPAESREEVEKTPKVMEPTTKSPLEPDAEEGEIEDQDEDVAMEIATDSEAEEGEVTAQEPQENLEAARERLLARISNGMTSEDEEDLQKENAKQQLRANLRATLNMILTIAGEFYGQRDLLEFREPFVGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.11
3	0.14
4	0.14
5	0.18
6	0.28
7	0.37
8	0.46
9	0.55
10	0.66
11	0.71
12	0.81
13	0.87
14	0.88
15	0.9
16	0.91
17	0.93
18	0.91
19	0.87
20	0.81
21	0.75
22	0.72
23	0.69
24	0.6
25	0.52
26	0.43
27	0.4
28	0.39
29	0.36
30	0.27
31	0.21
32	0.23
33	0.24
34	0.29
35	0.26
36	0.25
37	0.27
38	0.28
39	0.27
40	0.25
41	0.21
42	0.18
43	0.17
44	0.15
45	0.11
46	0.12
47	0.11
48	0.12
49	0.13
50	0.14
51	0.13
52	0.13
53	0.13
54	0.11
55	0.1
56	0.1
57	0.08
58	0.06
59	0.05
60	0.05
61	0.06
62	0.08
63	0.09
64	0.09
65	0.09
66	0.1
67	0.13
68	0.14
69	0.18
70	0.19
71	0.19
72	0.18
73	0.19
74	0.19
75	0.17
76	0.17
77	0.13
78	0.1
79	0.11
80	0.11
81	0.11
82	0.14
83	0.16
84	0.18
85	0.22
86	0.27
87	0.26
88	0.28
89	0.31
90	0.34
91	0.33
92	0.34
93	0.34
94	0.3
95	0.32
96	0.32
97	0.3
98	0.27
99	0.26
100	0.22
101	0.2
102	0.19
103	0.17
104	0.16
105	0.16
106	0.15
107	0.18
108	0.19
109	0.18
110	0.17
111	0.17
112	0.16
113	0.16
114	0.15
115	0.13
116	0.12
117	0.11
118	0.1
119	0.1
120	0.11
121	0.11
122	0.1
123	0.08
124	0.08
125	0.08
126	0.08
127	0.07
128	0.06
129	0.06
130	0.05
131	0.06
132	0.05
133	0.05
134	0.06
135	0.06
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.06
140	0.06
141	0.05
142	0.05
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.09
147	0.09
148	0.1
149	0.1
150	0.1
151	0.09
152	0.09
153	0.08
154	0.07
155	0.07
156	0.05
157	0.06
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.05
162	0.05
163	0.05
164	0.05
165	0.06
166	0.07
167	0.08
168	0.09
169	0.1
170	0.09
171	0.09
172	0.09
173	0.13
174	0.13
175	0.15
176	0.14
177	0.14
178	0.15
179	0.16
180	0.16
181	0.12
182	0.11
183	0.1
184	0.09
185	0.1
186	0.13
187	0.16
188	0.18
189	0.19
190	0.21
191	0.24
192	0.26
193	0.25
194	0.27
195	0.28
196	0.29
197	0.31
198	0.3
199	0.26
200	0.24
201	0.23
202	0.17
203	0.12
204	0.09
205	0.06
206	0.05
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.11
211	0.13
212	0.13
213	0.17
214	0.19
215	0.24
216	0.25
217	0.25
218	0.24
219	0.22
220	0.21
221	0.19
222	0.18
223	0.11
224	0.11
225	0.11
226	0.1
227	0.11
228	0.11
229	0.11
230	0.1
231	0.09
232	0.09
233	0.09
234	0.09
235	0.1
236	0.12
237	0.1
238	0.12
239	0.12
240	0.12
241	0.14
242	0.13
243	0.12
244	0.11
245	0.11
246	0.13
247	0.21
248	0.22
249	0.22
250	0.24
251	0.25
252	0.28
253	0.29
254	0.26
255	0.2
256	0.19
257	0.18
258	0.18
259	0.19
260	0.18
261	0.21
262	0.2
263	0.19
264	0.18
265	0.19
266	0.17
267	0.15
268	0.17
269	0.15
270	0.18
271	0.19
272	0.18
273	0.18
274	0.19
275	0.19
276	0.16
277	0.14
278	0.11
279	0.13
280	0.15
281	0.14
282	0.14
283	0.12
284	0.12
285	0.15
286	0.14
287	0.12
288	0.12
289	0.12
290	0.11
291	0.11
292	0.1
293	0.08
294	0.07
295	0.06
296	0.06
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.04
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.02
311	0.03
312	0.02
313	0.03
314	0.03
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.06
321	0.06
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.05
329	0.05
330	0.04
331	0.03
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.03
337	0.03
338	0.04
339	0.04
340	0.05
341	0.07
342	0.09
343	0.12
344	0.12
345	0.13
346	0.13
347	0.15
348	0.15
349	0.14
350	0.14
351	0.19
352	0.21
353	0.21
354	0.28
355	0.28
356	0.28
357	0.3
358	0.3
359	0.27
360	0.28
361	0.33
362	0.33
363	0.38
364	0.42
365	0.41
366	0.38
367	0.37
368	0.38
369	0.34
370	0.28
371	0.25
372	0.21
373	0.21
374	0.21
375	0.19
376	0.16
377	0.13
378	0.13
379	0.09
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.05
384	0.04
385	0.05
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.06
400	0.06
401	0.08
402	0.08
403	0.08
404	0.08
405	0.1
406	0.11
407	0.11
408	0.11
409	0.15
410	0.17
411	0.17
412	0.2
413	0.2
414	0.19
415	0.21
416	0.23
417	0.2
418	0.19
419	0.25
420	0.24
421	0.24
422	0.24
423	0.23
424	0.22
425	0.22
426	0.22
427	0.17
428	0.17
429	0.16
430	0.16
431	0.17
432	0.17
433	0.19
434	0.19
435	0.24
436	0.3
437	0.33
438	0.36
439	0.39
440	0.48
441	0.51
442	0.56
443	0.53
444	0.54
445	0.51
446	0.5
447	0.46
448	0.39
449	0.33
450	0.26
451	0.23
452	0.16
453	0.15
454	0.12
455	0.1
456	0.07
457	0.06
458	0.06
459	0.07
460	0.1
461	0.1
462	0.1
463	0.12
464	0.14
465	0.16
466	0.24
467	0.23
468	0.21

W7MDY8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer