Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

W7MDW5

Protein Details
Accession W7MDW5    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-249WEKQQPKEEAKPKKAPKKQQVDEEHydrophilic
659-685QPKTNAQHTRDDKKRGRKGDRGDEAHKBasic
707-731AEMKHRLIARTRVMRKKKALSRGKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-243AKPKKAPKK
528-562KAGRRQPLSKEENARDGKDAKEKEHERKAKGKGIV
667-731TRDDKKRGRKGDRGDEAHKGGKDRGSKQAEEEGGRKPETDAEMKHRLIARTRVMRKKKALSRGKK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG fvr:FVEG_09187  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12676  RRM3_Nop4p  
Amino Acid Sequences MGASKNDRKRPHTEAETLDPASFEDRDNGAVKASKRARVEDRRSLFVRSLPPGATSESLTDFFSQHYPVKHATVVVDQKTKESRGYGFVTLADAEDAVEAKKALNNQDWNGRRIRIDVAEPRQRNNTTGELPAHKIRKEEHQRPPKLIVRNLPWSIKTSEQLSHLFRSFGKVKFADLPQDKGKLKGFGFVTLRGRPNAERALEAINGKEIDGRTLAVDWAVDKDTWEKQQPKEEAKPKKAPKKQQVDEEDEDDQTSSEGSDDEDEEEGGAEVNRDDQLDADLKNFFKNHMENLEDEEDEEEEDDKQAEKEVQSLAPKRMTDNTSTVFIRNLPFTTTDEQLKDFFDHFGKVRYARVVMDKVTEKPAGTGFVCFYDVDDAKKCIKGAPRPDPSLAAAKNSILQDESADPDGKYTLDGRLLQVAQAVNKQEATNLADSSLAKRNEKDKRKLFLLNEGVIDRSSPLFNLLTPSEMQVRQASAAQRKKLVQGNPSLHLSLTRLAIRNIPRNMDSKDLKELARKAVVEFAKEVKAGRRQPLSKEENARDGKDAKEKEHERKAKGKGIVRQAKIVFESGQGQKMPEKDGGKSRGYGFIEYSSHHWALMGLRYLNGHQLENEAGKKQRLVVEFAIENAQVVQRRRANEERSRQLNPEHNKGAKAEAQPKTNAQHTRDDKKRGRKGDRGDEAHKGGKDRGSKQAEEEGGRKPETDAEMKHRLIARTRVMRKKKALSRGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.66
3 0.66
4 0.59
5 0.52
6 0.41
7 0.35
8 0.31
9 0.25
10 0.19
11 0.17
12 0.16
13 0.2
14 0.21
15 0.21
16 0.21
17 0.25
18 0.25
19 0.32
20 0.36
21 0.39
22 0.41
23 0.48
24 0.55
25 0.61
26 0.69
27 0.69
28 0.69
29 0.7
30 0.69
31 0.65
32 0.57
33 0.52
34 0.5
35 0.43
36 0.42
37 0.35
38 0.35
39 0.33
40 0.33
41 0.29
42 0.23
43 0.22
44 0.21
45 0.21
46 0.21
47 0.2
48 0.17
49 0.18
50 0.18
51 0.2
52 0.21
53 0.22
54 0.25
55 0.27
56 0.29
57 0.28
58 0.27
59 0.26
60 0.3
61 0.35
62 0.37
63 0.39
64 0.37
65 0.41
66 0.44
67 0.44
68 0.39
69 0.35
70 0.31
71 0.32
72 0.36
73 0.32
74 0.28
75 0.27
76 0.25
77 0.22
78 0.2
79 0.14
80 0.1
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.09
89 0.13
90 0.18
91 0.24
92 0.29
93 0.32
94 0.42
95 0.45
96 0.46
97 0.48
98 0.45
99 0.39
100 0.36
101 0.37
102 0.3
103 0.33
104 0.39
105 0.44
106 0.51
107 0.52
108 0.53
109 0.56
110 0.55
111 0.49
112 0.45
113 0.41
114 0.34
115 0.37
116 0.38
117 0.34
118 0.37
119 0.42
120 0.43
121 0.39
122 0.39
123 0.36
124 0.43
125 0.5
126 0.56
127 0.59
128 0.65
129 0.69
130 0.71
131 0.77
132 0.72
133 0.7
134 0.65
135 0.62
136 0.58
137 0.62
138 0.61
139 0.56
140 0.5
141 0.46
142 0.44
143 0.39
144 0.34
145 0.29
146 0.28
147 0.28
148 0.32
149 0.31
150 0.32
151 0.3
152 0.29
153 0.26
154 0.3
155 0.31
156 0.29
157 0.32
158 0.28
159 0.3
160 0.34
161 0.35
162 0.39
163 0.36
164 0.39
165 0.37
166 0.44
167 0.42
168 0.4
169 0.41
170 0.37
171 0.35
172 0.36
173 0.32
174 0.32
175 0.33
176 0.35
177 0.36
178 0.36
179 0.39
180 0.34
181 0.36
182 0.3
183 0.33
184 0.33
185 0.29
186 0.24
187 0.23
188 0.25
189 0.24
190 0.24
191 0.19
192 0.16
193 0.15
194 0.14
195 0.15
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.08
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.11
211 0.15
212 0.18
213 0.26
214 0.3
215 0.32
216 0.41
217 0.46
218 0.5
219 0.57
220 0.62
221 0.64
222 0.67
223 0.74
224 0.74
225 0.79
226 0.8
227 0.81
228 0.82
229 0.83
230 0.8
231 0.8
232 0.77
233 0.75
234 0.69
235 0.62
236 0.54
237 0.43
238 0.37
239 0.28
240 0.21
241 0.13
242 0.1
243 0.06
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.07
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.12
269 0.12
270 0.14
271 0.14
272 0.13
273 0.15
274 0.16
275 0.18
276 0.19
277 0.2
278 0.18
279 0.22
280 0.23
281 0.19
282 0.18
283 0.16
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.07
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.08
295 0.07
296 0.09
297 0.1
298 0.12
299 0.17
300 0.2
301 0.22
302 0.24
303 0.24
304 0.23
305 0.27
306 0.27
307 0.25
308 0.25
309 0.24
310 0.24
311 0.24
312 0.23
313 0.19
314 0.18
315 0.16
316 0.14
317 0.13
318 0.11
319 0.12
320 0.14
321 0.16
322 0.16
323 0.17
324 0.17
325 0.18
326 0.17
327 0.17
328 0.15
329 0.13
330 0.13
331 0.12
332 0.13
333 0.12
334 0.14
335 0.15
336 0.15
337 0.15
338 0.15
339 0.15
340 0.15
341 0.18
342 0.16
343 0.15
344 0.17
345 0.17
346 0.18
347 0.2
348 0.19
349 0.16
350 0.15
351 0.15
352 0.14
353 0.12
354 0.12
355 0.09
356 0.09
357 0.1
358 0.09
359 0.08
360 0.1
361 0.1
362 0.11
363 0.12
364 0.14
365 0.14
366 0.15
367 0.15
368 0.15
369 0.2
370 0.25
371 0.33
372 0.4
373 0.44
374 0.46
375 0.47
376 0.45
377 0.41
378 0.41
379 0.32
380 0.24
381 0.19
382 0.16
383 0.19
384 0.18
385 0.16
386 0.1
387 0.1
388 0.09
389 0.1
390 0.11
391 0.09
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.1
396 0.09
397 0.09
398 0.08
399 0.08
400 0.09
401 0.1
402 0.1
403 0.13
404 0.13
405 0.12
406 0.14
407 0.13
408 0.11
409 0.13
410 0.14
411 0.11
412 0.12
413 0.12
414 0.1
415 0.12
416 0.13
417 0.12
418 0.11
419 0.11
420 0.11
421 0.12
422 0.15
423 0.2
424 0.19
425 0.19
426 0.22
427 0.3
428 0.38
429 0.47
430 0.54
431 0.55
432 0.58
433 0.62
434 0.66
435 0.59
436 0.58
437 0.54
438 0.46
439 0.39
440 0.34
441 0.3
442 0.23
443 0.22
444 0.13
445 0.1
446 0.08
447 0.07
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.11
452 0.11
453 0.11
454 0.11
455 0.13
456 0.14
457 0.14
458 0.16
459 0.14
460 0.14
461 0.13
462 0.16
463 0.2
464 0.25
465 0.31
466 0.32
467 0.35
468 0.35
469 0.4
470 0.43
471 0.43
472 0.39
473 0.42
474 0.44
475 0.43
476 0.44
477 0.38
478 0.32
479 0.28
480 0.24
481 0.18
482 0.16
483 0.16
484 0.16
485 0.16
486 0.22
487 0.26
488 0.33
489 0.33
490 0.34
491 0.33
492 0.36
493 0.37
494 0.39
495 0.36
496 0.31
497 0.35
498 0.34
499 0.34
500 0.35
501 0.36
502 0.33
503 0.34
504 0.32
505 0.27
506 0.31
507 0.31
508 0.26
509 0.25
510 0.24
511 0.22
512 0.22
513 0.22
514 0.2
515 0.28
516 0.32
517 0.36
518 0.42
519 0.43
520 0.48
521 0.57
522 0.57
523 0.56
524 0.6
525 0.56
526 0.57
527 0.58
528 0.54
529 0.47
530 0.44
531 0.4
532 0.4
533 0.39
534 0.33
535 0.4
536 0.45
537 0.5
538 0.59
539 0.62
540 0.6
541 0.66
542 0.69
543 0.67
544 0.68
545 0.65
546 0.62
547 0.66
548 0.69
549 0.62
550 0.62
551 0.55
552 0.51
553 0.45
554 0.4
555 0.3
556 0.22
557 0.27
558 0.22
559 0.25
560 0.23
561 0.22
562 0.24
563 0.25
564 0.26
565 0.26
566 0.26
567 0.26
568 0.34
569 0.39
570 0.38
571 0.39
572 0.38
573 0.39
574 0.39
575 0.36
576 0.29
577 0.28
578 0.27
579 0.25
580 0.27
581 0.25
582 0.23
583 0.22
584 0.2
585 0.18
586 0.19
587 0.22
588 0.22
589 0.17
590 0.17
591 0.18
592 0.19
593 0.23
594 0.22
595 0.19
596 0.15
597 0.17
598 0.19
599 0.21
600 0.23
601 0.22
602 0.24
603 0.25
604 0.25
605 0.27
606 0.3
607 0.29
608 0.32
609 0.29
610 0.32
611 0.3
612 0.3
613 0.29
614 0.22
615 0.2
616 0.16
617 0.17
618 0.17
619 0.19
620 0.26
621 0.28
622 0.32
623 0.39
624 0.47
625 0.53
626 0.58
627 0.66
628 0.67
629 0.69
630 0.71
631 0.66
632 0.65
633 0.66
634 0.62
635 0.61
636 0.6
637 0.56
638 0.55
639 0.52
640 0.5
641 0.47
642 0.48
643 0.49
644 0.46
645 0.48
646 0.49
647 0.52
648 0.52
649 0.53
650 0.52
651 0.46
652 0.51
653 0.55
654 0.62
655 0.66
656 0.72
657 0.74
658 0.78
659 0.84
660 0.84
661 0.85
662 0.84
663 0.85
664 0.86
665 0.87
666 0.83
667 0.79
668 0.75
669 0.71
670 0.68
671 0.6
672 0.52
673 0.46
674 0.45
675 0.48
676 0.45
677 0.5
678 0.51
679 0.5
680 0.5
681 0.54
682 0.53
683 0.49
684 0.48
685 0.45
686 0.44
687 0.43
688 0.4
689 0.33
690 0.33
691 0.34
692 0.37
693 0.35
694 0.37
695 0.45
696 0.45
697 0.49
698 0.49
699 0.48
700 0.49
701 0.52
702 0.54
703 0.56
704 0.65
705 0.71
706 0.75
707 0.81
708 0.83
709 0.86
710 0.85
711 0.85