Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7LYM1

Protein Details
Accession W7LYM1    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MATKEKKQKKPKASKSELKTESSHydrophilic
65-89APEPPSKRAKRALKKGKSLPSKQDSHydrophilic
310-334DEEKNKSQQKQFKTRKWWVNRMLGRHydrophilic
342-381EDDQVRYKKRFGKDRKALPDKDSNPRGRPPPRKYDQTNGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-15EKKQKKPKASK
69-104PSKRAKRALKKGKSLPSKQDSDDEKRGDKDGKDKKA
349-374KKRFGKDRKALPDKDSNPRGRPPPRK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG fvr:FVEG_02881  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MATKEKKQKKPKASKSELKTESSGKTIEIEKVESTEVAEMAESEAAVSSSKRKIELEEIEVDVDAPEPPSKRAKRALKKGKSLPSKQDSDDEKRGDKDGKDKKAARSEHSVWIGNMPFHVTATELRKWLVDNSGGVITEEMITRVKLPTNKEPGRDKNVKPANKGFAYVDFTEIGPKVSAISLTESDLGGRKLLIKDATSFEGRPKKEAESTEEDANEGKTSKEQKQDANASRKIFVGNMSFKTTEDDLYRNFEKCGEIEWAKVATFEDTGKCKGFGWVKFQDPTAAAWAVKGFVKIKEAVDTEDDFKDDEEKNKSQQKQFKTRKWWVNRMLGRELKVELAEDDQVRYKKRFGKDRKALPDKDSNPRGRPPPRKYDQTNGAVRESHDTRGGAAKPLKEAEDISVARLTGAVVKHTGTKMTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.9
3 0.9
4 0.84
5 0.77
6 0.7
7 0.65
8 0.57
9 0.5
10 0.43
11 0.33
12 0.31
13 0.29
14 0.3
15 0.26
16 0.26
17 0.23
18 0.24
19 0.25
20 0.21
21 0.19
22 0.16
23 0.13
24 0.11
25 0.1
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.07
34 0.07
35 0.12
36 0.16
37 0.18
38 0.21
39 0.21
40 0.25
41 0.33
42 0.37
43 0.37
44 0.36
45 0.35
46 0.34
47 0.32
48 0.29
49 0.2
50 0.15
51 0.11
52 0.09
53 0.11
54 0.12
55 0.15
56 0.25
57 0.29
58 0.35
59 0.44
60 0.54
61 0.61
62 0.71
63 0.79
64 0.79
65 0.85
66 0.88
67 0.88
68 0.87
69 0.84
70 0.82
71 0.79
72 0.74
73 0.66
74 0.65
75 0.62
76 0.61
77 0.61
78 0.55
79 0.51
80 0.48
81 0.49
82 0.47
83 0.42
84 0.44
85 0.45
86 0.49
87 0.55
88 0.59
89 0.63
90 0.67
91 0.68
92 0.63
93 0.62
94 0.58
95 0.57
96 0.55
97 0.49
98 0.4
99 0.4
100 0.37
101 0.28
102 0.24
103 0.18
104 0.14
105 0.12
106 0.12
107 0.09
108 0.12
109 0.17
110 0.2
111 0.19
112 0.19
113 0.2
114 0.21
115 0.21
116 0.2
117 0.16
118 0.13
119 0.15
120 0.15
121 0.15
122 0.14
123 0.12
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.09
132 0.12
133 0.15
134 0.2
135 0.28
136 0.38
137 0.41
138 0.46
139 0.53
140 0.56
141 0.62
142 0.65
143 0.57
144 0.57
145 0.63
146 0.61
147 0.58
148 0.57
149 0.55
150 0.47
151 0.47
152 0.38
153 0.32
154 0.32
155 0.27
156 0.23
157 0.17
158 0.16
159 0.17
160 0.16
161 0.13
162 0.09
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.08
177 0.07
178 0.09
179 0.09
180 0.11
181 0.12
182 0.11
183 0.13
184 0.14
185 0.17
186 0.15
187 0.15
188 0.2
189 0.26
190 0.25
191 0.25
192 0.25
193 0.25
194 0.28
195 0.29
196 0.29
197 0.29
198 0.31
199 0.31
200 0.29
201 0.27
202 0.23
203 0.22
204 0.17
205 0.1
206 0.08
207 0.09
208 0.14
209 0.19
210 0.25
211 0.28
212 0.3
213 0.36
214 0.45
215 0.49
216 0.52
217 0.52
218 0.46
219 0.44
220 0.42
221 0.36
222 0.28
223 0.22
224 0.19
225 0.19
226 0.2
227 0.22
228 0.22
229 0.21
230 0.23
231 0.22
232 0.18
233 0.16
234 0.16
235 0.14
236 0.2
237 0.21
238 0.2
239 0.19
240 0.18
241 0.17
242 0.16
243 0.17
244 0.17
245 0.16
246 0.15
247 0.17
248 0.16
249 0.15
250 0.15
251 0.13
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.11
256 0.13
257 0.16
258 0.16
259 0.16
260 0.16
261 0.2
262 0.25
263 0.25
264 0.3
265 0.32
266 0.35
267 0.36
268 0.36
269 0.33
270 0.28
271 0.26
272 0.22
273 0.18
274 0.14
275 0.13
276 0.13
277 0.12
278 0.12
279 0.13
280 0.11
281 0.11
282 0.14
283 0.16
284 0.16
285 0.19
286 0.2
287 0.19
288 0.21
289 0.22
290 0.22
291 0.2
292 0.2
293 0.16
294 0.15
295 0.18
296 0.17
297 0.2
298 0.24
299 0.26
300 0.33
301 0.41
302 0.48
303 0.52
304 0.58
305 0.62
306 0.67
307 0.75
308 0.77
309 0.79
310 0.82
311 0.84
312 0.86
313 0.86
314 0.83
315 0.84
316 0.79
317 0.75
318 0.74
319 0.68
320 0.6
321 0.52
322 0.45
323 0.36
324 0.31
325 0.25
326 0.17
327 0.15
328 0.16
329 0.15
330 0.15
331 0.2
332 0.23
333 0.27
334 0.28
335 0.33
336 0.37
337 0.45
338 0.54
339 0.59
340 0.67
341 0.73
342 0.81
343 0.85
344 0.87
345 0.83
346 0.78
347 0.78
348 0.73
349 0.74
350 0.73
351 0.69
352 0.65
353 0.68
354 0.72
355 0.72
356 0.77
357 0.75
358 0.76
359 0.77
360 0.81
361 0.8
362 0.81
363 0.8
364 0.78
365 0.77
366 0.7
367 0.64
368 0.56
369 0.51
370 0.49
371 0.41
372 0.35
373 0.32
374 0.28
375 0.27
376 0.32
377 0.32
378 0.33
379 0.35
380 0.35
381 0.35
382 0.37
383 0.37
384 0.31
385 0.31
386 0.26
387 0.3
388 0.28
389 0.26
390 0.26
391 0.24
392 0.22
393 0.21
394 0.18
395 0.14
396 0.15
397 0.15
398 0.14
399 0.16
400 0.21
401 0.22
402 0.26