Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7LWU6

Protein Details
Accession W7LWU6    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
359-381LESVKHLKLKCKKLEQQVINMARHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 15.5, cyto_mito 11, mito 5.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001514  DNA-dir_RNA_pol_30-40kDasu_CS  
IPR011262  DNA-dir_RNA_pol_insert  
IPR011263  DNA-dir_RNA_pol_RpoA/D/Rpb3  
IPR036603  RBP11-like  
IPR022842  RNAP_Rpo3/Rpb3/RPAC1  
IPR033901  RNAPI/III_AC40  
IPR036643  RNApol_insert_sf  
Gene Ontology GO:0005736  C:RNA polymerase I complex  
GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0001054  F:RNA polymerase I activity  
GO:0001056  F:RNA polymerase III activity  
GO:0006363  P:termination of RNA polymerase I transcription  
GO:0006386  P:termination of RNA polymerase III transcription  
GO:0006362  P:transcription elongation by RNA polymerase I  
GO:0006361  P:transcription initiation at RNA polymerase I promoter  
GO:0006384  P:transcription initiation at RNA polymerase III promoter  
GO:0042797  P:tRNA transcription by RNA polymerase III  
KEGG fvr:FVEG_00819  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01000  RNA_pol_A_bac  
PF01193  RNA_pol_L  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00446  RNA_POL_D_30KD  
CDD cd07032  RNAP_I_II_AC40  
Amino Acid Sequences MATAQQAAWRKAPTAEEIANRQTVGINKETVTNITSTDYPGHHPGEDLAFTLDRFRDAFSVKFHQNDQFLASFSLVGLDASLANAFRRILLSEIPTLAIENVYIENNTSVIQDEVLAHRLGLIPFKGGREGLHNFLKWHKKPEAGEDPYAGCFDWNTVRLELNVTCTVNEDASPAENDPLKAYHNAHVYARDIVFVPTGKQVEYFSGEDAIVPTNPDILIAKLRPRQTINLAMHMHKGIGSDHAKFSPVATASYRLLPTITITKPILGADAEKFAKCFPKGVIGLEKVTAKEAAQAGSGYEGQEGETKAVVVDAMKDTVSREALRHKEFEGKVKLGRRRDHFIFSVESTGQWDSDELFLESVKHLKLKCKKLEQQVINMAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.35
3 0.36
4 0.4
5 0.42
6 0.41
7 0.38
8 0.34
9 0.3
10 0.3
11 0.29
12 0.27
13 0.25
14 0.23
15 0.27
16 0.28
17 0.26
18 0.23
19 0.19
20 0.17
21 0.17
22 0.18
23 0.16
24 0.18
25 0.18
26 0.21
27 0.26
28 0.27
29 0.24
30 0.24
31 0.24
32 0.24
33 0.23
34 0.19
35 0.17
36 0.15
37 0.15
38 0.18
39 0.16
40 0.14
41 0.14
42 0.15
43 0.15
44 0.17
45 0.2
46 0.22
47 0.29
48 0.31
49 0.33
50 0.35
51 0.37
52 0.36
53 0.35
54 0.33
55 0.27
56 0.25
57 0.23
58 0.2
59 0.15
60 0.13
61 0.12
62 0.09
63 0.07
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.06
69 0.05
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.12
78 0.14
79 0.15
80 0.15
81 0.15
82 0.15
83 0.14
84 0.12
85 0.1
86 0.07
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.08
101 0.09
102 0.11
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.16
117 0.18
118 0.21
119 0.24
120 0.24
121 0.25
122 0.32
123 0.41
124 0.37
125 0.41
126 0.4
127 0.41
128 0.41
129 0.49
130 0.52
131 0.46
132 0.45
133 0.4
134 0.38
135 0.33
136 0.32
137 0.23
138 0.13
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.13
147 0.15
148 0.14
149 0.16
150 0.16
151 0.14
152 0.13
153 0.15
154 0.15
155 0.13
156 0.13
157 0.09
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.12
169 0.13
170 0.16
171 0.18
172 0.19
173 0.18
174 0.19
175 0.19
176 0.18
177 0.17
178 0.13
179 0.11
180 0.1
181 0.11
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.14
191 0.13
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.09
207 0.1
208 0.15
209 0.2
210 0.22
211 0.25
212 0.26
213 0.29
214 0.3
215 0.38
216 0.34
217 0.37
218 0.37
219 0.35
220 0.34
221 0.31
222 0.27
223 0.18
224 0.17
225 0.1
226 0.14
227 0.15
228 0.16
229 0.17
230 0.17
231 0.18
232 0.17
233 0.17
234 0.15
235 0.14
236 0.14
237 0.13
238 0.16
239 0.16
240 0.19
241 0.19
242 0.15
243 0.15
244 0.13
245 0.14
246 0.17
247 0.16
248 0.17
249 0.17
250 0.18
251 0.18
252 0.18
253 0.17
254 0.11
255 0.12
256 0.1
257 0.15
258 0.16
259 0.15
260 0.15
261 0.16
262 0.21
263 0.2
264 0.21
265 0.17
266 0.23
267 0.24
268 0.28
269 0.33
270 0.3
271 0.3
272 0.3
273 0.31
274 0.23
275 0.23
276 0.2
277 0.14
278 0.16
279 0.16
280 0.14
281 0.14
282 0.13
283 0.12
284 0.14
285 0.14
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.12
291 0.12
292 0.11
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.06
299 0.08
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.11
305 0.14
306 0.16
307 0.15
308 0.16
309 0.24
310 0.32
311 0.35
312 0.36
313 0.35
314 0.42
315 0.43
316 0.5
317 0.49
318 0.45
319 0.48
320 0.54
321 0.6
322 0.59
323 0.65
324 0.63
325 0.64
326 0.65
327 0.65
328 0.59
329 0.55
330 0.51
331 0.44
332 0.42
333 0.34
334 0.29
335 0.26
336 0.24
337 0.2
338 0.16
339 0.15
340 0.12
341 0.13
342 0.14
343 0.12
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.14
348 0.16
349 0.16
350 0.19
351 0.21
352 0.31
353 0.41
354 0.5
355 0.58
356 0.65
357 0.72
358 0.79
359 0.87
360 0.83
361 0.83