FuNGI

C4V9A7

Protein Details

Accession

C4V9A7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
28-49	RNSQLKKKISLVKKLKNLQNES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14, plas 7, mito_nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR039762 Nmd2/UPF2
Gene Ontology	GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
KEGG	nce:NCER_101131 -

Amino Acid Sequences

MQIEKLGPFMEWNVERIHLSQTKSLLNRNSQLKKKISLVKKLKNLQNESLQPLLEDLSTENMEQFFSEIIDSILSLKVTCLEDIKNIIRIISIYLKDHKFINMLFTHLNSTEIYWHKIIFIEIQILTDTKFNYKLALKSLFNDASNLYKIFYMEYVLYFFNDEKLIAFINKEKTKIGQLDMNQIDDKYSERVLNICRVLNIDIIEQKSDNNFKQVIELKENEFDFYTCKFLGEDNFTIPRQTKDIVEILKSNKLDIGKIDAISKYLRKTENVKMIPVIYNKLKNNIFCMPVLARIIRNCGILCKKSINKLLEDVFENKITNRTDLINTIFLVSELIKFRYIGFNECFNLLEYFYKQKDIEICCLLMKNVGRFLLVDEQSNNKARNFLDKLIAYGNKCSSIECTHINDMLSVIFSKSVRYESEDNIYNFLSYHFKNGVHKTGSKIDLILKKNKKYFLKILCAPWKFKDVELVCKIASLFCLDLILIDLLPFIIELIGNSYKLKTFSYTKFLSGLLKCKNSKIQETAISSLFNIKIHREMKLRILIVLLSGMSFCVKSRHIQHLKNECSKVNTIEIHNMLFNLCESIGVKYEKPFYEDSFDEEIRLMENL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.23
3	0.24
4	0.3
5	0.27
6	0.29
7	0.32
8	0.34
9	0.39
10	0.42
11	0.48
12	0.47
13	0.49
14	0.54
15	0.59
16	0.65
17	0.66
18	0.72
19	0.7
20	0.68
21	0.7
22	0.72
23	0.7
24	0.72
25	0.74
26	0.75
27	0.79
28	0.83
29	0.81
30	0.81
31	0.79
32	0.75
33	0.73
34	0.68
35	0.64
36	0.56
37	0.5
38	0.4
39	0.34
40	0.28
41	0.19
42	0.14
43	0.1
44	0.12
45	0.13
46	0.13
47	0.13
48	0.12
49	0.13
50	0.12
51	0.12
52	0.08
53	0.08
54	0.08
55	0.07
56	0.07
57	0.07
58	0.07
59	0.08
60	0.09
61	0.08
62	0.08
63	0.08
64	0.12
65	0.13
66	0.13
67	0.14
68	0.14
69	0.17
70	0.22
71	0.25
72	0.26
73	0.25
74	0.24
75	0.22
76	0.21
77	0.22
78	0.23
79	0.23
80	0.21
81	0.29
82	0.3
83	0.31
84	0.32
85	0.3
86	0.26
87	0.24
88	0.28
89	0.21
90	0.22
91	0.22
92	0.22
93	0.23
94	0.21
95	0.22
96	0.15
97	0.15
98	0.19
99	0.2
100	0.23
101	0.21
102	0.21
103	0.2
104	0.21
105	0.21
106	0.16
107	0.15
108	0.15
109	0.14
110	0.15
111	0.14
112	0.14
113	0.14
114	0.14
115	0.13
116	0.12
117	0.14
118	0.14
119	0.17
120	0.21
121	0.23
122	0.26
123	0.32
124	0.3
125	0.3
126	0.37
127	0.35
128	0.32
129	0.3
130	0.26
131	0.23
132	0.24
133	0.23
134	0.16
135	0.14
136	0.14
137	0.14
138	0.13
139	0.11
140	0.09
141	0.1
142	0.11
143	0.11
144	0.11
145	0.11
146	0.11
147	0.11
148	0.1
149	0.1
150	0.08
151	0.09
152	0.1
153	0.09
154	0.1
155	0.14
156	0.22
157	0.25
158	0.25
159	0.25
160	0.26
161	0.32
162	0.33
163	0.31
164	0.27
165	0.26
166	0.35
167	0.35
168	0.35
169	0.3
170	0.27
171	0.25
172	0.2
173	0.2
174	0.12
175	0.13
176	0.11
177	0.11
178	0.15
179	0.17
180	0.22
181	0.23
182	0.21
183	0.2
184	0.21
185	0.22
186	0.2
187	0.18
188	0.14
189	0.15
190	0.16
191	0.16
192	0.14
193	0.14
194	0.16
195	0.2
196	0.19
197	0.2
198	0.2
199	0.19
200	0.24
201	0.3
202	0.3
203	0.29
204	0.31
205	0.28
206	0.31
207	0.31
208	0.27
209	0.21
210	0.18
211	0.15
212	0.14
213	0.15
214	0.11
215	0.12
216	0.11
217	0.11
218	0.14
219	0.17
220	0.17
221	0.17
222	0.2
223	0.2
224	0.21
225	0.21
226	0.19
227	0.17
228	0.17
229	0.14
230	0.14
231	0.18
232	0.18
233	0.19
234	0.21
235	0.21
236	0.25
237	0.24
238	0.21
239	0.2
240	0.19
241	0.18
242	0.15
243	0.19
244	0.15
245	0.16
246	0.18
247	0.15
248	0.16
249	0.18
250	0.19
251	0.15
252	0.18
253	0.19
254	0.2
255	0.25
256	0.31
257	0.39
258	0.38
259	0.37
260	0.33
261	0.33
262	0.34
263	0.29
264	0.26
265	0.2
266	0.25
267	0.24
268	0.3
269	0.3
270	0.27
271	0.3
272	0.3
273	0.28
274	0.22
275	0.23
276	0.18
277	0.17
278	0.18
279	0.14
280	0.13
281	0.12
282	0.15
283	0.14
284	0.15
285	0.13
286	0.16
287	0.19
288	0.19
289	0.2
290	0.22
291	0.23
292	0.28
293	0.35
294	0.32
295	0.29
296	0.31
297	0.31
298	0.27
299	0.27
300	0.24
301	0.19
302	0.18
303	0.17
304	0.15
305	0.18
306	0.17
307	0.16
308	0.14
309	0.14
310	0.14
311	0.16
312	0.17
313	0.14
314	0.13
315	0.13
316	0.11
317	0.1
318	0.1
319	0.08
320	0.09
321	0.09
322	0.1
323	0.09
324	0.1
325	0.11
326	0.15
327	0.16
328	0.17
329	0.18
330	0.2
331	0.2
332	0.2
333	0.2
334	0.16
335	0.16
336	0.12
337	0.12
338	0.11
339	0.15
340	0.15
341	0.17
342	0.16
343	0.17
344	0.22
345	0.23
346	0.26
347	0.23
348	0.23
349	0.21
350	0.21
351	0.19
352	0.17
353	0.16
354	0.13
355	0.14
356	0.14
357	0.13
358	0.13
359	0.15
360	0.19
361	0.18
362	0.18
363	0.17
364	0.19
365	0.23
366	0.27
367	0.26
368	0.19
369	0.22
370	0.21
371	0.29
372	0.3
373	0.28
374	0.29
375	0.28
376	0.29
377	0.3
378	0.33
379	0.25
380	0.24
381	0.23
382	0.2
383	0.2
384	0.19
385	0.18
386	0.17
387	0.19
388	0.2
389	0.23
390	0.22
391	0.24
392	0.24
393	0.2
394	0.18
395	0.15
396	0.13
397	0.09
398	0.07
399	0.08
400	0.07
401	0.08
402	0.09
403	0.11
404	0.11
405	0.16
406	0.19
407	0.19
408	0.24
409	0.29
410	0.29
411	0.29
412	0.28
413	0.23
414	0.2
415	0.19
416	0.18
417	0.13
418	0.17
419	0.17
420	0.19
421	0.26
422	0.29
423	0.34
424	0.34
425	0.36
426	0.36
427	0.4
428	0.4
429	0.34
430	0.32
431	0.32
432	0.36
433	0.39
434	0.45
435	0.46
436	0.51
437	0.56
438	0.62
439	0.6
440	0.6
441	0.64
442	0.62
443	0.63
444	0.61
445	0.65
446	0.67
447	0.66
448	0.62
449	0.55
450	0.53
451	0.45
452	0.4
453	0.4
454	0.33
455	0.39
456	0.39
457	0.38
458	0.32
459	0.32
460	0.32
461	0.23
462	0.21
463	0.14
464	0.11
465	0.09
466	0.09
467	0.08
468	0.08
469	0.09
470	0.09
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.03
478	0.03
479	0.03
480	0.03
481	0.08
482	0.1
483	0.1
484	0.11
485	0.12
486	0.14
487	0.15
488	0.17
489	0.17
490	0.22
491	0.26
492	0.33
493	0.34
494	0.34
495	0.34
496	0.35
497	0.37
498	0.34
499	0.37
500	0.37
501	0.43
502	0.43
503	0.46
504	0.53
505	0.52
506	0.55
507	0.52
508	0.51
509	0.5
510	0.53
511	0.52
512	0.45
513	0.4
514	0.34
515	0.33
516	0.29
517	0.23
518	0.2
519	0.19
520	0.26
521	0.27
522	0.33
523	0.33
524	0.34
525	0.4
526	0.45
527	0.44
528	0.36
529	0.35
530	0.3
531	0.25
532	0.23
533	0.16
534	0.08
535	0.07
536	0.07
537	0.07
538	0.07
539	0.07
540	0.11
541	0.12
542	0.19
543	0.25
544	0.36
545	0.45
546	0.51
547	0.61
548	0.68
549	0.75
550	0.78
551	0.76
552	0.68
553	0.64
554	0.61
555	0.54
556	0.49
557	0.45
558	0.39
559	0.42
560	0.41
561	0.37
562	0.34
563	0.31
564	0.25
565	0.21
566	0.18
567	0.12
568	0.1
569	0.1
570	0.1
571	0.12
572	0.17
573	0.2
574	0.21
575	0.24
576	0.31
577	0.31
578	0.34
579	0.35
580	0.33
581	0.37
582	0.36
583	0.38
584	0.38
585	0.37
586	0.34
587	0.31
588	0.28

C4V9A7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer