Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4V8W5

Protein Details
Accession C4V8W5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-193ISETVKRKAIIKKTKSKRYRRNIKITNTHVKGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
166-182KRKAIIKKTKSKRYRRN
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.333, cyto 5, cyto_mito 4.333, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG nce:NCER_100965  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02186  TFIIE_beta  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
Amino Acid Sequences MQIDQDKHINSYLHEILTFLKSSANAISFTDLYSKLNIDIHSNTRLLKALENNDKILIKNNFIQYLYTYNIQSKEDLINIFSKRKEGIELSKLRDNPIDISDFLDDFLILKDNDGIEVVFYDDMRIDKADDDIVALWKSVRVPGFQDLISEMSVAGIKTNISETVKRKAIIKKTKSKRYRRNIKITNTHVKGLDLNKLDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.21
4 0.22
5 0.22
6 0.15
7 0.14
8 0.13
9 0.15
10 0.17
11 0.16
12 0.14
13 0.14
14 0.17
15 0.15
16 0.16
17 0.18
18 0.15
19 0.15
20 0.16
21 0.15
22 0.14
23 0.16
24 0.16
25 0.17
26 0.2
27 0.22
28 0.24
29 0.25
30 0.24
31 0.22
32 0.24
33 0.21
34 0.21
35 0.23
36 0.28
37 0.36
38 0.37
39 0.37
40 0.37
41 0.37
42 0.34
43 0.36
44 0.3
45 0.24
46 0.27
47 0.28
48 0.27
49 0.26
50 0.27
51 0.2
52 0.21
53 0.21
54 0.18
55 0.16
56 0.17
57 0.18
58 0.18
59 0.17
60 0.16
61 0.15
62 0.15
63 0.14
64 0.13
65 0.16
66 0.17
67 0.2
68 0.18
69 0.18
70 0.17
71 0.18
72 0.19
73 0.16
74 0.2
75 0.25
76 0.29
77 0.32
78 0.35
79 0.35
80 0.34
81 0.32
82 0.28
83 0.21
84 0.18
85 0.16
86 0.12
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.09
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.11
127 0.11
128 0.1
129 0.13
130 0.17
131 0.19
132 0.18
133 0.18
134 0.16
135 0.17
136 0.16
137 0.13
138 0.09
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.1
148 0.12
149 0.18
150 0.22
151 0.3
152 0.34
153 0.34
154 0.4
155 0.45
156 0.53
157 0.58
158 0.64
159 0.67
160 0.73
161 0.83
162 0.87
163 0.9
164 0.91
165 0.91
166 0.92
167 0.92
168 0.93
169 0.91
170 0.91
171 0.9
172 0.88
173 0.88
174 0.81
175 0.74
176 0.63
177 0.56
178 0.51
179 0.44
180 0.43