Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4VAV9

Protein Details
Accession C4VAV9    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
139-179DEDIVRKKRPIKRKSFSKLKKKPKVVEKKKSTKKASSKNNSBasic
335-359ENYNEKVKKVIKIKKERSKILNDILHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
144-174RKKRPIKRKSFSKLKKKPKVVEKKKSTKKAS
346-349KIKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010776  Hop2_WH_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0090304  P:nucleic acid metabolic process  
KEGG nce:NCER_101844  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07106  TBPIP  
Amino Acid Sequences MNIKKEENDFDIEDSMKCTLSCLSKEDEDMFCNSQEFYMSQENKNNVGDINFTNKRNNGYVNEQENNDSLENKDSSENKDSLENKDSSENKDSLENKDSSENKDSSENKDSLENKGSSENKDSLEEESDLEDLTTESSDEDIVRKKRPIKRKSFSKLKKKPKVVEKKKSTKKASSKNNSDTQEEVNKYNLKNDELKVFDFLYNINRPVSSAELLLNFKKQITNSSLQTICTKLEEKGLIIMKLYAKTKIYMISPSVFDMSELETNKNKLKVLADENELLKKTYISLNNEYKNFQSMDTEEELDNKIDELNKKITILQDRVQLRDEGLLVSKKEIENYNEKVKKVIKIKKERSKILNDILEMLCENMNIKKKELVEELELEM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.22
3 0.17
4 0.15
5 0.14
6 0.16
7 0.2
8 0.22
9 0.23
10 0.27
11 0.28
12 0.32
13 0.34
14 0.32
15 0.29
16 0.31
17 0.3
18 0.26
19 0.24
20 0.22
21 0.18
22 0.17
23 0.15
24 0.16
25 0.24
26 0.27
27 0.31
28 0.37
29 0.4
30 0.41
31 0.42
32 0.38
33 0.29
34 0.26
35 0.25
36 0.21
37 0.27
38 0.29
39 0.31
40 0.35
41 0.37
42 0.4
43 0.39
44 0.42
45 0.37
46 0.39
47 0.45
48 0.47
49 0.48
50 0.45
51 0.44
52 0.4
53 0.38
54 0.31
55 0.24
56 0.18
57 0.19
58 0.19
59 0.18
60 0.22
61 0.22
62 0.27
63 0.31
64 0.31
65 0.27
66 0.34
67 0.35
68 0.36
69 0.39
70 0.34
71 0.3
72 0.37
73 0.39
74 0.38
75 0.41
76 0.36
77 0.31
78 0.37
79 0.38
80 0.36
81 0.39
82 0.34
83 0.3
84 0.37
85 0.39
86 0.38
87 0.41
88 0.36
89 0.32
90 0.39
91 0.39
92 0.38
93 0.42
94 0.37
95 0.32
96 0.38
97 0.38
98 0.35
99 0.39
100 0.33
101 0.28
102 0.34
103 0.36
104 0.31
105 0.34
106 0.32
107 0.27
108 0.29
109 0.28
110 0.23
111 0.23
112 0.21
113 0.17
114 0.15
115 0.14
116 0.12
117 0.11
118 0.09
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.07
128 0.14
129 0.17
130 0.21
131 0.26
132 0.34
133 0.42
134 0.52
135 0.6
136 0.64
137 0.71
138 0.78
139 0.83
140 0.86
141 0.88
142 0.89
143 0.89
144 0.9
145 0.9
146 0.88
147 0.86
148 0.85
149 0.87
150 0.86
151 0.87
152 0.86
153 0.87
154 0.88
155 0.89
156 0.85
157 0.83
158 0.82
159 0.81
160 0.81
161 0.8
162 0.79
163 0.76
164 0.77
165 0.7
166 0.62
167 0.54
168 0.46
169 0.42
170 0.35
171 0.3
172 0.26
173 0.27
174 0.25
175 0.27
176 0.26
177 0.22
178 0.23
179 0.23
180 0.24
181 0.23
182 0.23
183 0.2
184 0.2
185 0.18
186 0.14
187 0.14
188 0.15
189 0.15
190 0.16
191 0.14
192 0.13
193 0.13
194 0.14
195 0.15
196 0.11
197 0.1
198 0.09
199 0.12
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.13
207 0.15
208 0.18
209 0.22
210 0.22
211 0.27
212 0.27
213 0.27
214 0.28
215 0.25
216 0.2
217 0.18
218 0.18
219 0.13
220 0.16
221 0.15
222 0.14
223 0.18
224 0.19
225 0.17
226 0.16
227 0.17
228 0.16
229 0.18
230 0.19
231 0.16
232 0.15
233 0.16
234 0.17
235 0.17
236 0.17
237 0.16
238 0.18
239 0.17
240 0.17
241 0.17
242 0.17
243 0.15
244 0.13
245 0.12
246 0.12
247 0.14
248 0.15
249 0.16
250 0.18
251 0.21
252 0.24
253 0.25
254 0.23
255 0.22
256 0.23
257 0.26
258 0.3
259 0.31
260 0.31
261 0.32
262 0.33
263 0.34
264 0.32
265 0.27
266 0.21
267 0.17
268 0.16
269 0.19
270 0.23
271 0.26
272 0.33
273 0.41
274 0.46
275 0.48
276 0.48
277 0.42
278 0.4
279 0.35
280 0.27
281 0.22
282 0.18
283 0.21
284 0.22
285 0.23
286 0.19
287 0.2
288 0.21
289 0.19
290 0.18
291 0.13
292 0.12
293 0.15
294 0.17
295 0.2
296 0.23
297 0.23
298 0.24
299 0.26
300 0.3
301 0.33
302 0.36
303 0.34
304 0.38
305 0.39
306 0.41
307 0.41
308 0.36
309 0.29
310 0.27
311 0.24
312 0.17
313 0.19
314 0.21
315 0.19
316 0.2
317 0.23
318 0.22
319 0.25
320 0.28
321 0.29
322 0.33
323 0.38
324 0.48
325 0.49
326 0.48
327 0.51
328 0.51
329 0.54
330 0.56
331 0.59
332 0.59
333 0.66
334 0.76
335 0.81
336 0.85
337 0.86
338 0.84
339 0.85
340 0.82
341 0.8
342 0.74
343 0.64
344 0.6
345 0.51
346 0.44
347 0.35
348 0.29
349 0.2
350 0.14
351 0.15
352 0.16
353 0.25
354 0.25
355 0.28
356 0.32
357 0.34
358 0.4
359 0.44
360 0.42
361 0.39