Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q2HCC4

Protein Details
Accession Q2HCC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
469-493NSRLRAENGRQKRKRARRAFIQTGGHydrophilic
1049-1071ACRKIQQRLSSRRGNRGRPRTLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
477-486GRQKRKRARR
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 7, nucl 6, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR007889  HTH_Psq  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
PF05225  HTH_psq  
Amino Acid Sequences MPKPLQHEDRIQLALEALRSGQIKIIRNAADAFGVPKSTLHRRVKGGGTRQEAQVKNRKLRPTEEAALIQWDRVIGTTVGCRRRSVISDRWLTFFSASVEGFTLLDASQLTSTPVPAMTVGENWVQRLLHRHPHLETKYSRKYDYQRALCEDPEKISAWFARVQRTINEYGVLDSDIYNFDETGFQMGVASTSKVVTRSDRRNRPVVIQPGNREWTTVIECINASGWSVDPMIIFEGKVHISSWYDGSVLPKTWRIGVSDNGWTTDELTFEWLREVFEPQTRKRTVGRYRLLILDGHGSHSTPAFDKFCTEHRILTECMPPHSSHYLQPLDVSCFAVLKRTYGDLVKAKIALGVHHIDKPRFLELFLEARKKTFNTKNIASGFRAAGLLPFDPTQVLCRLQTRIRTPSPPPTPIQPPSLPLKTPANIVELDSLQRKHQREIIPTDQALQKIIKGCQMAMHNATLLQEENSRLRAENGRQKRKRARRAFIQTGGTMTIGEGMTHIEASQNARQKGQGSQEARREVEEGEVGPSDTTAPKARKRAQPKCSWIPDLMKPRTSSFSGLSPYNFAPLCCGCSLVCVELGHAYSKLSKHAGLASGQVVVRTWAVPALHHAIRRAVDRMAGSLRLRLRLQSSRYTYHAMNRNPAPTFACKDTRVKKEWPGDSRRAADALICDYMDESDIKMITAVYENIVAAVKGETTILEYKIRDDLLNKHYKYCLDAEAANRCLAAMAQQTTDRYPHARISKSTPGTSSATIKRVLEAISDRISSPAGISYCWSSQTRWLWSSMIFGAAPEWWLGVDNARELAPIASPSPRHSALRKAGFAGVDAITAGSTAWLRRPRFWRLRHLDGRARFLRRLLAAPASSQPLPPPPPIVESLVFAGFADDTNLLVFGRNPEANVRQLEAAWETWEAPAPLNQKGLPGSWESGWTGNSTGKAHLVAVEKKLRTPELCPVEDRGKDMGDGASQSARSVHKVHPVGAGLWRIIVSHPHGCGEGEPAKKGITKALGKAQNKSLRIVADFENRLQRPDLDDGRGGKKTAASVVLTACRKIQQRLSSRRGNRGRPRTLGPQGPTAVERAAGTETLFRNETLRRHDGLSKAKSSLLIQIRTGAIGLRDFLFTRGVPEVLTPACECGEGRETAEHLVVWCLAPPLTRRWERTGIRTRRDFYSVLHGINPTTARLARRVLDWADGLGEAADVQLSQEARAGSGGLKRPRSEARRPPLFVYVGSLKRIAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.22
3 0.18
4 0.13
5 0.15
6 0.15
7 0.15
8 0.18
9 0.22
10 0.27
11 0.3
12 0.37
13 0.34
14 0.36
15 0.37
16 0.33
17 0.29
18 0.23
19 0.22
20 0.17
21 0.16
22 0.14
23 0.15
24 0.2
25 0.28
26 0.38
27 0.44
28 0.49
29 0.54
30 0.61
31 0.68
32 0.71
33 0.71
34 0.7
35 0.68
36 0.65
37 0.65
38 0.68
39 0.63
40 0.63
41 0.63
42 0.64
43 0.66
44 0.7
45 0.72
46 0.68
47 0.7
48 0.68
49 0.67
50 0.63
51 0.59
52 0.54
53 0.46
54 0.48
55 0.42
56 0.35
57 0.27
58 0.21
59 0.16
60 0.14
61 0.16
62 0.09
63 0.11
64 0.18
65 0.26
66 0.33
67 0.34
68 0.35
69 0.35
70 0.4
71 0.44
72 0.44
73 0.45
74 0.47
75 0.55
76 0.56
77 0.56
78 0.52
79 0.48
80 0.41
81 0.34
82 0.27
83 0.21
84 0.19
85 0.17
86 0.17
87 0.16
88 0.15
89 0.13
90 0.11
91 0.07
92 0.08
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.11
98 0.1
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.12
105 0.1
106 0.11
107 0.13
108 0.17
109 0.17
110 0.17
111 0.19
112 0.18
113 0.18
114 0.25
115 0.29
116 0.34
117 0.38
118 0.42
119 0.43
120 0.53
121 0.55
122 0.56
123 0.56
124 0.57
125 0.62
126 0.62
127 0.62
128 0.59
129 0.63
130 0.66
131 0.7
132 0.68
133 0.64
134 0.67
135 0.67
136 0.62
137 0.57
138 0.49
139 0.41
140 0.36
141 0.3
142 0.24
143 0.24
144 0.22
145 0.22
146 0.26
147 0.26
148 0.31
149 0.32
150 0.34
151 0.34
152 0.39
153 0.4
154 0.35
155 0.34
156 0.27
157 0.25
158 0.24
159 0.2
160 0.15
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.11
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.08
179 0.08
180 0.1
181 0.11
182 0.13
183 0.2
184 0.28
185 0.39
186 0.49
187 0.58
188 0.63
189 0.69
190 0.69
191 0.68
192 0.68
193 0.67
194 0.66
195 0.62
196 0.62
197 0.61
198 0.63
199 0.57
200 0.48
201 0.39
202 0.34
203 0.31
204 0.27
205 0.21
206 0.17
207 0.17
208 0.17
209 0.17
210 0.13
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.13
230 0.14
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.15
235 0.16
236 0.17
237 0.18
238 0.2
239 0.2
240 0.23
241 0.23
242 0.23
243 0.24
244 0.26
245 0.28
246 0.3
247 0.3
248 0.28
249 0.28
250 0.25
251 0.24
252 0.2
253 0.17
254 0.11
255 0.14
256 0.13
257 0.12
258 0.14
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.16
263 0.15
264 0.21
265 0.27
266 0.29
267 0.38
268 0.39
269 0.41
270 0.43
271 0.5
272 0.54
273 0.58
274 0.6
275 0.56
276 0.57
277 0.56
278 0.52
279 0.42
280 0.34
281 0.3
282 0.23
283 0.22
284 0.19
285 0.17
286 0.16
287 0.17
288 0.17
289 0.12
290 0.16
291 0.14
292 0.14
293 0.16
294 0.18
295 0.22
296 0.26
297 0.26
298 0.25
299 0.26
300 0.29
301 0.29
302 0.3
303 0.31
304 0.27
305 0.28
306 0.28
307 0.26
308 0.27
309 0.31
310 0.29
311 0.26
312 0.32
313 0.31
314 0.29
315 0.31
316 0.28
317 0.26
318 0.25
319 0.23
320 0.16
321 0.15
322 0.15
323 0.18
324 0.16
325 0.14
326 0.15
327 0.15
328 0.17
329 0.17
330 0.22
331 0.21
332 0.23
333 0.23
334 0.22
335 0.21
336 0.21
337 0.2
338 0.15
339 0.15
340 0.16
341 0.16
342 0.2
343 0.23
344 0.22
345 0.24
346 0.25
347 0.25
348 0.22
349 0.2
350 0.18
351 0.18
352 0.25
353 0.27
354 0.31
355 0.27
356 0.28
357 0.3
358 0.3
359 0.35
360 0.36
361 0.39
362 0.4
363 0.43
364 0.49
365 0.51
366 0.53
367 0.45
368 0.4
369 0.33
370 0.26
371 0.24
372 0.16
373 0.13
374 0.12
375 0.1
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.11
383 0.13
384 0.13
385 0.15
386 0.19
387 0.22
388 0.28
389 0.32
390 0.37
391 0.39
392 0.43
393 0.44
394 0.51
395 0.53
396 0.5
397 0.47
398 0.44
399 0.47
400 0.45
401 0.47
402 0.38
403 0.35
404 0.38
405 0.39
406 0.34
407 0.31
408 0.32
409 0.27
410 0.28
411 0.26
412 0.22
413 0.19
414 0.2
415 0.18
416 0.14
417 0.15
418 0.16
419 0.16
420 0.18
421 0.24
422 0.25
423 0.26
424 0.32
425 0.35
426 0.38
427 0.45
428 0.47
429 0.45
430 0.43
431 0.44
432 0.39
433 0.34
434 0.3
435 0.22
436 0.19
437 0.18
438 0.18
439 0.19
440 0.17
441 0.16
442 0.19
443 0.2
444 0.21
445 0.19
446 0.18
447 0.15
448 0.15
449 0.15
450 0.12
451 0.1
452 0.08
453 0.08
454 0.1
455 0.11
456 0.12
457 0.12
458 0.12
459 0.14
460 0.19
461 0.24
462 0.32
463 0.41
464 0.51
465 0.55
466 0.64
467 0.72
468 0.78
469 0.82
470 0.82
471 0.8
472 0.79
473 0.84
474 0.83
475 0.77
476 0.7
477 0.59
478 0.5
479 0.43
480 0.32
481 0.22
482 0.14
483 0.11
484 0.08
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.04
492 0.05
493 0.09
494 0.13
495 0.18
496 0.19
497 0.2
498 0.21
499 0.22
500 0.25
501 0.26
502 0.3
503 0.28
504 0.33
505 0.39
506 0.41
507 0.39
508 0.36
509 0.32
510 0.25
511 0.22
512 0.17
513 0.12
514 0.1
515 0.09
516 0.09
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.06
521 0.08
522 0.12
523 0.16
524 0.2
525 0.29
526 0.36
527 0.43
528 0.54
529 0.62
530 0.65
531 0.71
532 0.74
533 0.75
534 0.72
535 0.67
536 0.59
537 0.53
538 0.52
539 0.52
540 0.47
541 0.41
542 0.38
543 0.37
544 0.37
545 0.34
546 0.29
547 0.21
548 0.21
549 0.2
550 0.2
551 0.19
552 0.18
553 0.17
554 0.17
555 0.16
556 0.13
557 0.13
558 0.12
559 0.14
560 0.11
561 0.12
562 0.09
563 0.1
564 0.11
565 0.09
566 0.1
567 0.08
568 0.08
569 0.08
570 0.09
571 0.08
572 0.08
573 0.08
574 0.09
575 0.09
576 0.11
577 0.11
578 0.11
579 0.11
580 0.12
581 0.13
582 0.11
583 0.12
584 0.11
585 0.11
586 0.11
587 0.1
588 0.09
589 0.08
590 0.08
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.06
596 0.08
597 0.12
598 0.14
599 0.15
600 0.15
601 0.16
602 0.17
603 0.18
604 0.18
605 0.13
606 0.13
607 0.13
608 0.14
609 0.13
610 0.14
611 0.13
612 0.15
613 0.16
614 0.17
615 0.17
616 0.16
617 0.2
618 0.22
619 0.26
620 0.29
621 0.32
622 0.32
623 0.34
624 0.35
625 0.32
626 0.34
627 0.38
628 0.32
629 0.34
630 0.33
631 0.34
632 0.32
633 0.32
634 0.27
635 0.22
636 0.24
637 0.22
638 0.23
639 0.23
640 0.3
641 0.37
642 0.4
643 0.42
644 0.43
645 0.47
646 0.51
647 0.56
648 0.56
649 0.55
650 0.54
651 0.54
652 0.53
653 0.46
654 0.38
655 0.31
656 0.25
657 0.19
658 0.15
659 0.11
660 0.08
661 0.08
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.06
666 0.05
667 0.05
668 0.05
669 0.05
670 0.05
671 0.05
672 0.05
673 0.06
674 0.06
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.06
679 0.06
680 0.05
681 0.05
682 0.05
683 0.04
684 0.04
685 0.04
686 0.03
687 0.06
688 0.07
689 0.08
690 0.1
691 0.1
692 0.11
693 0.13
694 0.14
695 0.12
696 0.13
697 0.18
698 0.25
699 0.33
700 0.33
701 0.33
702 0.34
703 0.34
704 0.34
705 0.29
706 0.23
707 0.16
708 0.18
709 0.2
710 0.23
711 0.24
712 0.22
713 0.2
714 0.17
715 0.15
716 0.13
717 0.12
718 0.09
719 0.09
720 0.1
721 0.11
722 0.12
723 0.13
724 0.14
725 0.13
726 0.13
727 0.14
728 0.19
729 0.24
730 0.26
731 0.27
732 0.34
733 0.41
734 0.42
735 0.41
736 0.36
737 0.34
738 0.33
739 0.33
740 0.31
741 0.26
742 0.25
743 0.26
744 0.25
745 0.22
746 0.21
747 0.19
748 0.16
749 0.14
750 0.15
751 0.15
752 0.15
753 0.15
754 0.14
755 0.14
756 0.12
757 0.1
758 0.1
759 0.09
760 0.08
761 0.09
762 0.11
763 0.11
764 0.14
765 0.15
766 0.13
767 0.19
768 0.23
769 0.27
770 0.26
771 0.27
772 0.25
773 0.24
774 0.26
775 0.2
776 0.16
777 0.11
778 0.1
779 0.09
780 0.08
781 0.08
782 0.06
783 0.05
784 0.04
785 0.05
786 0.05
787 0.07
788 0.07
789 0.07
790 0.08
791 0.08
792 0.08
793 0.08
794 0.08
795 0.07
796 0.07
797 0.08
798 0.09
799 0.1
800 0.13
801 0.18
802 0.19
803 0.22
804 0.23
805 0.3
806 0.36
807 0.41
808 0.4
809 0.36
810 0.36
811 0.33
812 0.32
813 0.26
814 0.17
815 0.11
816 0.1
817 0.08
818 0.06
819 0.06
820 0.05
821 0.04
822 0.04
823 0.05
824 0.1
825 0.18
826 0.2
827 0.26
828 0.32
829 0.41
830 0.5
831 0.56
832 0.61
833 0.62
834 0.71
835 0.72
836 0.74
837 0.72
838 0.66
839 0.69
840 0.64
841 0.6
842 0.51
843 0.44
844 0.41
845 0.35
846 0.33
847 0.28
848 0.25
849 0.22
850 0.22
851 0.23
852 0.22
853 0.21
854 0.19
855 0.18
856 0.19
857 0.22
858 0.21
859 0.22
860 0.2
861 0.22
862 0.24
863 0.26
864 0.21
865 0.19
866 0.2
867 0.17
868 0.15
869 0.13
870 0.11
871 0.08
872 0.07
873 0.07
874 0.05
875 0.05
876 0.05
877 0.06
878 0.05
879 0.06
880 0.06
881 0.07
882 0.11
883 0.11
884 0.12
885 0.16
886 0.19
887 0.22
888 0.23
889 0.22
890 0.19
891 0.18
892 0.19
893 0.17
894 0.15
895 0.12
896 0.12
897 0.11
898 0.1
899 0.12
900 0.11
901 0.1
902 0.14
903 0.15
904 0.16
905 0.18
906 0.18
907 0.18
908 0.19
909 0.19
910 0.16
911 0.16
912 0.16
913 0.15
914 0.16
915 0.15
916 0.16
917 0.15
918 0.15
919 0.14
920 0.14
921 0.16
922 0.15
923 0.15
924 0.15
925 0.15
926 0.14
927 0.17
928 0.2
929 0.21
930 0.26
931 0.32
932 0.31
933 0.33
934 0.36
935 0.35
936 0.31
937 0.31
938 0.35
939 0.35
940 0.37
941 0.36
942 0.38
943 0.41
944 0.4
945 0.4
946 0.33
947 0.26
948 0.24
949 0.23
950 0.19
951 0.14
952 0.13
953 0.12
954 0.12
955 0.11
956 0.12
957 0.14
958 0.14
959 0.16
960 0.19
961 0.21
962 0.28
963 0.3
964 0.32
965 0.32
966 0.32
967 0.3
968 0.3
969 0.29
970 0.2
971 0.18
972 0.17
973 0.13
974 0.13
975 0.14
976 0.15
977 0.17
978 0.18
979 0.18
980 0.19
981 0.19
982 0.19
983 0.22
984 0.24
985 0.23
986 0.23
987 0.23
988 0.24
989 0.26
990 0.26
991 0.24
992 0.26
993 0.27
994 0.31
995 0.39
996 0.46
997 0.46
998 0.5
999 0.55
1000 0.54
1001 0.52
1002 0.5
1003 0.44
1004 0.38
1005 0.37
1006 0.35
1007 0.31
1008 0.32
1009 0.32
1010 0.33
1011 0.39
1012 0.37
1013 0.38
1014 0.36
1015 0.33
1016 0.29
1017 0.34
1018 0.35
1019 0.29
1020 0.33
1021 0.35
1022 0.39
1023 0.4
1024 0.36
1025 0.3
1026 0.28
1027 0.26
1028 0.24
1029 0.23
1030 0.18
1031 0.18
1032 0.2
1033 0.26
1034 0.26
1035 0.25
1036 0.24
1037 0.26
1038 0.29
1039 0.33
1040 0.38
1041 0.4
1042 0.49
1043 0.59
1044 0.65
1045 0.7
1046 0.73
1047 0.78
1048 0.79
1049 0.81
1050 0.81
1051 0.81
1052 0.81
1053 0.76
1054 0.76
1055 0.75
1056 0.74
1057 0.71
1058 0.63
1059 0.59
1060 0.53
1061 0.49
1062 0.44
1063 0.36
1064 0.29
1065 0.22
1066 0.19
1067 0.14
1068 0.13
1069 0.12
1070 0.12
1071 0.16
1072 0.16
1073 0.19
1074 0.2
1075 0.19
1076 0.21
1077 0.25
1078 0.29
1079 0.32
1080 0.36
1081 0.34
1082 0.37
1083 0.42
1084 0.46
1085 0.51
1086 0.53
1087 0.49
1088 0.45
1089 0.44
1090 0.42
1091 0.39
1092 0.4
1093 0.38
1094 0.34
1095 0.3
1096 0.33
1097 0.32
1098 0.3
1099 0.29
1100 0.21
1101 0.15
1102 0.13
1103 0.14
1104 0.11
1105 0.13
1106 0.13
1107 0.14
1108 0.15
1109 0.14
1110 0.16
1111 0.17
1112 0.16
1113 0.15
1114 0.15
1115 0.18
1116 0.15
1117 0.18
1118 0.15
1119 0.14
1120 0.15
1121 0.15
1122 0.14
1123 0.15
1124 0.19
1125 0.17
1126 0.19
1127 0.2
1128 0.2
1129 0.21
1130 0.22
1131 0.18
1132 0.14
1133 0.15
1134 0.14
1135 0.12
1136 0.11
1137 0.11
1138 0.11
1139 0.13
1140 0.15
1141 0.21
1142 0.3
1143 0.36
1144 0.41
1145 0.47
1146 0.56
1147 0.58
1148 0.66
1149 0.7
1150 0.7
1151 0.73
1152 0.76
1153 0.73
1154 0.68
1155 0.67
1156 0.58
1157 0.5
1158 0.5
1159 0.45
1160 0.38
1161 0.37
1162 0.33
1163 0.3
1164 0.32
1165 0.3
1166 0.21
1167 0.21
1168 0.23
1169 0.23
1170 0.26
1171 0.3
1172 0.28
1173 0.29
1174 0.33
1175 0.31
1176 0.31
1177 0.29
1178 0.26
1179 0.22
1180 0.2
1181 0.18
1182 0.12
1183 0.1
1184 0.07
1185 0.06
1186 0.05
1187 0.04
1188 0.04
1189 0.07
1190 0.08
1191 0.08
1192 0.11
1193 0.11
1194 0.12
1195 0.12
1196 0.13
1197 0.13
1198 0.19
1199 0.27
1200 0.32
1201 0.38
1202 0.39
1203 0.45
1204 0.54
1205 0.59
1206 0.63
1207 0.66
1208 0.68
1209 0.73
1210 0.75
1211 0.73
1212 0.7
1213 0.64
1214 0.54
1215 0.5
1216 0.48
1217 0.42
1218 0.4