Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4VA16

Protein Details
Accession C4VA16    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-31STDNDIVKRRRVPRSTTKKDNLKNLFDEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.833, cyto 3.5, cyto_mito 2.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036860  SH2_dom_sf  
IPR035420  Spt6_SH2  
KEGG nce:NCER_101442  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14633  SH2_2  
Amino Acid Sequences MSDSTDNDIVKRRRVPRSTTKKDNLKNLFDEDSSTSSLEYVPEDTQQNNLFQELFGTGEEYFYIFESHKQEEEEKIKQEEISEEQFLDHMKKKTDYKDIETICKLYLQGYNIYYIFLYKTEDIDFYKFLDIYKNMLSFTTKSSDKIHLDIFNIFFDRIYNGSLCINKKDKIISLTKENFIIKGVILDGYGNLIEKFSCSGYKLISRVEEINPQYILVSGNNNIVRNVVQLLIKFRVFYMESKFYPKHSVYEKLIHVGRLGLFPEVEFINFYKNLYITSGESYNNLIYKEEIFNNDVVLTIKIAIGLVISVTKMNLDFLLQYENKLDILRFLGLENCTRIFENESYTSEEDIYKVLKDEVIYQNFMTFFTLEKKLYDRPVFTGFTDSYIFRELINIKNNIVEDLINQEIEGKVFFVDEFYVLVNILNNVTCYVRTTEKYYLNQLVRVKITEINEPFLSFTAEIVHTNKPIHKIIKHPLLCRLNSKEAEKKLINSDEIFILRQSSKDGKIIIVLKLYKNIIIHIRLEEYDNLDETVNKRVKNILRNVSNIKKHKYFYDNASEAMSKISMNCDFIRYGFYFSEEYPGRLCFIFNNNGIFKEYLSVDTKIKYKEKEYNSLEEFLEFRKRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.72
3 0.74
4 0.81
5 0.83
6 0.85
7 0.86
8 0.86
9 0.87
10 0.88
11 0.86
12 0.81
13 0.76
14 0.7
15 0.63
16 0.53
17 0.49
18 0.41
19 0.36
20 0.31
21 0.26
22 0.21
23 0.18
24 0.18
25 0.16
26 0.14
27 0.13
28 0.13
29 0.16
30 0.19
31 0.19
32 0.23
33 0.25
34 0.26
35 0.24
36 0.24
37 0.21
38 0.18
39 0.19
40 0.14
41 0.13
42 0.1
43 0.11
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.1
51 0.09
52 0.14
53 0.18
54 0.21
55 0.22
56 0.25
57 0.27
58 0.33
59 0.39
60 0.41
61 0.41
62 0.41
63 0.4
64 0.38
65 0.37
66 0.33
67 0.31
68 0.29
69 0.26
70 0.23
71 0.22
72 0.22
73 0.22
74 0.24
75 0.25
76 0.25
77 0.28
78 0.33
79 0.39
80 0.45
81 0.54
82 0.55
83 0.55
84 0.6
85 0.59
86 0.61
87 0.57
88 0.52
89 0.42
90 0.38
91 0.31
92 0.25
93 0.24
94 0.2
95 0.21
96 0.2
97 0.23
98 0.22
99 0.22
100 0.19
101 0.16
102 0.15
103 0.11
104 0.14
105 0.11
106 0.13
107 0.14
108 0.16
109 0.18
110 0.19
111 0.19
112 0.18
113 0.19
114 0.17
115 0.16
116 0.2
117 0.19
118 0.2
119 0.23
120 0.22
121 0.2
122 0.21
123 0.23
124 0.19
125 0.21
126 0.23
127 0.2
128 0.21
129 0.25
130 0.31
131 0.31
132 0.32
133 0.33
134 0.3
135 0.31
136 0.32
137 0.29
138 0.24
139 0.23
140 0.2
141 0.16
142 0.14
143 0.14
144 0.12
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.13
149 0.18
150 0.2
151 0.24
152 0.28
153 0.28
154 0.3
155 0.32
156 0.32
157 0.33
158 0.38
159 0.36
160 0.41
161 0.43
162 0.42
163 0.44
164 0.41
165 0.35
166 0.29
167 0.26
168 0.16
169 0.13
170 0.12
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.1
187 0.12
188 0.16
189 0.18
190 0.18
191 0.19
192 0.2
193 0.21
194 0.22
195 0.27
196 0.24
197 0.25
198 0.23
199 0.22
200 0.2
201 0.17
202 0.16
203 0.1
204 0.11
205 0.09
206 0.14
207 0.16
208 0.17
209 0.16
210 0.16
211 0.15
212 0.14
213 0.14
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.14
218 0.16
219 0.16
220 0.15
221 0.14
222 0.15
223 0.16
224 0.17
225 0.2
226 0.23
227 0.24
228 0.29
229 0.3
230 0.29
231 0.33
232 0.32
233 0.3
234 0.29
235 0.34
236 0.31
237 0.37
238 0.36
239 0.35
240 0.35
241 0.3
242 0.27
243 0.22
244 0.19
245 0.14
246 0.14
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.11
263 0.09
264 0.1
265 0.12
266 0.11
267 0.12
268 0.13
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.1
273 0.09
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.12
281 0.12
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.1
306 0.09
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.06
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.09
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.12
327 0.12
328 0.15
329 0.15
330 0.16
331 0.19
332 0.2
333 0.19
334 0.17
335 0.16
336 0.13
337 0.12
338 0.11
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.13
345 0.19
346 0.2
347 0.21
348 0.2
349 0.22
350 0.21
351 0.21
352 0.15
353 0.09
354 0.08
355 0.11
356 0.14
357 0.13
358 0.14
359 0.17
360 0.19
361 0.26
362 0.27
363 0.25
364 0.25
365 0.29
366 0.29
367 0.27
368 0.28
369 0.22
370 0.21
371 0.21
372 0.18
373 0.15
374 0.15
375 0.15
376 0.11
377 0.14
378 0.14
379 0.18
380 0.23
381 0.23
382 0.21
383 0.23
384 0.23
385 0.2
386 0.19
387 0.13
388 0.09
389 0.11
390 0.12
391 0.09
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.05
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.11
419 0.14
420 0.16
421 0.21
422 0.27
423 0.32
424 0.35
425 0.38
426 0.43
427 0.41
428 0.44
429 0.42
430 0.39
431 0.35
432 0.33
433 0.3
434 0.26
435 0.26
436 0.29
437 0.27
438 0.27
439 0.26
440 0.25
441 0.24
442 0.2
443 0.2
444 0.13
445 0.11
446 0.1
447 0.11
448 0.12
449 0.15
450 0.16
451 0.17
452 0.19
453 0.22
454 0.24
455 0.28
456 0.32
457 0.33
458 0.38
459 0.45
460 0.53
461 0.55
462 0.53
463 0.58
464 0.59
465 0.58
466 0.58
467 0.55
468 0.53
469 0.51
470 0.55
471 0.53
472 0.5
473 0.55
474 0.5
475 0.46
476 0.45
477 0.45
478 0.42
479 0.35
480 0.33
481 0.28
482 0.28
483 0.25
484 0.18
485 0.18
486 0.16
487 0.15
488 0.18
489 0.2
490 0.21
491 0.24
492 0.24
493 0.21
494 0.27
495 0.29
496 0.26
497 0.27
498 0.28
499 0.26
500 0.3
501 0.3
502 0.27
503 0.24
504 0.25
505 0.25
506 0.25
507 0.26
508 0.23
509 0.25
510 0.23
511 0.26
512 0.24
513 0.22
514 0.21
515 0.2
516 0.19
517 0.17
518 0.18
519 0.17
520 0.25
521 0.25
522 0.24
523 0.24
524 0.31
525 0.38
526 0.45
527 0.53
528 0.53
529 0.54
530 0.6
531 0.68
532 0.69
533 0.72
534 0.71
535 0.69
536 0.66
537 0.63
538 0.64
539 0.63
540 0.59
541 0.57
542 0.6
543 0.53
544 0.48
545 0.49
546 0.42
547 0.35
548 0.31
549 0.24
550 0.14
551 0.13
552 0.17
553 0.15
554 0.18
555 0.19
556 0.2
557 0.2
558 0.21
559 0.25
560 0.22
561 0.24
562 0.21
563 0.23
564 0.22
565 0.22
566 0.3
567 0.25
568 0.26
569 0.23
570 0.24
571 0.23
572 0.21
573 0.21
574 0.17
575 0.22
576 0.28
577 0.29
578 0.34
579 0.34
580 0.35
581 0.38
582 0.34
583 0.28
584 0.24
585 0.23
586 0.21
587 0.23
588 0.25
589 0.24
590 0.28
591 0.33
592 0.37
593 0.42
594 0.43
595 0.47
596 0.53
597 0.58
598 0.65
599 0.65
600 0.66
601 0.63
602 0.62
603 0.55
604 0.47
605 0.41
606 0.35