FuNGI

A0A1D8PKA3

Protein Details

Accession

A0A1D8PKA3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-25	DEQLESKTSKGKQNRNRNIDNDN	Hydrophilic
358-394	SPPPSQQQQQQQQKQNLFKKTKPSTKMESKRDIRARR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 6, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024337 tRNA_splic_suSen54 IPR024336 tRNA_splic_suSen54_N
Gene Ontology	GO:0000214 C:tRNA-intron endonuclease complex GO:0004519 F:endonuclease activity GO:0000379 P:tRNA-type intron splice site recognition and cleavage
KEGG	cal:CAALFM_C305800WA -
Pfam	View protein in Pfam PF12928 tRNA_int_end_N2

Amino Acid Sequences

MTDEQLESKTSKGKQNRNRNIDNDNENDNDNEDDKFQTEQVYDVEDEIQDWKFLNKSTIPKRGTKEFEPDGTNYQISALEQSQQTMFQAINNVRGHHTTKKLIGIWMIDEHDQYCFIPQIRGNYFKDLGKAINIGKFQGMKLNSLETIYLAERGSLIVYLGNQEYSDWLYNSAEVEENEDGDKNVSFDVESNLIALDLEYLYSLLTIPLANYQVYAYLKRLGYIIQEYKVQDDVMDKTLLSSSPTKDPKKLESLVQFTLWPREWGIMAYPLFHSLHFKTKHYFKYTDVFKNLKLNFKPIESDPNESNINITFNVWKPSPSFSKKTPPPPDFQLCVVDSSKNTDFLKLPQIQRLFFQLSPPPSQQQQQQQQKQNLFKKTKPSTKMESKRDIRARRYAERQAKLDKQLQLKNEYYRLRDDCFKNGGQSVIIAIVNNGIMNFISLSSGQFDSLQNVKTRLNEIYPKKIHSIIYNE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.73
3	0.81
4	0.83
5	0.86
6	0.83
7	0.79
8	0.77
9	0.73
10	0.66
11	0.6
12	0.52
13	0.45
14	0.4
15	0.35
16	0.29
17	0.24
18	0.2
19	0.17
20	0.17
21	0.17
22	0.18
23	0.17
24	0.17
25	0.16
26	0.17
27	0.16
28	0.18
29	0.17
30	0.16
31	0.17
32	0.14
33	0.14
34	0.15
35	0.14
36	0.11
37	0.11
38	0.13
39	0.14
40	0.15
41	0.19
42	0.22
43	0.32
44	0.41
45	0.5
46	0.52
47	0.57
48	0.62
49	0.66
50	0.67
51	0.62
52	0.62
53	0.57
54	0.57
55	0.54
56	0.51
57	0.46
58	0.42
59	0.38
60	0.29
61	0.25
62	0.21
63	0.17
64	0.18
65	0.14
66	0.15
67	0.15
68	0.16
69	0.16
70	0.16
71	0.16
72	0.14
73	0.13
74	0.1
75	0.17
76	0.17
77	0.24
78	0.25
79	0.26
80	0.27
81	0.31
82	0.34
83	0.34
84	0.38
85	0.35
86	0.37
87	0.4
88	0.4
89	0.38
90	0.36
91	0.3
92	0.26
93	0.24
94	0.23
95	0.18
96	0.17
97	0.16
98	0.14
99	0.14
100	0.12
101	0.11
102	0.12
103	0.12
104	0.15
105	0.16
106	0.23
107	0.27
108	0.34
109	0.34
110	0.37
111	0.38
112	0.36
113	0.36
114	0.3
115	0.27
116	0.21
117	0.22
118	0.19
119	0.21
120	0.2
121	0.19
122	0.19
123	0.2
124	0.18
125	0.21
126	0.2
127	0.18
128	0.18
129	0.2
130	0.18
131	0.17
132	0.17
133	0.11
134	0.12
135	0.1
136	0.11
137	0.09
138	0.09
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.06
143	0.06
144	0.05
145	0.05
146	0.07
147	0.07
148	0.07
149	0.06
150	0.06
151	0.07
152	0.09
153	0.1
154	0.09
155	0.1
156	0.1
157	0.1
158	0.11
159	0.1
160	0.1
161	0.08
162	0.12
163	0.1
164	0.11
165	0.11
166	0.11
167	0.1
168	0.09
169	0.09
170	0.06
171	0.06
172	0.06
173	0.05
174	0.06
175	0.08
176	0.08
177	0.08
178	0.07
179	0.07
180	0.07
181	0.07
182	0.06
183	0.05
184	0.03
185	0.03
186	0.03
187	0.03
188	0.03
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.03
193	0.03
194	0.04
195	0.05
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.09
201	0.1
202	0.11
203	0.1
204	0.14
205	0.14
206	0.14
207	0.14
208	0.12
209	0.13
210	0.16
211	0.17
212	0.14
213	0.17
214	0.17
215	0.17
216	0.17
217	0.16
218	0.11
219	0.11
220	0.12
221	0.11
222	0.11
223	0.1
224	0.1
225	0.1
226	0.1
227	0.1
228	0.11
229	0.11
230	0.18
231	0.26
232	0.27
233	0.31
234	0.34
235	0.36
236	0.39
237	0.39
238	0.37
239	0.35
240	0.38
241	0.35
242	0.33
243	0.3
244	0.25
245	0.27
246	0.22
247	0.17
248	0.13
249	0.12
250	0.12
251	0.11
252	0.11
253	0.12
254	0.11
255	0.12
256	0.12
257	0.13
258	0.13
259	0.13
260	0.15
261	0.13
262	0.21
263	0.22
264	0.24
265	0.27
266	0.34
267	0.4
268	0.43
269	0.43
270	0.37
271	0.43
272	0.48
273	0.5
274	0.49
275	0.44
276	0.4
277	0.47
278	0.47
279	0.47
280	0.4
281	0.39
282	0.35
283	0.34
284	0.35
285	0.28
286	0.35
287	0.29
288	0.32
289	0.28
290	0.3
291	0.29
292	0.26
293	0.26
294	0.17
295	0.16
296	0.12
297	0.13
298	0.12
299	0.13
300	0.17
301	0.16
302	0.17
303	0.17
304	0.21
305	0.29
306	0.32
307	0.35
308	0.36
309	0.46
310	0.53
311	0.62
312	0.67
313	0.62
314	0.61
315	0.64
316	0.66
317	0.58
318	0.53
319	0.47
320	0.37
321	0.37
322	0.33
323	0.26
324	0.21
325	0.24
326	0.23
327	0.24
328	0.23
329	0.23
330	0.23
331	0.24
332	0.32
333	0.33
334	0.34
335	0.36
336	0.39
337	0.37
338	0.37
339	0.39
340	0.35
341	0.28
342	0.3
343	0.29
344	0.3
345	0.34
346	0.36
347	0.34
348	0.32
349	0.36
350	0.38
351	0.43
352	0.49
353	0.55
354	0.62
355	0.68
356	0.73
357	0.77
358	0.8
359	0.78
360	0.78
361	0.74
362	0.69
363	0.7
364	0.72
365	0.74
366	0.71
367	0.7
368	0.69
369	0.73
370	0.79
371	0.77
372	0.78
373	0.74
374	0.78
375	0.8
376	0.8
377	0.75
378	0.75
379	0.74
380	0.72
381	0.75
382	0.75
383	0.75
384	0.73
385	0.72
386	0.71
387	0.71
388	0.69
389	0.68
390	0.64
391	0.62
392	0.61
393	0.6
394	0.58
395	0.56
396	0.55
397	0.56
398	0.55
399	0.49
400	0.52
401	0.51
402	0.48
403	0.52
404	0.5
405	0.49
406	0.5
407	0.48
408	0.44
409	0.42
410	0.38
411	0.3
412	0.26
413	0.2
414	0.17
415	0.16
416	0.12
417	0.1
418	0.1
419	0.1
420	0.09
421	0.08
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.07
426	0.06
427	0.07
428	0.07
429	0.08
430	0.11
431	0.12
432	0.12
433	0.14
434	0.14
435	0.18
436	0.22
437	0.25
438	0.25
439	0.28
440	0.3
441	0.31
442	0.34
443	0.33
444	0.36
445	0.42
446	0.45
447	0.53
448	0.55
449	0.56
450	0.56
451	0.57
452	0.53

A0A1D8PKA3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer