Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4V9J0

Protein Details
Accession C4V9J0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-106MSMNKLKKIKRYQIGKVYRRDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.5, cyto 13, nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045864  aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL  
IPR004154  Anticodon-bd  
IPR036621  Anticodon-bd_dom_sf  
IPR041715  HisRS-like_core  
IPR004516  HisRS/HisZ  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004821  F:histidine-tRNA ligase activity  
GO:0006412  P:translation  
KEGG nce:NCER_101238  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03129  HGTP_anticodon  
PF13393  tRNA-synt_His  
CDD cd00773  HisRS-like_core  
Amino Acid Sequences MSLKTPKGTTDLNPDDALVYEDLIDRTKNIFKLHGAVPIDTPVFELKSILLNKYGEDTKLIYDLKNNGGEECALRYDLTVPFSRYMSMNKLKKIKRYQIGKVYRRDQPSVVQGRWREFLQADFDIAGESLPMMADSELVCCMNRLLKTYNIGDFVIRVSDKRILYGIFEVCEIPNNLFATVSSSIDKLDKIAVNDINKELKLKGLTDKQIINLNIYIQKSGTVDVLDFLRENDVYKKCSEAVDDLCKLYEYCKIMKCSDHLIIDLSLARGLDYYTGMIIEGKYLNKNIGSVAGGGRYDNLIGSLENSSYTNTYNVPCAGFSIGLSRIFSCIQKPKVNTNVKVFISASGKLLLEERLKIQSILWEANISLETFYNKRNNPGEHKKYCVKHGIKYLIVVKEEQYNKGFVTVIEVNTNLENVIMIDNLPSHLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.34
3 0.31
4 0.29
5 0.18
6 0.13
7 0.1
8 0.12
9 0.13
10 0.14
11 0.13
12 0.13
13 0.16
14 0.22
15 0.24
16 0.25
17 0.27
18 0.28
19 0.33
20 0.34
21 0.37
22 0.34
23 0.31
24 0.3
25 0.3
26 0.28
27 0.22
28 0.22
29 0.17
30 0.15
31 0.14
32 0.14
33 0.11
34 0.18
35 0.2
36 0.2
37 0.22
38 0.21
39 0.22
40 0.26
41 0.28
42 0.21
43 0.21
44 0.21
45 0.18
46 0.24
47 0.24
48 0.2
49 0.23
50 0.26
51 0.29
52 0.32
53 0.31
54 0.26
55 0.25
56 0.26
57 0.22
58 0.2
59 0.17
60 0.13
61 0.12
62 0.12
63 0.14
64 0.16
65 0.18
66 0.19
67 0.2
68 0.21
69 0.22
70 0.23
71 0.21
72 0.22
73 0.28
74 0.34
75 0.37
76 0.43
77 0.52
78 0.55
79 0.63
80 0.7
81 0.71
82 0.71
83 0.74
84 0.76
85 0.77
86 0.83
87 0.81
88 0.79
89 0.76
90 0.74
91 0.7
92 0.64
93 0.56
94 0.5
95 0.52
96 0.5
97 0.46
98 0.45
99 0.43
100 0.43
101 0.43
102 0.39
103 0.32
104 0.25
105 0.25
106 0.24
107 0.22
108 0.19
109 0.16
110 0.16
111 0.13
112 0.13
113 0.1
114 0.05
115 0.04
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.07
129 0.1
130 0.11
131 0.13
132 0.15
133 0.18
134 0.22
135 0.24
136 0.25
137 0.23
138 0.23
139 0.2
140 0.17
141 0.15
142 0.13
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.16
147 0.16
148 0.16
149 0.17
150 0.15
151 0.16
152 0.19
153 0.17
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.13
159 0.12
160 0.09
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.12
167 0.12
168 0.13
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.08
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.15
179 0.17
180 0.18
181 0.19
182 0.2
183 0.19
184 0.17
185 0.18
186 0.14
187 0.13
188 0.13
189 0.13
190 0.17
191 0.2
192 0.23
193 0.25
194 0.25
195 0.25
196 0.29
197 0.28
198 0.24
199 0.19
200 0.18
201 0.18
202 0.18
203 0.16
204 0.11
205 0.12
206 0.11
207 0.11
208 0.1
209 0.07
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.13
220 0.15
221 0.16
222 0.16
223 0.18
224 0.17
225 0.18
226 0.18
227 0.15
228 0.18
229 0.21
230 0.22
231 0.21
232 0.2
233 0.2
234 0.19
235 0.16
236 0.16
237 0.13
238 0.17
239 0.21
240 0.24
241 0.25
242 0.27
243 0.28
244 0.28
245 0.29
246 0.26
247 0.22
248 0.2
249 0.18
250 0.17
251 0.16
252 0.11
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.07
268 0.09
269 0.1
270 0.11
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.11
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.1
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.12
300 0.13
301 0.14
302 0.14
303 0.13
304 0.13
305 0.13
306 0.11
307 0.1
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.14
312 0.13
313 0.14
314 0.15
315 0.16
316 0.19
317 0.25
318 0.31
319 0.37
320 0.4
321 0.46
322 0.55
323 0.63
324 0.63
325 0.62
326 0.63
327 0.57
328 0.57
329 0.49
330 0.43
331 0.37
332 0.32
333 0.26
334 0.2
335 0.2
336 0.17
337 0.18
338 0.18
339 0.17
340 0.18
341 0.19
342 0.21
343 0.22
344 0.21
345 0.2
346 0.21
347 0.22
348 0.22
349 0.21
350 0.18
351 0.17
352 0.18
353 0.18
354 0.14
355 0.11
356 0.1
357 0.13
358 0.14
359 0.19
360 0.27
361 0.28
362 0.35
363 0.41
364 0.47
365 0.55
366 0.64
367 0.69
368 0.66
369 0.72
370 0.73
371 0.7
372 0.71
373 0.71
374 0.65
375 0.61
376 0.65
377 0.65
378 0.58
379 0.59
380 0.59
381 0.53
382 0.5
383 0.44
384 0.36
385 0.37
386 0.38
387 0.37
388 0.32
389 0.29
390 0.28
391 0.29
392 0.28
393 0.18
394 0.23
395 0.22
396 0.22
397 0.22
398 0.22
399 0.22
400 0.22
401 0.22
402 0.15
403 0.11
404 0.09
405 0.08
406 0.08
407 0.07
408 0.07
409 0.08
410 0.08