Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4VB46

Protein Details
Accession C4VB46    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
314-337HDILKMQRRGHRKFGKRNSKRNVABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
319-335MQRRGHRKFGKRNSKRN
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 11, mito_nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045864  aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL  
IPR002318  Ala-tRNA-lgiase_IIc  
IPR018162  Ala-tRNA-ligase_IIc_anticod-bd  
IPR018165  Ala-tRNA-synth_IIc_core  
IPR018164  Ala-tRNA-synth_IIc_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0004813  F:alanine-tRNA ligase activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006419  P:alanyl-tRNA aminoacylation  
KEGG nce:NCER_101964  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01411  tRNA-synt_2c  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50860  AA_TRNA_LIGASE_II_ALA  
CDD cd00673  AlaRS_core  
Amino Acid Sequences MVEYTVKKLKRAFFSYFKSKGHEIIKSSSVIPSNDPSLLFTNSGMVQFKNILMGQETNLKRACSIQRCIRAGGKHNDLDDVGKDTYHHTFFEMMGNWSFGDYFKKEAIEYAWDFLVNILKLEQDRLYVTYYKDMDSESYNIWKEFLPSERIIEADKNDNFWEMGDTGPCGPCTEIHYDRIGGRDASRLVNQDDPDVIEIWNIVFIEYNRTPTGLEPLERKCIDTGIGFERLLSILNNVKSNYLTNCFIPIIKNIENMTDKKYEDKLTIEDTAFRAVSDHCRTIAVCLIDNVEFSNEGQGYVLRRILRRAVRYAHDILKMQRRGHRKFGKRNSKRNVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.7
3 0.7
4 0.65
5 0.62
6 0.58
7 0.57
8 0.55
9 0.52
10 0.46
11 0.44
12 0.45
13 0.41
14 0.4
15 0.36
16 0.34
17 0.29
18 0.28
19 0.26
20 0.26
21 0.25
22 0.25
23 0.23
24 0.23
25 0.24
26 0.22
27 0.18
28 0.18
29 0.18
30 0.2
31 0.18
32 0.15
33 0.15
34 0.15
35 0.15
36 0.16
37 0.15
38 0.14
39 0.15
40 0.16
41 0.16
42 0.24
43 0.24
44 0.25
45 0.27
46 0.26
47 0.24
48 0.3
49 0.37
50 0.35
51 0.42
52 0.47
53 0.54
54 0.56
55 0.59
56 0.58
57 0.55
58 0.56
59 0.56
60 0.54
61 0.48
62 0.46
63 0.44
64 0.39
65 0.34
66 0.27
67 0.24
68 0.17
69 0.14
70 0.14
71 0.15
72 0.19
73 0.19
74 0.18
75 0.14
76 0.15
77 0.16
78 0.19
79 0.18
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.15
84 0.14
85 0.13
86 0.1
87 0.13
88 0.11
89 0.13
90 0.14
91 0.15
92 0.15
93 0.16
94 0.16
95 0.17
96 0.17
97 0.16
98 0.15
99 0.14
100 0.14
101 0.13
102 0.16
103 0.1
104 0.09
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.11
109 0.11
110 0.08
111 0.09
112 0.11
113 0.13
114 0.14
115 0.15
116 0.18
117 0.19
118 0.18
119 0.17
120 0.17
121 0.15
122 0.15
123 0.16
124 0.12
125 0.15
126 0.15
127 0.15
128 0.15
129 0.14
130 0.14
131 0.14
132 0.15
133 0.16
134 0.15
135 0.17
136 0.16
137 0.17
138 0.16
139 0.16
140 0.15
141 0.17
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.15
147 0.14
148 0.14
149 0.08
150 0.08
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.07
159 0.1
160 0.15
161 0.16
162 0.18
163 0.19
164 0.19
165 0.2
166 0.21
167 0.19
168 0.13
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.14
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.18
177 0.18
178 0.16
179 0.15
180 0.14
181 0.13
182 0.12
183 0.1
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.12
193 0.13
194 0.16
195 0.15
196 0.16
197 0.16
198 0.15
199 0.21
200 0.15
201 0.17
202 0.19
203 0.21
204 0.28
205 0.28
206 0.29
207 0.24
208 0.23
209 0.22
210 0.18
211 0.18
212 0.14
213 0.17
214 0.16
215 0.15
216 0.15
217 0.14
218 0.14
219 0.11
220 0.1
221 0.12
222 0.14
223 0.17
224 0.16
225 0.17
226 0.18
227 0.2
228 0.2
229 0.19
230 0.19
231 0.18
232 0.2
233 0.19
234 0.19
235 0.19
236 0.19
237 0.21
238 0.21
239 0.24
240 0.22
241 0.26
242 0.29
243 0.3
244 0.31
245 0.28
246 0.27
247 0.28
248 0.32
249 0.3
250 0.28
251 0.29
252 0.27
253 0.28
254 0.31
255 0.27
256 0.26
257 0.24
258 0.25
259 0.22
260 0.19
261 0.16
262 0.14
263 0.22
264 0.25
265 0.25
266 0.23
267 0.24
268 0.25
269 0.26
270 0.29
271 0.23
272 0.18
273 0.17
274 0.19
275 0.18
276 0.18
277 0.16
278 0.12
279 0.11
280 0.1
281 0.15
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.16
287 0.18
288 0.22
289 0.21
290 0.22
291 0.26
292 0.35
293 0.41
294 0.43
295 0.47
296 0.5
297 0.51
298 0.56
299 0.58
300 0.55
301 0.52
302 0.5
303 0.51
304 0.54
305 0.56
306 0.55
307 0.57
308 0.61
309 0.63
310 0.7
311 0.73
312 0.74
313 0.78
314 0.84
315 0.88
316 0.89
317 0.93