Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4VB81

Protein Details
Accession C4VB81    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-30MHSIKRKNNDKTRKVKRQIKQEKGVENTVKHydrophilic
46-68SINNEKYMKKINQKNKKNIDFFDHydrophilic
466-485VYFFCKKDNDVKKQVCKLLNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-17RKNNDKTRKVKR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG nce:NCER_102016  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
Amino Acid Sequences MHSIKRKNNDKTRKVKRQIKQEKGVENTVKESLKPNTPAIKNVDGSINNEKYMKKINQKNKKNIDFFDEVQRLLRNSNYDKKNLEQKIEIAWLDVKPNFVSFIRQKSMYNKISVLFNKGNMNTKYDIVKATLNNIYDISCHEHSKRFILTVAKDNKKFLVSIIKKITLLSRKLVSNRNGLFILDEIYKISNRKSRKEMIYNILYFSDKIQDNSDLQDFEKEDLSDNNINTNEDLLLDAENDNGCINKDNIAHFDAEHICNGDTTVSKNVDCSCTPDILERNKALNTGLIKKLSSKRLWKYIFTHDLLCEYLKAYPKDTQYILDLLIRNKQMNLLLCTYKGLEACLFILSIDNVSEILRILTKNFIDVVNNEYGSIFILKILELNRSIEKIIDIYVENYRDIFINEVSILPLIYIFNQEKKYFPTLFNQLREKDLINTNKNYLLSKFKSIIIENLTVFMNTFSWILVYFFCKKDNDVKKQVCKLLNSDNYIKNEFSEKLKKKMIKYKLFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.94
2 0.93
3 0.9
4 0.91
5 0.91
6 0.91
7 0.9
8 0.87
9 0.85
10 0.81
11 0.82
12 0.76
13 0.67
14 0.6
15 0.55
16 0.48
17 0.41
18 0.41
19 0.37
20 0.39
21 0.4
22 0.43
23 0.47
24 0.48
25 0.52
26 0.52
27 0.54
28 0.47
29 0.45
30 0.45
31 0.37
32 0.4
33 0.44
34 0.4
35 0.35
36 0.37
37 0.35
38 0.32
39 0.4
40 0.42
41 0.43
42 0.51
43 0.61
44 0.68
45 0.79
46 0.86
47 0.88
48 0.89
49 0.86
50 0.78
51 0.75
52 0.7
53 0.62
54 0.61
55 0.53
56 0.43
57 0.39
58 0.39
59 0.32
60 0.28
61 0.29
62 0.25
63 0.3
64 0.4
65 0.42
66 0.44
67 0.47
68 0.51
69 0.58
70 0.56
71 0.53
72 0.46
73 0.43
74 0.42
75 0.43
76 0.37
77 0.29
78 0.26
79 0.23
80 0.24
81 0.23
82 0.21
83 0.17
84 0.18
85 0.18
86 0.16
87 0.23
88 0.24
89 0.31
90 0.33
91 0.34
92 0.36
93 0.4
94 0.49
95 0.46
96 0.44
97 0.37
98 0.35
99 0.41
100 0.4
101 0.41
102 0.33
103 0.32
104 0.34
105 0.35
106 0.42
107 0.36
108 0.38
109 0.33
110 0.33
111 0.32
112 0.28
113 0.27
114 0.21
115 0.24
116 0.2
117 0.23
118 0.25
119 0.23
120 0.22
121 0.21
122 0.19
123 0.15
124 0.17
125 0.19
126 0.17
127 0.19
128 0.21
129 0.26
130 0.27
131 0.31
132 0.3
133 0.25
134 0.26
135 0.29
136 0.29
137 0.34
138 0.42
139 0.45
140 0.46
141 0.46
142 0.44
143 0.4
144 0.37
145 0.29
146 0.3
147 0.26
148 0.32
149 0.36
150 0.36
151 0.35
152 0.35
153 0.4
154 0.35
155 0.35
156 0.31
157 0.29
158 0.31
159 0.36
160 0.43
161 0.4
162 0.42
163 0.41
164 0.4
165 0.37
166 0.33
167 0.29
168 0.21
169 0.2
170 0.12
171 0.11
172 0.09
173 0.09
174 0.11
175 0.11
176 0.15
177 0.18
178 0.22
179 0.28
180 0.33
181 0.4
182 0.46
183 0.53
184 0.55
185 0.56
186 0.58
187 0.53
188 0.48
189 0.41
190 0.34
191 0.27
192 0.22
193 0.2
194 0.14
195 0.14
196 0.15
197 0.16
198 0.16
199 0.18
200 0.19
201 0.14
202 0.14
203 0.15
204 0.14
205 0.13
206 0.14
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.15
211 0.16
212 0.15
213 0.17
214 0.16
215 0.16
216 0.15
217 0.15
218 0.11
219 0.08
220 0.08
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.09
234 0.11
235 0.11
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.15
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.08
249 0.06
250 0.07
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.12
255 0.13
256 0.15
257 0.15
258 0.18
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.18
263 0.22
264 0.23
265 0.26
266 0.23
267 0.23
268 0.23
269 0.23
270 0.2
271 0.18
272 0.18
273 0.19
274 0.2
275 0.19
276 0.19
277 0.24
278 0.3
279 0.34
280 0.37
281 0.4
282 0.42
283 0.51
284 0.54
285 0.52
286 0.51
287 0.53
288 0.53
289 0.47
290 0.44
291 0.34
292 0.33
293 0.29
294 0.25
295 0.17
296 0.11
297 0.13
298 0.16
299 0.17
300 0.18
301 0.22
302 0.23
303 0.26
304 0.27
305 0.24
306 0.21
307 0.21
308 0.19
309 0.18
310 0.19
311 0.16
312 0.21
313 0.21
314 0.2
315 0.19
316 0.19
317 0.19
318 0.2
319 0.22
320 0.21
321 0.2
322 0.2
323 0.21
324 0.2
325 0.18
326 0.15
327 0.13
328 0.1
329 0.09
330 0.1
331 0.09
332 0.09
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.05
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.12
348 0.11
349 0.12
350 0.13
351 0.13
352 0.13
353 0.14
354 0.17
355 0.16
356 0.16
357 0.16
358 0.14
359 0.14
360 0.13
361 0.13
362 0.08
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.09
367 0.1
368 0.11
369 0.12
370 0.14
371 0.15
372 0.16
373 0.17
374 0.15
375 0.14
376 0.12
377 0.12
378 0.11
379 0.1
380 0.11
381 0.15
382 0.16
383 0.16
384 0.15
385 0.15
386 0.14
387 0.14
388 0.14
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.09
396 0.07
397 0.07
398 0.06
399 0.06
400 0.11
401 0.13
402 0.18
403 0.23
404 0.24
405 0.25
406 0.3
407 0.35
408 0.33
409 0.33
410 0.35
411 0.41
412 0.47
413 0.52
414 0.54
415 0.49
416 0.5
417 0.5
418 0.45
419 0.4
420 0.41
421 0.43
422 0.43
423 0.45
424 0.44
425 0.46
426 0.46
427 0.43
428 0.38
429 0.38
430 0.35
431 0.37
432 0.37
433 0.37
434 0.4
435 0.39
436 0.41
437 0.36
438 0.36
439 0.3
440 0.3
441 0.27
442 0.22
443 0.21
444 0.16
445 0.12
446 0.09
447 0.09
448 0.07
449 0.07
450 0.08
451 0.09
452 0.09
453 0.14
454 0.18
455 0.2
456 0.23
457 0.24
458 0.27
459 0.37
460 0.46
461 0.51
462 0.56
463 0.64
464 0.7
465 0.78
466 0.82
467 0.77
468 0.71
469 0.67
470 0.67
471 0.65
472 0.62
473 0.61
474 0.6
475 0.59
476 0.58
477 0.53
478 0.44
479 0.41
480 0.38
481 0.38
482 0.43
483 0.44
484 0.49
485 0.58
486 0.63
487 0.67
488 0.75
489 0.77