Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4VAI1

Protein Details
Accession C4VAI1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-33MSLKNIKSSKTPQKIKKKNNHKVIKNEKDTNNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-19QKIKKKN
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, mito 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007722  DCP2_BoxA  
IPR036189  DCP2_BoxA_sf  
IPR015797  NUDIX_hydrolase-like_dom_sf  
IPR020084  NUDIX_hydrolase_CS  
IPR000086  NUDIX_hydrolase_dom  
Gene Ontology GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0030145  F:manganese ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006402  P:mRNA catabolic process  
KEGG nce:NCER_101656  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05026  DCP2  
PF00293  NUDIX  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51462  NUDIX  
PS00893  NUDIX_BOX  
Amino Acid Sequences MSLKNIKSSKTPQKIKKKNNHKVIKNEKDTNNSTLYTISMFLLDEISVRFLVNIDLYDLQKVERLFFILEEAHWFYIDNYNEPSTSFYDFCLQILNHNKINIDINLGLQIFKSYKQSIKVYGCIIFSPKLDSILVVQENGKNGSFGFPKGKKSKDEDGIECAIREVKEEIGYDVSNKIVKGLSVKLFEKMNFYFVFNVKKSNKFVCNLKNEIANIIWLPISKLEHNTLGKRFSIITKSFVVWKKIYIAIVDNKFKFDKCKFNQIIEEKLKLNVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.91
3 0.92
4 0.92
5 0.92
6 0.93
7 0.93
8 0.9
9 0.91
10 0.91
11 0.91
12 0.89
13 0.87
14 0.82
15 0.8
16 0.75
17 0.68
18 0.6
19 0.5
20 0.42
21 0.33
22 0.28
23 0.21
24 0.17
25 0.13
26 0.1
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.08
31 0.07
32 0.07
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.11
43 0.11
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.14
48 0.14
49 0.13
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.11
54 0.13
55 0.1
56 0.1
57 0.13
58 0.14
59 0.13
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.17
64 0.18
65 0.16
66 0.17
67 0.18
68 0.18
69 0.18
70 0.19
71 0.15
72 0.17
73 0.15
74 0.14
75 0.17
76 0.17
77 0.16
78 0.17
79 0.15
80 0.19
81 0.26
82 0.29
83 0.27
84 0.28
85 0.28
86 0.26
87 0.28
88 0.22
89 0.17
90 0.14
91 0.12
92 0.13
93 0.13
94 0.12
95 0.09
96 0.1
97 0.08
98 0.09
99 0.12
100 0.12
101 0.15
102 0.2
103 0.22
104 0.27
105 0.29
106 0.3
107 0.28
108 0.28
109 0.26
110 0.22
111 0.22
112 0.16
113 0.14
114 0.14
115 0.13
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.12
121 0.12
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.12
127 0.11
128 0.08
129 0.08
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.18
134 0.19
135 0.26
136 0.32
137 0.35
138 0.36
139 0.42
140 0.48
141 0.48
142 0.5
143 0.45
144 0.44
145 0.43
146 0.4
147 0.33
148 0.26
149 0.2
150 0.15
151 0.14
152 0.11
153 0.09
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.08
166 0.09
167 0.11
168 0.14
169 0.17
170 0.2
171 0.21
172 0.22
173 0.24
174 0.24
175 0.27
176 0.23
177 0.23
178 0.19
179 0.2
180 0.21
181 0.21
182 0.28
183 0.23
184 0.31
185 0.32
186 0.36
187 0.4
188 0.44
189 0.46
190 0.43
191 0.51
192 0.51
193 0.54
194 0.53
195 0.51
196 0.47
197 0.43
198 0.41
199 0.33
200 0.26
201 0.19
202 0.15
203 0.13
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.13
208 0.13
209 0.16
210 0.18
211 0.25
212 0.29
213 0.34
214 0.35
215 0.36
216 0.34
217 0.33
218 0.31
219 0.29
220 0.32
221 0.29
222 0.29
223 0.29
224 0.3
225 0.36
226 0.4
227 0.41
228 0.34
229 0.34
230 0.35
231 0.35
232 0.35
233 0.29
234 0.29
235 0.33
236 0.39
237 0.45
238 0.42
239 0.42
240 0.43
241 0.43
242 0.45
243 0.43
244 0.47
245 0.45
246 0.55
247 0.56
248 0.6
249 0.68
250 0.65
251 0.69
252 0.64
253 0.62
254 0.52