Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4VB27

Protein Details
Accession C4VB27    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-47HSNSKIEGKKIKKRKLDDEKTEKKISKBasic
53-75DEASCNIKKNKHTKKVVNNNLTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-36GKKIKKRKL
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, mito 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG nce:NCER_101942  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MKKNKKEITTNQNINKDTILHSNSKIEGKKIKKRKLDDEKTEKKISKLDSLADEASCNIKKNKHTKKVVNNNLTEYTPYDKNIIIVSNLSFKETENSIKECFKKYGAIERVQLTYSKDKKFIGKAIIIFKHPVFINEDIKLNYKILRIERMKNKTVNDKRIFISRLNKNLTILQLRNILKKFNIKPKDIRMRFEIETKRNIGYCHVTYSSALEAKAFEKKWNLFKHDLGVETFYEYAQEKVSKHKKNKAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.57
3 0.48
4 0.41
5 0.38
6 0.34
7 0.3
8 0.31
9 0.33
10 0.35
11 0.4
12 0.39
13 0.37
14 0.42
15 0.48
16 0.56
17 0.63
18 0.69
19 0.72
20 0.77
21 0.83
22 0.85
23 0.86
24 0.87
25 0.87
26 0.87
27 0.85
28 0.85
29 0.77
30 0.68
31 0.63
32 0.55
33 0.52
34 0.45
35 0.41
36 0.36
37 0.37
38 0.36
39 0.3
40 0.27
41 0.2
42 0.22
43 0.2
44 0.2
45 0.2
46 0.24
47 0.32
48 0.43
49 0.53
50 0.58
51 0.66
52 0.73
53 0.8
54 0.86
55 0.89
56 0.86
57 0.77
58 0.71
59 0.64
60 0.55
61 0.45
62 0.36
63 0.3
64 0.23
65 0.22
66 0.19
67 0.17
68 0.17
69 0.17
70 0.15
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.13
78 0.13
79 0.15
80 0.15
81 0.19
82 0.16
83 0.19
84 0.2
85 0.25
86 0.27
87 0.27
88 0.28
89 0.24
90 0.25
91 0.24
92 0.32
93 0.32
94 0.33
95 0.33
96 0.33
97 0.33
98 0.29
99 0.29
100 0.22
101 0.26
102 0.3
103 0.28
104 0.29
105 0.29
106 0.32
107 0.34
108 0.34
109 0.29
110 0.25
111 0.27
112 0.3
113 0.31
114 0.28
115 0.27
116 0.23
117 0.22
118 0.2
119 0.17
120 0.15
121 0.17
122 0.18
123 0.18
124 0.2
125 0.17
126 0.2
127 0.2
128 0.17
129 0.16
130 0.15
131 0.17
132 0.17
133 0.25
134 0.26
135 0.33
136 0.42
137 0.46
138 0.5
139 0.5
140 0.52
141 0.55
142 0.59
143 0.61
144 0.56
145 0.53
146 0.5
147 0.52
148 0.51
149 0.45
150 0.46
151 0.43
152 0.46
153 0.48
154 0.47
155 0.42
156 0.42
157 0.41
158 0.38
159 0.32
160 0.27
161 0.3
162 0.31
163 0.35
164 0.34
165 0.32
166 0.29
167 0.38
168 0.42
169 0.44
170 0.49
171 0.49
172 0.55
173 0.63
174 0.72
175 0.66
176 0.63
177 0.57
178 0.56
179 0.53
180 0.55
181 0.53
182 0.46
183 0.48
184 0.47
185 0.45
186 0.4
187 0.39
188 0.35
189 0.33
190 0.3
191 0.29
192 0.28
193 0.27
194 0.25
195 0.27
196 0.26
197 0.22
198 0.2
199 0.15
200 0.15
201 0.16
202 0.23
203 0.22
204 0.22
205 0.28
206 0.33
207 0.42
208 0.48
209 0.53
210 0.51
211 0.52
212 0.55
213 0.51
214 0.48
215 0.41
216 0.36
217 0.29
218 0.27
219 0.25
220 0.18
221 0.16
222 0.15
223 0.14
224 0.16
225 0.19
226 0.17
227 0.28
228 0.39
229 0.46
230 0.55