Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4VBR2

Protein Details
Accession C4VBR2    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
219-238KNKRNVTFSKRKKGIMKKAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-233SKRKKGI
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG nce:NCER_102270  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00350  MADS_BOX_1  
PS50066  MADS_BOX_2  
CDD cd00120  MADS  
Amino Acid Sequences MKHYDNEHTSSEEESSEENVNYKAPPRGKEPLDYSKNVFYTKQYDDQLIANTKKDQIEKNRMLNIANRAQMYQNESLPDYDYEHFNEDQRYEQHVVGEFINGVYTDSRYVKNEKYTQFRSEPPVQNINNWGYYGGQNYIPEDIINQPINKFETFPNTKRQRNIPPLGLNITNNQFPPYNENYLPRDIQKTFPSAEPPFSPTQQTRTKRSKINLEYISGKNKRNVTFSKRKKGIMKKAFELSTLTGSDVLLLVASESGHVYTYATPRLKPLLPKNRKFIEECLSKADNSIRFDTDSEQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.18
4 0.17
5 0.17
6 0.16
7 0.17
8 0.18
9 0.21
10 0.25
11 0.28
12 0.31
13 0.36
14 0.44
15 0.46
16 0.51
17 0.55
18 0.58
19 0.59
20 0.59
21 0.56
22 0.54
23 0.54
24 0.48
25 0.42
26 0.35
27 0.35
28 0.37
29 0.39
30 0.35
31 0.34
32 0.33
33 0.34
34 0.36
35 0.37
36 0.34
37 0.29
38 0.3
39 0.32
40 0.34
41 0.36
42 0.38
43 0.41
44 0.5
45 0.55
46 0.59
47 0.6
48 0.58
49 0.55
50 0.53
51 0.5
52 0.45
53 0.4
54 0.35
55 0.3
56 0.31
57 0.32
58 0.32
59 0.27
60 0.23
61 0.21
62 0.22
63 0.21
64 0.21
65 0.2
66 0.18
67 0.16
68 0.17
69 0.17
70 0.19
71 0.19
72 0.19
73 0.2
74 0.18
75 0.2
76 0.2
77 0.24
78 0.23
79 0.23
80 0.23
81 0.22
82 0.23
83 0.2
84 0.18
85 0.13
86 0.1
87 0.1
88 0.08
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.08
93 0.1
94 0.12
95 0.14
96 0.18
97 0.21
98 0.27
99 0.34
100 0.36
101 0.42
102 0.45
103 0.48
104 0.47
105 0.47
106 0.47
107 0.49
108 0.5
109 0.46
110 0.5
111 0.45
112 0.43
113 0.44
114 0.39
115 0.31
116 0.25
117 0.21
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.11
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.1
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.14
136 0.13
137 0.14
138 0.11
139 0.18
140 0.23
141 0.26
142 0.35
143 0.41
144 0.44
145 0.46
146 0.52
147 0.53
148 0.57
149 0.59
150 0.54
151 0.49
152 0.47
153 0.46
154 0.41
155 0.32
156 0.26
157 0.24
158 0.2
159 0.17
160 0.17
161 0.15
162 0.14
163 0.19
164 0.21
165 0.23
166 0.23
167 0.27
168 0.29
169 0.31
170 0.32
171 0.28
172 0.28
173 0.25
174 0.27
175 0.26
176 0.26
177 0.24
178 0.24
179 0.28
180 0.25
181 0.26
182 0.24
183 0.26
184 0.26
185 0.25
186 0.28
187 0.24
188 0.29
189 0.37
190 0.41
191 0.45
192 0.51
193 0.56
194 0.59
195 0.63
196 0.67
197 0.63
198 0.67
199 0.61
200 0.56
201 0.56
202 0.52
203 0.56
204 0.5
205 0.48
206 0.44
207 0.47
208 0.46
209 0.47
210 0.52
211 0.52
212 0.58
213 0.65
214 0.7
215 0.69
216 0.73
217 0.76
218 0.79
219 0.8
220 0.79
221 0.75
222 0.7
223 0.72
224 0.66
225 0.57
226 0.49
227 0.4
228 0.34
229 0.28
230 0.23
231 0.16
232 0.15
233 0.14
234 0.11
235 0.09
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.1
248 0.14
249 0.22
250 0.23
251 0.24
252 0.26
253 0.32
254 0.35
255 0.4
256 0.48
257 0.51
258 0.6
259 0.67
260 0.73
261 0.75
262 0.76
263 0.7
264 0.66
265 0.64
266 0.6
267 0.55
268 0.54
269 0.49
270 0.44
271 0.43
272 0.44
273 0.4
274 0.37
275 0.39
276 0.34
277 0.34