Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C4V975

Protein Details
Accession C4V975    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MEKKSEMSKEKQKTKKRNSASIFKNKEMHydrophilic
45-64KEENTRQKKEDKNKEIADKNBasic
321-340SNSERKKKYTLKVNNLPFKCHydrophilic
421-472LVEKKGSNTKKNKDSYSKKGNNKSDTRKDTKRMKYNESKKSKSESKNRIVFEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-18KEKQKTKKRN
423-463EKKGSNTKKNKDSYSKKGNNKSDTRKDTKRMKYNESKKSKS
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG nce:NCER_101090  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MEKKSEMSKEKQKTKKRNSASIFKNKEMVSDEKDKKEHKSGDGLKEENTRQKKEDKNKEIADKNILENCDESSSSTEKEEKMPRKEVNKKAVTADSIESSLSDSMRSFDAGENRKDLSSESKESSESSESEGSSELSESEKLGESKKSSESKTSSESEESSKLNKSEKLNKSEKLNESEKLNESEKSSESENSSESENSSESENSSELKETKKTGQSKEPEDSSSEIEQQSSSIEEENLEDKDLRVCFMKGIPFDLTEEELKKEVGLIGKTVRVSIPVTGDKNRNKGFAFIEFVKEADAKKCLKLDNQELFGRKINVSIASNSERKKKYTLKVNNLPFKCTKEDLIKYLSKFGEIKGCHIPMEDDRTKGFAFIFIDDESTFKKLLNAKLTFKDRTLFVKDADDQKNDKNKFDIRKKNIAELVEKKGSNTKKNKDSYSKKGNNKSDTRKDTKRMKYNESKKSKSESKNRIVFESDSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.91
3 0.9
4 0.9
5 0.87
6 0.88
7 0.88
8 0.87
9 0.84
10 0.76
11 0.73
12 0.62
13 0.58
14 0.53
15 0.48
16 0.43
17 0.47
18 0.51
19 0.51
20 0.58
21 0.57
22 0.59
23 0.63
24 0.62
25 0.56
26 0.59
27 0.61
28 0.64
29 0.68
30 0.63
31 0.58
32 0.59
33 0.6
34 0.59
35 0.58
36 0.53
37 0.5
38 0.58
39 0.64
40 0.67
41 0.73
42 0.72
43 0.74
44 0.77
45 0.82
46 0.79
47 0.73
48 0.7
49 0.62
50 0.58
51 0.53
52 0.46
53 0.37
54 0.32
55 0.29
56 0.24
57 0.21
58 0.18
59 0.17
60 0.19
61 0.19
62 0.21
63 0.23
64 0.22
65 0.29
66 0.38
67 0.42
68 0.47
69 0.54
70 0.58
71 0.65
72 0.73
73 0.75
74 0.76
75 0.73
76 0.68
77 0.65
78 0.62
79 0.53
80 0.46
81 0.39
82 0.3
83 0.24
84 0.22
85 0.17
86 0.15
87 0.14
88 0.11
89 0.1
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.11
94 0.11
95 0.13
96 0.21
97 0.26
98 0.28
99 0.29
100 0.3
101 0.29
102 0.28
103 0.26
104 0.26
105 0.26
106 0.29
107 0.29
108 0.29
109 0.29
110 0.3
111 0.32
112 0.26
113 0.21
114 0.2
115 0.19
116 0.18
117 0.18
118 0.18
119 0.15
120 0.13
121 0.12
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.11
128 0.11
129 0.13
130 0.16
131 0.17
132 0.2
133 0.26
134 0.3
135 0.29
136 0.35
137 0.37
138 0.37
139 0.4
140 0.39
141 0.35
142 0.32
143 0.32
144 0.28
145 0.28
146 0.25
147 0.23
148 0.24
149 0.23
150 0.25
151 0.28
152 0.31
153 0.38
154 0.44
155 0.5
156 0.53
157 0.54
158 0.57
159 0.6
160 0.59
161 0.55
162 0.51
163 0.44
164 0.41
165 0.42
166 0.38
167 0.34
168 0.31
169 0.25
170 0.24
171 0.24
172 0.23
173 0.2
174 0.2
175 0.18
176 0.18
177 0.17
178 0.16
179 0.15
180 0.15
181 0.14
182 0.13
183 0.12
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.1
188 0.09
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.1
193 0.11
194 0.11
195 0.13
196 0.14
197 0.16
198 0.21
199 0.27
200 0.32
201 0.35
202 0.41
203 0.44
204 0.47
205 0.49
206 0.45
207 0.39
208 0.35
209 0.32
210 0.27
211 0.23
212 0.21
213 0.17
214 0.15
215 0.14
216 0.12
217 0.11
218 0.09
219 0.08
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.11
236 0.14
237 0.11
238 0.14
239 0.14
240 0.13
241 0.13
242 0.14
243 0.13
244 0.12
245 0.13
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.11
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.13
264 0.15
265 0.18
266 0.21
267 0.29
268 0.31
269 0.38
270 0.38
271 0.38
272 0.34
273 0.35
274 0.33
275 0.28
276 0.28
277 0.22
278 0.23
279 0.2
280 0.2
281 0.18
282 0.17
283 0.16
284 0.13
285 0.16
286 0.15
287 0.17
288 0.2
289 0.21
290 0.24
291 0.29
292 0.36
293 0.37
294 0.4
295 0.42
296 0.41
297 0.42
298 0.4
299 0.36
300 0.27
301 0.23
302 0.2
303 0.19
304 0.18
305 0.17
306 0.19
307 0.21
308 0.26
309 0.27
310 0.35
311 0.35
312 0.36
313 0.43
314 0.47
315 0.5
316 0.56
317 0.63
318 0.65
319 0.72
320 0.79
321 0.81
322 0.73
323 0.7
324 0.62
325 0.56
326 0.5
327 0.43
328 0.37
329 0.37
330 0.39
331 0.38
332 0.41
333 0.42
334 0.38
335 0.42
336 0.38
337 0.32
338 0.3
339 0.27
340 0.29
341 0.25
342 0.28
343 0.28
344 0.29
345 0.27
346 0.26
347 0.27
348 0.23
349 0.32
350 0.3
351 0.25
352 0.25
353 0.28
354 0.27
355 0.26
356 0.22
357 0.16
358 0.15
359 0.14
360 0.16
361 0.14
362 0.15
363 0.14
364 0.16
365 0.14
366 0.14
367 0.13
368 0.11
369 0.16
370 0.2
371 0.27
372 0.35
373 0.38
374 0.42
375 0.5
376 0.56
377 0.53
378 0.49
379 0.46
380 0.39
381 0.4
382 0.42
383 0.36
384 0.31
385 0.35
386 0.38
387 0.44
388 0.47
389 0.45
390 0.42
391 0.48
392 0.56
393 0.53
394 0.5
395 0.48
396 0.5
397 0.56
398 0.63
399 0.66
400 0.64
401 0.73
402 0.73
403 0.75
404 0.72
405 0.65
406 0.63
407 0.58
408 0.58
409 0.55
410 0.52
411 0.45
412 0.49
413 0.52
414 0.54
415 0.58
416 0.6
417 0.62
418 0.7
419 0.77
420 0.8
421 0.82
422 0.82
423 0.83
424 0.84
425 0.84
426 0.87
427 0.87
428 0.86
429 0.87
430 0.87
431 0.86
432 0.86
433 0.86
434 0.84
435 0.85
436 0.85
437 0.86
438 0.85
439 0.82
440 0.83
441 0.85
442 0.86
443 0.87
444 0.87
445 0.83
446 0.8
447 0.81
448 0.81
449 0.8
450 0.81
451 0.81
452 0.81
453 0.82
454 0.79
455 0.73
456 0.68