Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q2HDD3

Protein Details
Accession Q2HDD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
671-706ASKERSARRGAKPKAVKEVKATKKGPGRPRKRRAGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
536-585LKKRGRPARSAGAAASARLAAKAASKPTRGRPKATTAAAKPAKKAGRPKK
645-706KFDAAKKKAKAAEAAKKAATKKAAAPASKERSARRGAKPKAVKEVKATKKGPGRPRKRRAGA
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR023779  Chromodomain_CS  
IPR019318  Gua_nucleotide_exch_fac_Ric8  
Gene Ontology GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
GO:1901363  F:heterocyclic compound binding  
GO:0097159  F:organic cyclic compound binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PF10165  Ric8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00598  CHROMO_1  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences MAQLTGPAKLDAVRKLLDDLAKDLTSGALQPQERDAALEELKLYGRDPSYADPIFTKEGIGILAKFAFDSSSDTTSRNALKVLCNTLFIKDQTRQIFVDLGYEPKACAKLKNDNRDDEFLISRLILLSTYGTNIDLPKLIEQHQLADSMVAHLSRHAGRLSAQPSATTAANPMERMALDETLKLLFNVTNFAKEHLNSFDGALPHIASLLCALPLPQTKTPLDPPFGLLIAPLLNLDLTTPAAQAALYPSAEPSRIASRLLQLLDLSMKYYNDTQIESTVTPLLCSLSVLYEHAPNEATATTTTSTTTDTATDTATDTTTNTTVANHPRATIRAALLPKEEDRKTVLGRADTLASRLLRNWTNPLAPQFRSAVSHLYFDLSGKDAVRFIENVGYGYASGFLFEKNISIPEGAMQGQGLQGREGAGSDGGAGTTAAKGGESSAAGMRAVNPITGQFLDEERFPDLPEMTMEEKEREAERLFVLFERLRQTGVVSVENPVATAMQEGRIQELPDDEEDLDYRADLVALNADGGEATPLKKRGRPARSAGAAASARLAAKAASKPTRGRPKATTAAAKPAKKAGRPKKDAADEEVPAGEYEVESIADSIIDADTMEHMYLVKWKNYPASDNTWEPKKNLKGSLDLVRKFDAAKKKAKAAEAAKKAATKKAAAPASKERSARRGAKPKAVKEVKATKKGPGRPRKRRAGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.28
3 0.32
4 0.31
5 0.28
6 0.27
7 0.27
8 0.26
9 0.25
10 0.22
11 0.19
12 0.16
13 0.15
14 0.15
15 0.16
16 0.17
17 0.19
18 0.21
19 0.23
20 0.22
21 0.23
22 0.22
23 0.21
24 0.21
25 0.2
26 0.18
27 0.18
28 0.19
29 0.18
30 0.16
31 0.16
32 0.16
33 0.17
34 0.19
35 0.21
36 0.28
37 0.28
38 0.29
39 0.25
40 0.28
41 0.3
42 0.27
43 0.23
44 0.16
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.13
49 0.11
50 0.12
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.09
55 0.08
56 0.13
57 0.15
58 0.18
59 0.19
60 0.2
61 0.21
62 0.26
63 0.28
64 0.25
65 0.23
66 0.22
67 0.27
68 0.31
69 0.37
70 0.33
71 0.34
72 0.34
73 0.34
74 0.36
75 0.32
76 0.32
77 0.3
78 0.36
79 0.36
80 0.38
81 0.36
82 0.33
83 0.34
84 0.28
85 0.28
86 0.22
87 0.21
88 0.2
89 0.19
90 0.18
91 0.18
92 0.23
93 0.2
94 0.24
95 0.28
96 0.36
97 0.45
98 0.56
99 0.59
100 0.62
101 0.66
102 0.65
103 0.61
104 0.54
105 0.46
106 0.36
107 0.31
108 0.23
109 0.18
110 0.14
111 0.12
112 0.08
113 0.07
114 0.08
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.12
124 0.13
125 0.16
126 0.17
127 0.22
128 0.21
129 0.23
130 0.23
131 0.23
132 0.2
133 0.18
134 0.16
135 0.12
136 0.13
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.12
141 0.12
142 0.14
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.21
147 0.23
148 0.24
149 0.23
150 0.21
151 0.22
152 0.24
153 0.22
154 0.15
155 0.15
156 0.14
157 0.15
158 0.15
159 0.14
160 0.13
161 0.13
162 0.15
163 0.15
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.11
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.13
175 0.13
176 0.16
177 0.16
178 0.18
179 0.2
180 0.19
181 0.21
182 0.19
183 0.2
184 0.16
185 0.17
186 0.18
187 0.16
188 0.16
189 0.14
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.09
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.08
201 0.12
202 0.17
203 0.18
204 0.22
205 0.23
206 0.26
207 0.33
208 0.34
209 0.33
210 0.29
211 0.29
212 0.26
213 0.25
214 0.22
215 0.15
216 0.11
217 0.08
218 0.08
219 0.06
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.12
242 0.13
243 0.14
244 0.14
245 0.16
246 0.19
247 0.19
248 0.17
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.11
254 0.09
255 0.08
256 0.09
257 0.1
258 0.12
259 0.11
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.14
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.11
269 0.1
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.07
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.11
311 0.16
312 0.2
313 0.18
314 0.19
315 0.2
316 0.21
317 0.21
318 0.19
319 0.15
320 0.15
321 0.16
322 0.16
323 0.16
324 0.17
325 0.17
326 0.21
327 0.21
328 0.17
329 0.19
330 0.2
331 0.2
332 0.23
333 0.23
334 0.17
335 0.18
336 0.18
337 0.17
338 0.15
339 0.15
340 0.13
341 0.12
342 0.11
343 0.11
344 0.14
345 0.14
346 0.15
347 0.17
348 0.17
349 0.17
350 0.18
351 0.23
352 0.23
353 0.22
354 0.23
355 0.21
356 0.2
357 0.2
358 0.2
359 0.19
360 0.16
361 0.16
362 0.14
363 0.14
364 0.13
365 0.12
366 0.12
367 0.09
368 0.09
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.08
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.09
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.06
393 0.07
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.08
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.06
402 0.07
403 0.09
404 0.09
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.07
410 0.06
411 0.05
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.03
416 0.04
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.04
421 0.03
422 0.03
423 0.04
424 0.04
425 0.05
426 0.04
427 0.06
428 0.06
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.09
434 0.09
435 0.08
436 0.07
437 0.07
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.07
442 0.08
443 0.09
444 0.1
445 0.11
446 0.11
447 0.12
448 0.12
449 0.12
450 0.11
451 0.11
452 0.1
453 0.12
454 0.12
455 0.14
456 0.15
457 0.15
458 0.15
459 0.16
460 0.17
461 0.16
462 0.14
463 0.14
464 0.14
465 0.14
466 0.14
467 0.12
468 0.16
469 0.14
470 0.16
471 0.18
472 0.18
473 0.18
474 0.17
475 0.17
476 0.17
477 0.19
478 0.18
479 0.14
480 0.15
481 0.16
482 0.15
483 0.15
484 0.11
485 0.09
486 0.07
487 0.08
488 0.07
489 0.08
490 0.1
491 0.1
492 0.13
493 0.14
494 0.14
495 0.13
496 0.14
497 0.14
498 0.13
499 0.14
500 0.12
501 0.11
502 0.11
503 0.12
504 0.11
505 0.09
506 0.08
507 0.06
508 0.06
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.06
519 0.05
520 0.06
521 0.11
522 0.16
523 0.19
524 0.22
525 0.31
526 0.4
527 0.47
528 0.53
529 0.56
530 0.61
531 0.61
532 0.6
533 0.52
534 0.49
535 0.41
536 0.34
537 0.27
538 0.19
539 0.15
540 0.13
541 0.13
542 0.07
543 0.11
544 0.14
545 0.21
546 0.25
547 0.3
548 0.35
549 0.45
550 0.56
551 0.56
552 0.59
553 0.56
554 0.6
555 0.63
556 0.64
557 0.62
558 0.53
559 0.6
560 0.62
561 0.59
562 0.52
563 0.52
564 0.52
565 0.5
566 0.58
567 0.59
568 0.62
569 0.67
570 0.72
571 0.73
572 0.76
573 0.72
574 0.69
575 0.64
576 0.54
577 0.48
578 0.42
579 0.33
580 0.25
581 0.22
582 0.14
583 0.08
584 0.08
585 0.07
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.06
598 0.07
599 0.07
600 0.06
601 0.06
602 0.07
603 0.14
604 0.18
605 0.21
606 0.22
607 0.25
608 0.32
609 0.34
610 0.39
611 0.36
612 0.41
613 0.42
614 0.47
615 0.51
616 0.52
617 0.52
618 0.5
619 0.54
620 0.54
621 0.55
622 0.56
623 0.53
624 0.51
625 0.54
626 0.62
627 0.61
628 0.56
629 0.52
630 0.47
631 0.45
632 0.41
633 0.42
634 0.43
635 0.4
636 0.47
637 0.49
638 0.55
639 0.59
640 0.61
641 0.63
642 0.62
643 0.66
644 0.64
645 0.64
646 0.6
647 0.6
648 0.59
649 0.57
650 0.51
651 0.44
652 0.42
653 0.46
654 0.5
655 0.47
656 0.51
657 0.55
658 0.59
659 0.62
660 0.61
661 0.57
662 0.57
663 0.63
664 0.65
665 0.66
666 0.69
667 0.69
668 0.75
669 0.8
670 0.79
671 0.81
672 0.79
673 0.73
674 0.72
675 0.75
676 0.75
677 0.75
678 0.71
679 0.68
680 0.7
681 0.75
682 0.77
683 0.77
684 0.78
685 0.79
686 0.88