FuNGI

Q2HED9

Protein Details

Accession

Q2HED9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
315-339	ATIAATLRRRRRRGRGRPRREIADI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
322-335	RRRRRRGRGRPRRE

Subcellular Location(s)

cyto 16.5, cyto_mito 9.5, nucl 5, cysk 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0005739 C:mitochondrion
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MAIAVGPLRATGDNAAYATKGDLEELRDRRLHETWRHKANASLLQLDLKGAFDRVHHGWLTRTLRELGVPLWTLRWVDLFTAGRSAKLWFDGTMSESYEVAAGVPQGSPLSPILFLLFISTLYKRLEAVRGAIVVGFADDTNILAVAETTEGTCGILAEAWGHCAGWAAERGMEFEPAKSELIHFSRARAPIEKTLTIEGVELKPVEDARFLGVWLDRKLRYRAHLAAVRKKMKTQICALTRLAAKTWGCTFREGEGDLLESDPQCDRVWSPSLPHPYRETYCPPIDLYLNKRLLAFEDRVRISEEARLIRQTPATIAATLRRRRRRGRGRPRREIADIATAPAEKGSGEWKKRWAQEWDPLESRPEKEELEPGSTGPVPNHKKQLERWMEEAMRREWIGRWESEVARVVARNPGRALEPADATARFDASIMNRHRSRDPAWEPSKAKSTLLVQARTGKIGLRGFLFTRRVPEVVTPGMPLRYGARDIRTPRTRMERSRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.15
3	0.13
4	0.13
5	0.13
6	0.13
7	0.11
8	0.11
9	0.13
10	0.17
11	0.26
12	0.29
13	0.34
14	0.35
15	0.37
16	0.41
17	0.44
18	0.48
19	0.49
20	0.56
21	0.6
22	0.67
23	0.69
24	0.64
25	0.63
26	0.62
27	0.6
28	0.53
29	0.47
30	0.38
31	0.36
32	0.35
33	0.31
34	0.25
35	0.18
36	0.14
37	0.13
38	0.12
39	0.11
40	0.17
41	0.18
42	0.21
43	0.21
44	0.22
45	0.23
46	0.32
47	0.36
48	0.32
49	0.34
50	0.31
51	0.31
52	0.31
53	0.29
54	0.21
55	0.2
56	0.19
57	0.16
58	0.16
59	0.16
60	0.16
61	0.15
62	0.16
63	0.12
64	0.11
65	0.17
66	0.18
67	0.17
68	0.24
69	0.23
70	0.22
71	0.22
72	0.23
73	0.18
74	0.19
75	0.19
76	0.13
77	0.14
78	0.15
79	0.17
80	0.17
81	0.17
82	0.15
83	0.14
84	0.14
85	0.13
86	0.11
87	0.09
88	0.07
89	0.06
90	0.06
91	0.06
92	0.06
93	0.06
94	0.06
95	0.07
96	0.08
97	0.09
98	0.08
99	0.08
100	0.09
101	0.08
102	0.08
103	0.08
104	0.08
105	0.07
106	0.09
107	0.1
108	0.12
109	0.13
110	0.13
111	0.13
112	0.15
113	0.18
114	0.17
115	0.19
116	0.18
117	0.17
118	0.17
119	0.16
120	0.13
121	0.09
122	0.08
123	0.06
124	0.04
125	0.04
126	0.04
127	0.04
128	0.04
129	0.04
130	0.04
131	0.03
132	0.04
133	0.04
134	0.04
135	0.04
136	0.04
137	0.04
138	0.04
139	0.05
140	0.05
141	0.04
142	0.04
143	0.04
144	0.04
145	0.05
146	0.05
147	0.06
148	0.06
149	0.06
150	0.06
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.08
155	0.08
156	0.09
157	0.09
158	0.12
159	0.11
160	0.14
161	0.13
162	0.12
163	0.13
164	0.13
165	0.14
166	0.12
167	0.12
168	0.14
169	0.16
170	0.21
171	0.2
172	0.21
173	0.26
174	0.28
175	0.3
176	0.28
177	0.29
178	0.29
179	0.33
180	0.32
181	0.28
182	0.27
183	0.25
184	0.22
185	0.19
186	0.15
187	0.11
188	0.11
189	0.1
190	0.08
191	0.09
192	0.09
193	0.09
194	0.07
195	0.07
196	0.08
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.1
201	0.12
202	0.14
203	0.18
204	0.18
205	0.21
206	0.25
207	0.26
208	0.27
209	0.3
210	0.31
211	0.33
212	0.36
213	0.39
214	0.44
215	0.5
216	0.53
217	0.48
218	0.46
219	0.48
220	0.46
221	0.44
222	0.41
223	0.41
224	0.37
225	0.41
226	0.39
227	0.36
228	0.34
229	0.31
230	0.25
231	0.21
232	0.19
233	0.16
234	0.2
235	0.19
236	0.19
237	0.2
238	0.21
239	0.18
240	0.19
241	0.18
242	0.15
243	0.11
244	0.11
245	0.1
246	0.09
247	0.08
248	0.06
249	0.07
250	0.06
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.08
255	0.1
256	0.14
257	0.13
258	0.16
259	0.2
260	0.3
261	0.31
262	0.32
263	0.32
264	0.33
265	0.35
266	0.36
267	0.35
268	0.31
269	0.31
270	0.3
271	0.27
272	0.24
273	0.24
274	0.24
275	0.24
276	0.27
277	0.27
278	0.27
279	0.27
280	0.25
281	0.26
282	0.26
283	0.24
284	0.19
285	0.23
286	0.23
287	0.24
288	0.26
289	0.24
290	0.21
291	0.22
292	0.22
293	0.19
294	0.2
295	0.2
296	0.19
297	0.2
298	0.2
299	0.17
300	0.14
301	0.15
302	0.14
303	0.14
304	0.13
305	0.18
306	0.25
307	0.32
308	0.4
309	0.46
310	0.53
311	0.61
312	0.71
313	0.77
314	0.8
315	0.85
316	0.87
317	0.89
318	0.92
319	0.89
320	0.84
321	0.76
322	0.67
323	0.59
324	0.56
325	0.45
326	0.35
327	0.3
328	0.25
329	0.21
330	0.18
331	0.15
332	0.06
333	0.06
334	0.13
335	0.2
336	0.24
337	0.26
338	0.34
339	0.4
340	0.44
341	0.5
342	0.49
343	0.47
344	0.53
345	0.55
346	0.54
347	0.49
348	0.46
349	0.45
350	0.4
351	0.36
352	0.29
353	0.27
354	0.22
355	0.21
356	0.26
357	0.24
358	0.25
359	0.24
360	0.21
361	0.22
362	0.21
363	0.21
364	0.17
365	0.24
366	0.26
367	0.3
368	0.39
369	0.39
370	0.43
371	0.48
372	0.57
373	0.57
374	0.55
375	0.53
376	0.52
377	0.53
378	0.52
379	0.51
380	0.42
381	0.35
382	0.31
383	0.3
384	0.25
385	0.28
386	0.28
387	0.24
388	0.26
389	0.28
390	0.28
391	0.31
392	0.32
393	0.27
394	0.25
395	0.25
396	0.22
397	0.25
398	0.26
399	0.26
400	0.23
401	0.24
402	0.24
403	0.25
404	0.27
405	0.23
406	0.22
407	0.21
408	0.23
409	0.21
410	0.21
411	0.2
412	0.17
413	0.13
414	0.12
415	0.13
416	0.13
417	0.22
418	0.25
419	0.33
420	0.35
421	0.39
422	0.42
423	0.45
424	0.46
425	0.47
426	0.49
427	0.51
428	0.53
429	0.59
430	0.58
431	0.58
432	0.62
433	0.53
434	0.47
435	0.41
436	0.4
437	0.39
438	0.44
439	0.42
440	0.37
441	0.44
442	0.45
443	0.42
444	0.39
445	0.32
446	0.31
447	0.31
448	0.3
449	0.24
450	0.26
451	0.26
452	0.33
453	0.35
454	0.3
455	0.34
456	0.35
457	0.33
458	0.32
459	0.34
460	0.32
461	0.32
462	0.31
463	0.28
464	0.27
465	0.27
466	0.26
467	0.23
468	0.21
469	0.21
470	0.24
471	0.27
472	0.29
473	0.36
474	0.41
475	0.51
476	0.55
477	0.55
478	0.58
479	0.64
480	0.68

Q2HED9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer