FuNGI

G3YDN4

Protein Details

Accession

G3YDN4

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
88-107	TTEKCRTTIRQHLKHWKADT	Hydrophilic
220-244	NNEAKVFNPEKKKRKREGYEEGDYT	Hydrophilic
358-386	LMRLREKETSKQKKERRKENERKRKEIVR	Basic
568-590	RPKGKESEKKKAKESKKPVQAME	Basic
694-717	MEAKGRKKMKAAQRLEKLRKKSAL	Hydrophilic
731-758	QAIARLMSRATKKKPKQQVKLVVAKGNN	Hydrophilic
775-794	VDSRMKKDIRAQKRLAKKKK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
230-235	KKKRKR
364-382	KETSKQKKERRKENERKRK
568-584	RPKGKESEKKKAKESKK
677-715	AIKEKMRAINARPIKKVMEAKGRKKMKAAQRLEKLRKKS
739-794	RATKKKPKQQVKLVVAKGNNRGISGRPRGVKGKYKIVDSRMKKDIRAQKRLAKKKK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002877 RNA_MeTrfase_FtsJ_dom IPR015507 rRNA-MeTfrase_E IPR012920 rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C IPR024576 rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381 IPR029063 SAM-dependent_MTases_sf IPR028589 SPB1-like
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0008649 F:rRNA methyltransferase activity
Pfam	View protein in Pfam PF11861 DUF3381 PF01728 FtsJ PF07780 Spb1_C

Amino Acid Sequences

HGKGRLDKWYRLAKEKGYRARAAFKLIQLNKKYGFLEKSKVVLDLCAAPGSWCQVAAECMPAQSIIVGVDLAPIKPIPRVITFQSDITTEKCRTTIRQHLKHWKADTVLHDGAPNVGTAWVQDAFSQAELVLQSLKLATEFLAEGGTFVTKVFRSKDYNPLLWVFKQLFASVEATKPPSSRNVSAEIFVVCRNYKAPKRIDPKFLDPKHVFAELADPTPNNEAKVFNPEKKKRKREGYEEGDYTQFKEIPVTEFINTTDPIAILGSYNKLSFQQSPSGDLALATLERLEDTTDEIKACCEDLKVLGKKEFRNLLRWRLKVREKFGLAVKKGAQTKEDETEEVAEVAPMDDELAIQEELMRLREKETSKQKKERRKENERKRKEIVRLQMHMTTPMDIGKEQLGPNGEDATFSLKRAERGGVRDTIAAGHEASIESDSEDSASESETEESDDEEDRLERELDNLYEQYQDRKEDRDTKLRAKKARKDFEADSWDGFSDSDKEEGEDSDDEGLGVSSAVDKAPKSASLSNSASLFFDQDIFQGLEDIDDVEDEDEEVEDEDSAIEVKEDRPKGKESEKKKAKESKKPVQAMEDSDEEDLEELEDPRKKNGQLDIDIITAEAMALAQQMATGEKKSHDVVDDGFNRFAFRDSDGLPEWFLDDENKHSVQNRPITKAAAAAIKEKMRAINARPIKKVMEAKGRKKMKAAQRLEKLRKKSALLADDEALSERDKSQAIARLMSRATKKKPKQQVKLVVAKGNNRGISGRPRGVKGKYKIVDSRMKKDIRAQKRLAKKKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.74
3	0.75
4	0.73
5	0.73
6	0.7
7	0.72
8	0.66
9	0.64
10	0.58
11	0.54
12	0.57
13	0.58
14	0.62
15	0.57
16	0.61
17	0.55
18	0.55
19	0.51
20	0.47
21	0.47
22	0.43
23	0.46
24	0.43
25	0.45
26	0.41
27	0.42
28	0.35
29	0.29
30	0.27
31	0.23
32	0.21
33	0.18
34	0.17
35	0.15
36	0.16
37	0.18
38	0.16
39	0.13
40	0.12
41	0.12
42	0.15
43	0.15
44	0.18
45	0.15
46	0.15
47	0.15
48	0.14
49	0.13
50	0.1
51	0.1
52	0.06
53	0.06
54	0.06
55	0.05
56	0.09
57	0.1
58	0.1
59	0.1
60	0.1
61	0.11
62	0.13
63	0.16
64	0.16
65	0.19
66	0.23
67	0.26
68	0.33
69	0.35
70	0.34
71	0.33
72	0.31
73	0.29
74	0.28
75	0.3
76	0.24
77	0.23
78	0.25
79	0.26
80	0.31
81	0.38
82	0.46
83	0.51
84	0.58
85	0.67
86	0.75
87	0.8
88	0.82
89	0.77
90	0.71
91	0.63
92	0.59
93	0.53
94	0.5
95	0.44
96	0.36
97	0.33
98	0.29
99	0.27
100	0.22
101	0.18
102	0.1
103	0.08
104	0.08
105	0.07
106	0.1
107	0.09
108	0.09
109	0.09
110	0.11
111	0.11
112	0.12
113	0.12
114	0.09
115	0.09
116	0.09
117	0.09
118	0.09
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.08
123	0.06
124	0.07
125	0.06
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.07
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.06
135	0.06
136	0.08
137	0.08
138	0.12
139	0.15
140	0.2
141	0.26
142	0.3
143	0.4
144	0.44
145	0.45
146	0.45
147	0.46
148	0.44
149	0.39
150	0.4
151	0.32
152	0.28
153	0.26
154	0.24
155	0.21
156	0.19
157	0.22
158	0.18
159	0.18
160	0.17
161	0.19
162	0.2
163	0.2
164	0.2
165	0.24
166	0.29
167	0.32
168	0.32
169	0.35
170	0.35
171	0.35
172	0.34
173	0.28
174	0.23
175	0.2
176	0.2
177	0.14
178	0.14
179	0.15
180	0.22
181	0.28
182	0.35
183	0.41
184	0.47
185	0.56
186	0.62
187	0.69
188	0.67
189	0.7
190	0.73
191	0.68
192	0.68
193	0.6
194	0.57
195	0.51
196	0.46
197	0.36
198	0.25
199	0.28
200	0.2
201	0.2
202	0.18
203	0.14
204	0.15
205	0.19
206	0.2
207	0.16
208	0.15
209	0.15
210	0.15
211	0.25
212	0.29
213	0.32
214	0.42
215	0.5
216	0.6
217	0.69
218	0.78
219	0.78
220	0.84
221	0.86
222	0.85
223	0.86
224	0.84
225	0.8
226	0.73
227	0.65
228	0.57
229	0.48
230	0.4
231	0.32
232	0.24
233	0.16
234	0.15
235	0.14
236	0.14
237	0.17
238	0.18
239	0.16
240	0.16
241	0.17
242	0.18
243	0.17
244	0.15
245	0.12
246	0.1
247	0.09
248	0.09
249	0.08
250	0.06
251	0.07
252	0.08
253	0.08
254	0.08
255	0.08
256	0.1
257	0.12
258	0.14
259	0.16
260	0.21
261	0.21
262	0.24
263	0.25
264	0.24
265	0.21
266	0.19
267	0.16
268	0.1
269	0.09
270	0.05
271	0.05
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.05
276	0.04
277	0.07
278	0.09
279	0.1
280	0.1
281	0.1
282	0.1
283	0.1
284	0.1
285	0.08
286	0.07
287	0.07
288	0.09
289	0.18
290	0.21
291	0.23
292	0.28
293	0.32
294	0.33
295	0.38
296	0.43
297	0.36
298	0.41
299	0.43
300	0.49
301	0.53
302	0.55
303	0.54
304	0.55
305	0.62
306	0.6
307	0.6
308	0.57
309	0.5
310	0.5
311	0.52
312	0.52
313	0.44
314	0.4
315	0.37
316	0.34
317	0.36
318	0.34
319	0.29
320	0.24
321	0.27
322	0.27
323	0.27
324	0.22
325	0.19
326	0.19
327	0.18
328	0.15
329	0.12
330	0.07
331	0.06
332	0.06
333	0.05
334	0.03
335	0.03
336	0.03
337	0.03
338	0.03
339	0.05
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.06
344	0.06
345	0.08
346	0.08
347	0.07
348	0.09
349	0.14
350	0.16
351	0.23
352	0.34
353	0.44
354	0.52
355	0.61
356	0.68
357	0.73
358	0.8
359	0.83
360	0.82
361	0.83
362	0.86
363	0.88
364	0.91
365	0.89
366	0.86
367	0.81
368	0.78
369	0.74
370	0.7
371	0.68
372	0.64
373	0.58
374	0.54
375	0.51
376	0.44
377	0.38
378	0.32
379	0.23
380	0.16
381	0.14
382	0.12
383	0.09
384	0.09
385	0.08
386	0.1
387	0.09
388	0.1
389	0.11
390	0.11
391	0.11
392	0.12
393	0.1
394	0.08
395	0.08
396	0.13
397	0.12
398	0.12
399	0.15
400	0.15
401	0.16
402	0.17
403	0.2
404	0.16
405	0.2
406	0.22
407	0.21
408	0.2
409	0.2
410	0.18
411	0.16
412	0.14
413	0.11
414	0.08
415	0.06
416	0.06
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.04
424	0.04
425	0.05
426	0.05
427	0.04
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.07
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.07
442	0.08
443	0.08
444	0.07
445	0.07
446	0.09
447	0.09
448	0.1
449	0.1
450	0.1
451	0.12
452	0.12
453	0.15
454	0.16
455	0.19
456	0.19
457	0.22
458	0.26
459	0.32
460	0.37
461	0.42
462	0.45
463	0.52
464	0.59
465	0.63
466	0.67
467	0.67
468	0.72
469	0.73
470	0.77
471	0.7
472	0.68
473	0.64
474	0.62
475	0.59
476	0.51
477	0.41
478	0.33
479	0.29
480	0.23
481	0.21
482	0.14
483	0.1
484	0.09
485	0.1
486	0.09
487	0.1
488	0.1
489	0.1
490	0.12
491	0.1
492	0.1
493	0.09
494	0.09
495	0.08
496	0.08
497	0.07
498	0.05
499	0.04
500	0.03
501	0.03
502	0.04
503	0.04
504	0.05
505	0.05
506	0.07
507	0.08
508	0.1
509	0.13
510	0.16
511	0.18
512	0.24
513	0.26
514	0.26
515	0.25
516	0.25
517	0.22
518	0.18
519	0.17
520	0.1
521	0.1
522	0.08
523	0.08
524	0.1
525	0.09
526	0.09
527	0.09
528	0.08
529	0.07
530	0.07
531	0.07
532	0.04
533	0.04
534	0.05
535	0.04
536	0.04
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.05
542	0.05
543	0.04
544	0.04
545	0.04
546	0.04
547	0.05
548	0.04
549	0.04
550	0.05
551	0.07
552	0.15
553	0.18
554	0.2
555	0.23
556	0.27
557	0.32
558	0.41
559	0.47
560	0.48
561	0.56
562	0.63
563	0.65
564	0.71
565	0.76
566	0.76
567	0.79
568	0.81
569	0.8
570	0.8
571	0.81
572	0.74
573	0.7
574	0.64
575	0.57
576	0.5
577	0.42
578	0.33
579	0.27
580	0.25
581	0.18
582	0.15
583	0.11
584	0.08
585	0.07
586	0.06
587	0.11
588	0.15
589	0.16
590	0.2
591	0.25
592	0.25
593	0.29
594	0.35
595	0.38
596	0.36
597	0.39
598	0.37
599	0.33
600	0.31
601	0.27
602	0.2
603	0.12
604	0.09
605	0.05
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.04
613	0.06
614	0.07
615	0.08
616	0.1
617	0.11
618	0.14
619	0.15
620	0.16
621	0.16
622	0.17
623	0.18
624	0.25
625	0.28
626	0.28
627	0.28
628	0.27
629	0.26
630	0.25
631	0.25
632	0.17
633	0.15
634	0.15
635	0.15
636	0.2
637	0.22
638	0.22
639	0.2
640	0.19
641	0.18
642	0.15
643	0.14
644	0.12
645	0.12
646	0.15
647	0.19
648	0.2
649	0.21
650	0.24
651	0.29
652	0.34
653	0.42
654	0.43
655	0.44
656	0.45
657	0.45
658	0.43
659	0.39
660	0.34
661	0.3
662	0.26
663	0.25
664	0.28
665	0.28
666	0.28
667	0.28
668	0.27
669	0.27
670	0.31
671	0.32
672	0.37
673	0.43
674	0.49
675	0.51
676	0.52
677	0.49
678	0.51
679	0.54
680	0.52
681	0.54
682	0.57
683	0.63
684	0.7
685	0.76
686	0.71
687	0.7
688	0.7
689	0.69
690	0.7
691	0.71
692	0.71
693	0.74
694	0.83
695	0.87
696	0.87
697	0.83
698	0.82
699	0.78
700	0.71
701	0.69
702	0.66
703	0.61
704	0.58
705	0.54
706	0.46
707	0.41
708	0.38
709	0.31
710	0.24
711	0.19
712	0.15
713	0.12
714	0.13
715	0.13
716	0.14
717	0.18
718	0.25
719	0.27
720	0.31
721	0.31
722	0.34
723	0.35
724	0.4
725	0.44
726	0.44
727	0.52
728	0.58
729	0.66
730	0.71
731	0.81
732	0.85
733	0.87
734	0.89
735	0.9
736	0.89
737	0.9
738	0.85
739	0.81
740	0.75
741	0.71
742	0.67
743	0.63
744	0.55
745	0.46
746	0.42
747	0.41
748	0.45
749	0.47
750	0.47
751	0.45
752	0.49
753	0.55
754	0.61
755	0.66
756	0.63
757	0.65
758	0.62
759	0.65
760	0.67
761	0.68
762	0.7
763	0.67
764	0.68
765	0.67
766	0.66
767	0.61
768	0.64
769	0.67
770	0.67
771	0.7
772	0.7
773	0.7
774	0.78

G3YDN4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer