Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q2HDA6

Protein Details
Accession Q2HDA6    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
181-206ATRGPSQDEARKRKRKQRDDDEDLEABasic
558-586AKLTGKAPGLNNKKRRDRRDRFVNRGGEAHydrophilic
606-641RASAKDGKPKDLKFKKGKTKAKPPNKKGRGGKVGKYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
191-196RKRKRK
557-578AAKLTGKAPGLNNKKRRDRRDR
605-641RRASAKDGKPKDLKFKKGKTKAKPPNKKGRGGKVGKY
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 9, cyto_mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MLWVLKRKKVLLDCPFLSRSEVPLFRPVFYNSSGKYPHLNLNHGRSFSAFLSAPIEPTNQLPTPPSIVSVHRNANIQQNGQKAGAVKTPPKSRYVDLLPQRPRATPENEGDEEDEDASESEEVEGSEEESGDEGGAELGSEGSDDDEDMLSGEDDSGDDEADAASSADDETAAAEVLERAATRGPSQDEARKRKRKQRDDDEDLEANYLERLANEEEPSGKRHKADSTEKDVVPTASKVEKEDDDELGGDVPVHESVAARPAVSELEKANRTVFLSNVAAEAITSRKAKKTLLKHLSSILDKKADPPQKVESIRFRSTAFESAGIPKRAAFIKKEVLEATTKSTNAYAVYSTTAAARLAVAQLNGTVVLDRHLRVDSVAHPAAVDHRRCVFVGNLGFVDDESVYNVKVNEEGKEVGERRKRTKTPMDVEEGLWRVFGKEGGKVESVRVVRDAATRVGKGFAYVQFYDGNSVESAILINGKKFPPMLPRELRVTRCKAPHKTARAMEARNQRAPAASDRKGGKPGTGSNSEGKYVPKPTAESQTLAGRASKLLGRFGAAKLTGKAPGLNNKKRRDRRDRFVNRGGEAAGGETSGIKGPEQFVFEGRRASAKDGKPKDLKFKKGKTKAKPPNKKGRGGKVGKY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.62
3 0.54
4 0.51
5 0.42
6 0.38
7 0.37
8 0.38
9 0.34
10 0.41
11 0.42
12 0.38
13 0.4
14 0.38
15 0.33
16 0.34
17 0.38
18 0.3
19 0.36
20 0.38
21 0.36
22 0.38
23 0.38
24 0.43
25 0.41
26 0.47
27 0.47
28 0.53
29 0.57
30 0.52
31 0.49
32 0.42
33 0.41
34 0.34
35 0.32
36 0.23
37 0.18
38 0.22
39 0.21
40 0.21
41 0.18
42 0.19
43 0.15
44 0.17
45 0.22
46 0.18
47 0.19
48 0.2
49 0.22
50 0.24
51 0.24
52 0.25
53 0.22
54 0.25
55 0.3
56 0.34
57 0.37
58 0.36
59 0.38
60 0.38
61 0.45
62 0.45
63 0.44
64 0.42
65 0.41
66 0.41
67 0.38
68 0.37
69 0.3
70 0.29
71 0.29
72 0.29
73 0.31
74 0.36
75 0.45
76 0.45
77 0.48
78 0.5
79 0.47
80 0.49
81 0.51
82 0.52
83 0.52
84 0.6
85 0.62
86 0.65
87 0.65
88 0.59
89 0.56
90 0.53
91 0.49
92 0.46
93 0.45
94 0.45
95 0.45
96 0.44
97 0.41
98 0.36
99 0.31
100 0.24
101 0.19
102 0.12
103 0.1
104 0.09
105 0.08
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.04
166 0.05
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.12
171 0.14
172 0.17
173 0.21
174 0.28
175 0.36
176 0.46
177 0.56
178 0.63
179 0.69
180 0.76
181 0.83
182 0.86
183 0.87
184 0.88
185 0.88
186 0.86
187 0.83
188 0.79
189 0.7
190 0.59
191 0.49
192 0.37
193 0.26
194 0.18
195 0.13
196 0.07
197 0.05
198 0.08
199 0.09
200 0.11
201 0.11
202 0.12
203 0.15
204 0.16
205 0.2
206 0.21
207 0.2
208 0.2
209 0.23
210 0.26
211 0.31
212 0.4
213 0.43
214 0.48
215 0.53
216 0.51
217 0.49
218 0.46
219 0.39
220 0.31
221 0.24
222 0.18
223 0.15
224 0.15
225 0.15
226 0.17
227 0.17
228 0.19
229 0.21
230 0.18
231 0.16
232 0.16
233 0.15
234 0.12
235 0.11
236 0.07
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.08
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.08
253 0.14
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.15
258 0.16
259 0.15
260 0.14
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.06
270 0.08
271 0.09
272 0.1
273 0.13
274 0.15
275 0.19
276 0.25
277 0.33
278 0.41
279 0.48
280 0.49
281 0.48
282 0.5
283 0.5
284 0.45
285 0.4
286 0.31
287 0.25
288 0.22
289 0.24
290 0.28
291 0.31
292 0.29
293 0.3
294 0.32
295 0.36
296 0.38
297 0.4
298 0.4
299 0.41
300 0.42
301 0.39
302 0.36
303 0.32
304 0.31
305 0.3
306 0.23
307 0.17
308 0.16
309 0.2
310 0.25
311 0.23
312 0.21
313 0.18
314 0.2
315 0.21
316 0.23
317 0.19
318 0.18
319 0.23
320 0.24
321 0.25
322 0.24
323 0.22
324 0.22
325 0.21
326 0.21
327 0.16
328 0.15
329 0.14
330 0.14
331 0.13
332 0.12
333 0.12
334 0.08
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.05
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.04
354 0.03
355 0.05
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.11
363 0.1
364 0.16
365 0.16
366 0.14
367 0.14
368 0.14
369 0.2
370 0.24
371 0.23
372 0.19
373 0.2
374 0.22
375 0.22
376 0.23
377 0.18
378 0.17
379 0.17
380 0.16
381 0.15
382 0.14
383 0.14
384 0.12
385 0.12
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.07
390 0.06
391 0.07
392 0.08
393 0.07
394 0.1
395 0.11
396 0.1
397 0.12
398 0.13
399 0.13
400 0.18
401 0.2
402 0.25
403 0.31
404 0.35
405 0.39
406 0.48
407 0.51
408 0.53
409 0.61
410 0.63
411 0.63
412 0.63
413 0.63
414 0.55
415 0.53
416 0.5
417 0.42
418 0.32
419 0.25
420 0.2
421 0.14
422 0.12
423 0.14
424 0.1
425 0.12
426 0.14
427 0.17
428 0.19
429 0.19
430 0.19
431 0.22
432 0.22
433 0.19
434 0.18
435 0.16
436 0.16
437 0.18
438 0.2
439 0.18
440 0.21
441 0.2
442 0.2
443 0.21
444 0.19
445 0.17
446 0.18
447 0.16
448 0.19
449 0.18
450 0.19
451 0.19
452 0.19
453 0.21
454 0.18
455 0.17
456 0.11
457 0.12
458 0.1
459 0.09
460 0.09
461 0.06
462 0.1
463 0.09
464 0.1
465 0.13
466 0.14
467 0.15
468 0.15
469 0.18
470 0.23
471 0.28
472 0.36
473 0.38
474 0.41
475 0.48
476 0.53
477 0.56
478 0.55
479 0.56
480 0.54
481 0.57
482 0.63
483 0.63
484 0.66
485 0.7
486 0.7
487 0.72
488 0.69
489 0.69
490 0.67
491 0.63
492 0.62
493 0.63
494 0.61
495 0.57
496 0.54
497 0.46
498 0.41
499 0.4
500 0.41
501 0.4
502 0.36
503 0.38
504 0.41
505 0.43
506 0.47
507 0.45
508 0.38
509 0.34
510 0.38
511 0.38
512 0.38
513 0.38
514 0.38
515 0.4
516 0.38
517 0.35
518 0.32
519 0.3
520 0.29
521 0.29
522 0.26
523 0.28
524 0.31
525 0.38
526 0.38
527 0.35
528 0.34
529 0.37
530 0.36
531 0.33
532 0.3
533 0.22
534 0.2
535 0.2
536 0.21
537 0.16
538 0.18
539 0.17
540 0.18
541 0.2
542 0.2
543 0.23
544 0.22
545 0.23
546 0.22
547 0.23
548 0.24
549 0.22
550 0.26
551 0.25
552 0.33
553 0.42
554 0.5
555 0.57
556 0.64
557 0.74
558 0.8
559 0.87
560 0.88
561 0.88
562 0.89
563 0.91
564 0.92
565 0.9
566 0.9
567 0.85
568 0.75
569 0.67
570 0.57
571 0.46
572 0.36
573 0.27
574 0.18
575 0.11
576 0.1
577 0.08
578 0.08
579 0.09
580 0.1
581 0.08
582 0.1
583 0.13
584 0.15
585 0.18
586 0.18
587 0.2
588 0.25
589 0.26
590 0.28
591 0.27
592 0.29
593 0.28
594 0.34
595 0.39
596 0.41
597 0.5
598 0.53
599 0.62
600 0.65
601 0.69
602 0.74
603 0.74
604 0.78
605 0.78
606 0.82
607 0.84
608 0.86
609 0.9
610 0.89
611 0.91
612 0.92
613 0.93
614 0.94
615 0.93
616 0.94
617 0.92
618 0.92
619 0.9
620 0.9
621 0.9