FuNGI

G0RKB6

Protein Details

Accession

G0RKB6

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
78-103	QRQASSQVKRPRGRPPKKPLGGEQKG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
86-98	KRPRGRPPKKPLG
126-129	KRGR
173-217	EPPPPTGMRGRPARRGGAAAGRPGRPPTKASKPQAGDKRPLSPKK
733-754	KKKSLSTPRAAPKRPSQPKRAA
933-934	RR

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, mito 13, cyto_nucl 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017956 AT_hook_DNA-bd_motif IPR001357 BRCT_dom IPR036420 BRCT_dom_sf IPR022047 Microcephalin-like IPR032450 SMARCC_N
Gene Ontology	GO:0003677 F:DNA binding
KEGG	tre:TRIREDRAFT_22417 -
Pfam	View protein in Pfam PF16496 SWIRM-assoc_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50172 BRCT
CDD	cd17716 BRCT_microcephalin_rpt1

Amino Acid Sequences

MRSPPKRLTRARAATKEPEAASSSSSSASRSSASSRPAKTVTASAAKARGPLSSSLTASTASTAAKRKTRSDDAEEEQRQASSQVKRPRGRPPKKPLGGEQKGVAMTAPVSAPIASKAAEPPEPVKRGRGRPPTVMKQATSTTTGANKPPVKKMVTFREPDKENMEPAAVPKEPPPPTGMRGRPARRGGAAAGRPGRPPTKASKPQAGDKRPLSPKKITQLILSRTDSADESEDELALEKVNAKPLAKSPIKPPSKKPEPIPAEIEPVDTNIAVNAMMFDMPEMSTTLFASPARRPTSPPRDTIKSPAKRMAVPLPGSALKLSSDAVAQTPFKSSAPSLLQSAAKRPQSPMKPFVFSAQQERAGESSTKPSMLHSPAKRAMPGFKPVLSAHRGLPALDETPVGTPTRAARSSTRLMMEEVAQEDDEDEEPFEGPIDIPRFSMSSPAGPSSEARFAAAEAEGEEEEEAVEEAVEEAEEAEEAEAEEVDAEDAEAEDEPQPNPRFSQLREKDLDPCHDMSAISDSEDDTLPFARVTATPSVSGEQTPRARASRSSARQSRRSTLGFGGLSEQLGTWSAASPVKSARSFVVENEPEDVEVEESNQDTPMKNASQPEGVALLDMEDIEDQQLDEGTMITDEDMALAQEANEMSLMDPKEEEEEDASNTRHSFDDSLSDASQEYGDENQVPIESPTPSAAPRAPPPVTPVSRPVTRSFNTTTKVPLKAADNSTPSPLKKKSLSTPRAAPKRPSQPKRAAPVLAYTPDRPRRRSSRNISTISEEPEQAAEEPSMPEPKTPEAKMDLWASIGTPARTPRRDLNPNLLRGAIVFVDVHTSEGADASGIFVEVLTQMGARCPQKWNWNPSNASNGESTKVGITHVVFKDGSKRTLEKVREAKGVVQCVGVSWVLDCERDNKWLDEAPYNIDTSNVPRGGARRRKSMEPKSISNKDGSAVSSSSSKERRESASSTSSSAKTPNRRQSSIWVRTPSDPGDEEQEEEEDIEWSNLILTPVPKTPAPEAIMKFATETPSNLDDDEYDEDDGSPTREELLTRTCPPKAQKYLELGGGILSRSKDTDENVMQRLMAARRKSLQFAPKVGSPLARMWQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.75
3	0.72
4	0.62
5	0.54
6	0.47
7	0.4
8	0.35
9	0.29
10	0.25
11	0.21
12	0.21
13	0.19
14	0.17
15	0.18
16	0.17
17	0.17
18	0.21
19	0.24
20	0.31
21	0.38
22	0.39
23	0.44
24	0.45
25	0.44
26	0.42
27	0.41
28	0.4
29	0.39
30	0.38
31	0.37
32	0.39
33	0.37
34	0.38
35	0.34
36	0.3
37	0.25
38	0.26
39	0.29
40	0.28
41	0.29
42	0.27
43	0.27
44	0.25
45	0.23
46	0.21
47	0.16
48	0.13
49	0.17
50	0.23
51	0.29
52	0.35
53	0.39
54	0.45
55	0.52
56	0.6
57	0.62
58	0.64
59	0.65
60	0.65
61	0.71
62	0.67
63	0.61
64	0.52
65	0.45
66	0.37
67	0.31
68	0.32
69	0.29
70	0.35
71	0.42
72	0.51
73	0.58
74	0.63
75	0.72
76	0.76
77	0.78
78	0.81
79	0.82
80	0.83
81	0.84
82	0.85
83	0.84
84	0.84
85	0.8
86	0.73
87	0.64
88	0.57
89	0.49
90	0.43
91	0.33
92	0.22
93	0.16
94	0.14
95	0.12
96	0.07
97	0.08
98	0.08
99	0.09
100	0.1
101	0.11
102	0.1
103	0.11
104	0.14
105	0.17
106	0.19
107	0.21
108	0.25
109	0.32
110	0.36
111	0.36
112	0.42
113	0.47
114	0.53
115	0.61
116	0.67
117	0.64
118	0.69
119	0.77
120	0.78
121	0.79
122	0.75
123	0.65
124	0.59
125	0.56
126	0.49
127	0.43
128	0.35
129	0.29
130	0.29
131	0.32
132	0.31
133	0.36
134	0.4
135	0.41
136	0.47
137	0.5
138	0.48
139	0.51
140	0.57
141	0.59
142	0.6
143	0.61
144	0.59
145	0.62
146	0.6
147	0.58
148	0.55
149	0.46
150	0.4
151	0.36
152	0.32
153	0.24
154	0.23
155	0.25
156	0.2
157	0.19
158	0.21
159	0.28
160	0.28
161	0.29
162	0.31
163	0.3
164	0.33
165	0.42
166	0.43
167	0.43
168	0.51
169	0.55
170	0.6
171	0.61
172	0.6
173	0.52
174	0.51
175	0.46
176	0.45
177	0.42
178	0.4
179	0.41
180	0.39
181	0.39
182	0.41
183	0.41
184	0.34
185	0.35
186	0.36
187	0.42
188	0.5
189	0.54
190	0.59
191	0.6
192	0.67
193	0.74
194	0.72
195	0.69
196	0.63
197	0.66
198	0.66
199	0.69
200	0.66
201	0.63
202	0.64
203	0.65
204	0.68
205	0.6
206	0.57
207	0.59
208	0.58
209	0.57
210	0.52
211	0.45
212	0.38
213	0.38
214	0.32
215	0.25
216	0.21
217	0.15
218	0.15
219	0.14
220	0.14
221	0.12
222	0.13
223	0.11
224	0.09
225	0.09
226	0.09
227	0.09
228	0.15
229	0.17
230	0.17
231	0.19
232	0.23
233	0.32
234	0.34
235	0.35
236	0.38
237	0.46
238	0.55
239	0.57
240	0.61
241	0.63
242	0.68
243	0.72
244	0.69
245	0.69
246	0.66
247	0.66
248	0.64
249	0.55
250	0.51
251	0.45
252	0.41
253	0.31
254	0.25
255	0.21
256	0.15
257	0.13
258	0.08
259	0.08
260	0.06
261	0.05
262	0.05
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.05
269	0.05
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.07
274	0.07
275	0.08
276	0.09
277	0.12
278	0.15
279	0.22
280	0.26
281	0.26
282	0.31
283	0.4
284	0.5
285	0.51
286	0.54
287	0.53
288	0.55
289	0.57
290	0.62
291	0.62
292	0.58
293	0.59
294	0.59
295	0.55
296	0.5
297	0.52
298	0.49
299	0.45
300	0.39
301	0.35
302	0.32
303	0.3
304	0.29
305	0.25
306	0.19
307	0.12
308	0.11
309	0.11
310	0.08
311	0.08
312	0.07
313	0.08
314	0.1
315	0.11
316	0.1
317	0.12
318	0.13
319	0.13
320	0.14
321	0.13
322	0.17
323	0.19
324	0.2
325	0.19
326	0.21
327	0.25
328	0.24
329	0.29
330	0.3
331	0.3
332	0.3
333	0.32
334	0.38
335	0.42
336	0.48
337	0.5
338	0.47
339	0.47
340	0.46
341	0.46
342	0.44
343	0.37
344	0.37
345	0.33
346	0.34
347	0.31
348	0.31
349	0.29
350	0.25
351	0.24
352	0.19
353	0.2
354	0.17
355	0.17
356	0.16
357	0.17
358	0.2
359	0.25
360	0.32
361	0.29
362	0.36
363	0.39
364	0.41
365	0.41
366	0.37
367	0.37
368	0.32
369	0.36
370	0.31
371	0.27
372	0.28
373	0.28
374	0.31
375	0.28
376	0.26
377	0.21
378	0.23
379	0.23
380	0.2
381	0.2
382	0.17
383	0.15
384	0.14
385	0.13
386	0.09
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.08
391	0.08
392	0.1
393	0.16
394	0.17
395	0.18
396	0.2
397	0.25
398	0.28
399	0.3
400	0.29
401	0.24
402	0.24
403	0.23
404	0.21
405	0.17
406	0.15
407	0.12
408	0.1
409	0.09
410	0.09
411	0.09
412	0.08
413	0.07
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.05
420	0.05
421	0.08
422	0.1
423	0.1
424	0.1
425	0.11
426	0.11
427	0.11
428	0.14
429	0.11
430	0.12
431	0.13
432	0.14
433	0.14
434	0.14
435	0.15
436	0.15
437	0.17
438	0.14
439	0.13
440	0.12
441	0.12
442	0.12
443	0.11
444	0.08
445	0.05
446	0.07
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.05
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.03
455	0.03
456	0.02
457	0.03
458	0.03
459	0.03
460	0.02
461	0.02
462	0.02
463	0.03
464	0.03
465	0.02
466	0.03
467	0.03
468	0.03
469	0.03
470	0.03
471	0.03
472	0.02
473	0.03
474	0.02
475	0.02
476	0.02
477	0.02
478	0.03
479	0.03
480	0.04
481	0.05
482	0.06
483	0.06
484	0.13
485	0.14
486	0.14
487	0.15
488	0.18
489	0.2
490	0.22
491	0.33
492	0.3
493	0.35
494	0.38
495	0.38
496	0.41
497	0.41
498	0.42
499	0.33
500	0.3
501	0.25
502	0.23
503	0.21
504	0.15
505	0.15
506	0.12
507	0.09
508	0.08
509	0.08
510	0.08
511	0.09
512	0.08
513	0.06
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.09
521	0.1
522	0.1
523	0.1
524	0.11
525	0.12
526	0.12
527	0.12
528	0.1
529	0.14
530	0.14
531	0.16
532	0.17
533	0.17
534	0.18
535	0.19
536	0.24
537	0.28
538	0.32
539	0.39
540	0.44
541	0.49
542	0.56
543	0.59
544	0.57
545	0.52
546	0.48
547	0.41
548	0.35
549	0.34
550	0.25
551	0.22
552	0.2
553	0.15
554	0.14
555	0.11
556	0.1
557	0.06
558	0.06
559	0.06
560	0.04
561	0.04
562	0.06
563	0.07
564	0.08
565	0.08
566	0.09
567	0.13
568	0.13
569	0.13
570	0.13
571	0.15
572	0.16
573	0.16
574	0.23
575	0.21
576	0.21
577	0.22
578	0.21
579	0.17
580	0.17
581	0.16
582	0.08
583	0.07
584	0.07
585	0.05
586	0.06
587	0.06
588	0.06
589	0.07
590	0.06
591	0.07
592	0.1
593	0.1
594	0.12
595	0.13
596	0.14
597	0.14
598	0.14
599	0.14
600	0.12
601	0.11
602	0.09
603	0.07
604	0.06
605	0.05
606	0.05
607	0.04
608	0.03
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.03
613	0.03
614	0.03
615	0.03
616	0.03
617	0.03
618	0.03
619	0.03
620	0.03
621	0.03
622	0.03
623	0.03
624	0.03
625	0.03
626	0.03
627	0.03
628	0.03
629	0.03
630	0.04
631	0.04
632	0.04
633	0.04
634	0.04
635	0.04
636	0.08
637	0.09
638	0.08
639	0.08
640	0.08
641	0.1
642	0.1
643	0.1
644	0.08
645	0.09
646	0.1
647	0.12
648	0.12
649	0.12
650	0.12
651	0.12
652	0.11
653	0.11
654	0.11
655	0.09
656	0.12
657	0.13
658	0.16
659	0.14
660	0.14
661	0.13
662	0.13
663	0.12
664	0.09
665	0.08
666	0.06
667	0.07
668	0.07
669	0.07
670	0.07
671	0.07
672	0.07
673	0.07
674	0.08
675	0.07
676	0.08
677	0.08
678	0.09
679	0.09
680	0.11
681	0.12
682	0.14
683	0.16
684	0.22
685	0.22
686	0.22
687	0.26
688	0.32
689	0.32
690	0.31
691	0.33
692	0.32
693	0.35
694	0.37
695	0.36
696	0.35
697	0.33
698	0.36
699	0.36
700	0.36
701	0.35
702	0.33
703	0.36
704	0.34
705	0.36
706	0.32
707	0.29
708	0.28
709	0.31
710	0.34
711	0.32
712	0.31
713	0.3
714	0.33
715	0.34
716	0.32
717	0.32
718	0.31
719	0.32
720	0.31
721	0.35
722	0.41
723	0.49
724	0.53
725	0.52
726	0.58
727	0.63
728	0.69
729	0.68
730	0.64
731	0.61
732	0.67
733	0.72
734	0.71
735	0.7
736	0.71
737	0.74
738	0.76
739	0.72
740	0.63
741	0.53
742	0.5
743	0.44
744	0.38
745	0.33
746	0.28
747	0.32
748	0.4
749	0.44
750	0.43
751	0.48
752	0.54
753	0.6
754	0.68
755	0.69
756	0.71
757	0.74
758	0.75
759	0.7
760	0.65
761	0.59
762	0.54
763	0.45
764	0.34
765	0.26
766	0.22
767	0.2
768	0.16
769	0.14
770	0.09
771	0.09
772	0.1
773	0.11
774	0.15
775	0.14
776	0.14
777	0.15
778	0.2
779	0.24
780	0.24
781	0.25
782	0.26
783	0.27
784	0.3
785	0.29
786	0.25
787	0.2
788	0.2
789	0.17
790	0.16
791	0.16
792	0.14
793	0.14
794	0.2
795	0.27
796	0.29
797	0.32
798	0.36
799	0.44
800	0.52
801	0.53
802	0.58
803	0.58
804	0.59
805	0.56
806	0.49
807	0.39
808	0.31
809	0.29
810	0.17
811	0.11
812	0.08
813	0.07
814	0.09
815	0.09
816	0.09
817	0.08
818	0.08
819	0.07
820	0.07
821	0.07
822	0.05
823	0.04
824	0.04
825	0.04
826	0.04
827	0.04
828	0.03
829	0.04
830	0.04
831	0.04
832	0.04
833	0.04
834	0.04
835	0.06
836	0.12
837	0.13
838	0.15
839	0.19
840	0.24
841	0.34
842	0.42
843	0.51
844	0.53
845	0.6
846	0.61
847	0.6
848	0.64
849	0.54
850	0.48
851	0.42
852	0.35
853	0.29
854	0.25
855	0.23
856	0.15
857	0.15
858	0.13
859	0.12
860	0.12
861	0.19
862	0.19
863	0.21
864	0.21
865	0.21
866	0.3
867	0.31
868	0.33
869	0.29
870	0.31
871	0.33
872	0.42
873	0.45
874	0.45
875	0.5
876	0.52
877	0.52
878	0.51
879	0.53
880	0.49
881	0.5
882	0.41
883	0.33
884	0.28
885	0.23
886	0.24
887	0.17
888	0.12
889	0.08
890	0.1
891	0.1
892	0.11
893	0.11
894	0.13
895	0.15
896	0.2
897	0.22
898	0.21
899	0.23
900	0.26
901	0.29
902	0.29
903	0.29
904	0.29
905	0.28
906	0.27
907	0.24
908	0.21
909	0.19
910	0.19
911	0.25
912	0.2
913	0.19
914	0.2
915	0.26
916	0.36
917	0.44
918	0.45
919	0.48
920	0.52
921	0.62
922	0.71
923	0.76
924	0.76
925	0.73
926	0.77
927	0.77
928	0.78
929	0.71
930	0.63
931	0.53
932	0.44
933	0.39
934	0.32
935	0.25
936	0.19
937	0.18
938	0.19
939	0.19
940	0.25
941	0.29
942	0.3
943	0.3
944	0.34
945	0.38
946	0.41
947	0.43
948	0.42
949	0.44
950	0.43
951	0.42
952	0.43
953	0.39
954	0.35
955	0.38
956	0.4
957	0.43
958	0.52
959	0.59
960	0.63
961	0.64
962	0.66
963	0.69
964	0.72
965	0.71
966	0.68
967	0.64
968	0.59
969	0.6
970	0.61
971	0.53
972	0.47
973	0.39
974	0.32
975	0.33
976	0.31
977	0.29
978	0.26
979	0.25
980	0.2
981	0.19
982	0.18
983	0.11
984	0.11
985	0.09
986	0.08
987	0.07
988	0.07
989	0.08
990	0.08
991	0.1
992	0.11
993	0.14
994	0.17
995	0.2
996	0.2
997	0.23
998	0.25
999	0.29
1000	0.31
1001	0.35
1002	0.34
1003	0.37
1004	0.38
1005	0.34
1006	0.33
1007	0.29
1008	0.3
1009	0.24
1010	0.23
1011	0.22
1012	0.23
1013	0.24
1014	0.22
1015	0.21
1016	0.17
1017	0.2
1018	0.23
1019	0.19
1020	0.18
1021	0.17
1022	0.17
1023	0.17
1024	0.18
1025	0.16
1026	0.13
1027	0.11
1028	0.12
1029	0.13
1030	0.13
1031	0.16
1032	0.22
1033	0.27
1034	0.32
1035	0.37
1036	0.37
1037	0.42
1038	0.49
1039	0.55
1040	0.57
1041	0.58
1042	0.59
1043	0.61
1044	0.63
1045	0.61
1046	0.54
1047	0.44
1048	0.36
1049	0.3
1050	0.24
1051	0.19
1052	0.16
1053	0.14
1054	0.14
1055	0.17
1056	0.18
1057	0.19
1058	0.28
1059	0.32
1060	0.37
1061	0.39
1062	0.39
1063	0.36
1064	0.34
1065	0.37
1066	0.35
1067	0.35
1068	0.33
1069	0.35
1070	0.42
1071	0.46
1072	0.49
1073	0.52
1074	0.55
1075	0.54
1076	0.56
1077	0.56
1078	0.53
1079	0.53
1080	0.5
1081	0.45
1082	0.38

G0RKB6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer