Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RHF1

Protein Details
Accession G0RHF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-56SLLLSPIRSTRRKERRNPSVTPRRFGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-44RKER
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 9, cyto_nucl 8.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG tre:TRIREDRAFT_106249  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MVHYHYGPSTASDAVPSSPPAIVSSPASSSLLLSPIRSTRRKERRNPSVTPRRFGRFFTPRSSLPSGRSVLGMLDGASVNNRQLASPMSFLSDPLSSDPLCPPSPSERLGVSGEHKRLLGETRAESAKRRRIAGDSQYGLQGLINGTIIEEDLTMTEGLSEDGAKAKETLESLGDRRKATLNLFFKASRSGSRGQEKSGLTPQRLFAADPKAPLQLEGYQPKPVRKFRDRGFESHLLDREHGFSLHHGRQHLSHPACDPRVETSSFYSRSNDLHHCVSSTGGGNTIPFSLASCHKASVTAIGDEQGCVRLFNTTLNDDLDDSKVDVYISVHDNAIMDLAFSQDDMRLATACGDRSGRILDVPTQTVAAELGGGHWDSLRQVAFQPGEAAGNVIASSDRAGRIQIWDLRCSSSPVNSFSCPSGIGQRDTSLEPLQAKGVNTIDNAHERTVQGNTSSASVTAIHWMPPGREHLLLSASEANASIKLWDTRYIKPRRQAEETPLAVTQEPRGHTWRSYGITSLALSSDAARLYAVCKDSTVYAYSTSHLMLGHAPELEDGATKRRPNGAHGLGPMYGFKHELFRAQSFYVKCDIRPGINGSSELLAVGSTDGCALLFPTDERYIRSAWAKRSHMAPEPSFATPSQSISTPSAFGSSATPLIPISRLGTPLIRGHSREVTTLSWSHDGKLVTASDDYIVRQWQQDEARARYLRQVGEFGGERHLAGWADVGDDWDTPDDDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.17
4 0.16
5 0.15
6 0.16
7 0.16
8 0.17
9 0.17
10 0.18
11 0.19
12 0.19
13 0.2
14 0.21
15 0.19
16 0.19
17 0.18
18 0.2
19 0.18
20 0.17
21 0.19
22 0.25
23 0.33
24 0.38
25 0.43
26 0.5
27 0.61
28 0.7
29 0.77
30 0.81
31 0.84
32 0.86
33 0.88
34 0.88
35 0.88
36 0.85
37 0.82
38 0.77
39 0.74
40 0.68
41 0.64
42 0.63
43 0.62
44 0.6
45 0.6
46 0.59
47 0.53
48 0.58
49 0.61
50 0.54
51 0.48
52 0.5
53 0.45
54 0.4
55 0.38
56 0.31
57 0.24
58 0.22
59 0.18
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.11
65 0.11
66 0.1
67 0.13
68 0.13
69 0.11
70 0.13
71 0.16
72 0.17
73 0.18
74 0.18
75 0.19
76 0.19
77 0.19
78 0.2
79 0.17
80 0.15
81 0.16
82 0.18
83 0.15
84 0.17
85 0.2
86 0.22
87 0.22
88 0.22
89 0.23
90 0.27
91 0.31
92 0.31
93 0.3
94 0.26
95 0.28
96 0.29
97 0.28
98 0.28
99 0.32
100 0.32
101 0.31
102 0.3
103 0.27
104 0.27
105 0.29
106 0.28
107 0.25
108 0.25
109 0.28
110 0.32
111 0.33
112 0.38
113 0.43
114 0.47
115 0.46
116 0.47
117 0.45
118 0.46
119 0.53
120 0.54
121 0.54
122 0.48
123 0.45
124 0.43
125 0.41
126 0.35
127 0.27
128 0.2
129 0.11
130 0.09
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.12
155 0.12
156 0.13
157 0.12
158 0.15
159 0.18
160 0.24
161 0.28
162 0.26
163 0.28
164 0.3
165 0.3
166 0.31
167 0.37
168 0.35
169 0.33
170 0.36
171 0.35
172 0.32
173 0.34
174 0.32
175 0.26
176 0.26
177 0.3
178 0.33
179 0.42
180 0.43
181 0.4
182 0.45
183 0.43
184 0.43
185 0.46
186 0.43
187 0.36
188 0.37
189 0.35
190 0.32
191 0.32
192 0.29
193 0.25
194 0.27
195 0.26
196 0.26
197 0.26
198 0.25
199 0.24
200 0.23
201 0.21
202 0.18
203 0.22
204 0.26
205 0.26
206 0.31
207 0.33
208 0.38
209 0.43
210 0.46
211 0.5
212 0.53
213 0.6
214 0.59
215 0.68
216 0.65
217 0.62
218 0.64
219 0.62
220 0.57
221 0.54
222 0.51
223 0.41
224 0.39
225 0.35
226 0.29
227 0.23
228 0.2
229 0.15
230 0.14
231 0.2
232 0.22
233 0.24
234 0.23
235 0.23
236 0.25
237 0.29
238 0.35
239 0.29
240 0.28
241 0.29
242 0.33
243 0.33
244 0.32
245 0.29
246 0.23
247 0.25
248 0.24
249 0.22
250 0.21
251 0.26
252 0.27
253 0.27
254 0.26
255 0.24
256 0.24
257 0.28
258 0.27
259 0.24
260 0.25
261 0.24
262 0.22
263 0.21
264 0.2
265 0.16
266 0.14
267 0.11
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.09
272 0.08
273 0.07
274 0.05
275 0.06
276 0.08
277 0.1
278 0.13
279 0.13
280 0.13
281 0.13
282 0.14
283 0.13
284 0.15
285 0.15
286 0.12
287 0.11
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.12
292 0.1
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.08
298 0.1
299 0.12
300 0.1
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.13
306 0.11
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.06
323 0.04
324 0.03
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.1
342 0.11
343 0.09
344 0.08
345 0.09
346 0.11
347 0.12
348 0.12
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.06
355 0.04
356 0.03
357 0.03
358 0.04
359 0.04
360 0.03
361 0.03
362 0.04
363 0.04
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.08
376 0.05
377 0.05
378 0.04
379 0.04
380 0.03
381 0.03
382 0.04
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.06
387 0.06
388 0.08
389 0.12
390 0.16
391 0.16
392 0.18
393 0.18
394 0.2
395 0.2
396 0.21
397 0.18
398 0.18
399 0.19
400 0.2
401 0.22
402 0.21
403 0.22
404 0.19
405 0.19
406 0.16
407 0.14
408 0.17
409 0.16
410 0.17
411 0.17
412 0.17
413 0.19
414 0.19
415 0.2
416 0.15
417 0.15
418 0.13
419 0.13
420 0.14
421 0.14
422 0.13
423 0.13
424 0.13
425 0.12
426 0.12
427 0.13
428 0.13
429 0.15
430 0.16
431 0.15
432 0.15
433 0.14
434 0.16
435 0.15
436 0.14
437 0.11
438 0.11
439 0.11
440 0.11
441 0.1
442 0.09
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.1
447 0.1
448 0.09
449 0.11
450 0.11
451 0.11
452 0.12
453 0.16
454 0.15
455 0.15
456 0.15
457 0.15
458 0.16
459 0.15
460 0.16
461 0.14
462 0.11
463 0.11
464 0.11
465 0.1
466 0.08
467 0.08
468 0.07
469 0.07
470 0.09
471 0.1
472 0.16
473 0.2
474 0.26
475 0.36
476 0.45
477 0.49
478 0.55
479 0.62
480 0.61
481 0.65
482 0.62
483 0.59
484 0.6
485 0.55
486 0.49
487 0.41
488 0.36
489 0.3
490 0.27
491 0.23
492 0.18
493 0.18
494 0.19
495 0.22
496 0.23
497 0.23
498 0.26
499 0.28
500 0.26
501 0.26
502 0.24
503 0.22
504 0.21
505 0.2
506 0.17
507 0.12
508 0.1
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.07
513 0.07
514 0.07
515 0.07
516 0.08
517 0.11
518 0.12
519 0.11
520 0.11
521 0.12
522 0.13
523 0.15
524 0.15
525 0.12
526 0.13
527 0.14
528 0.14
529 0.15
530 0.13
531 0.13
532 0.11
533 0.11
534 0.1
535 0.1
536 0.11
537 0.1
538 0.1
539 0.09
540 0.09
541 0.09
542 0.09
543 0.08
544 0.12
545 0.17
546 0.19
547 0.21
548 0.27
549 0.28
550 0.31
551 0.39
552 0.39
553 0.38
554 0.39
555 0.39
556 0.33
557 0.32
558 0.28
559 0.2
560 0.16
561 0.13
562 0.12
563 0.14
564 0.14
565 0.19
566 0.22
567 0.24
568 0.27
569 0.27
570 0.32
571 0.28
572 0.3
573 0.32
574 0.28
575 0.26
576 0.3
577 0.31
578 0.27
579 0.3
580 0.32
581 0.3
582 0.3
583 0.31
584 0.25
585 0.23
586 0.21
587 0.17
588 0.12
589 0.08
590 0.06
591 0.06
592 0.05
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.04
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.06
602 0.11
603 0.15
604 0.16
605 0.18
606 0.2
607 0.21
608 0.24
609 0.32
610 0.33
611 0.37
612 0.46
613 0.47
614 0.48
615 0.51
616 0.53
617 0.53
618 0.54
619 0.47
620 0.43
621 0.43
622 0.42
623 0.39
624 0.33
625 0.31
626 0.24
627 0.26
628 0.23
629 0.2
630 0.22
631 0.23
632 0.24
633 0.2
634 0.19
635 0.18
636 0.16
637 0.16
638 0.14
639 0.14
640 0.14
641 0.13
642 0.13
643 0.12
644 0.13
645 0.13
646 0.12
647 0.13
648 0.14
649 0.15
650 0.16
651 0.18
652 0.2
653 0.24
654 0.29
655 0.3
656 0.3
657 0.34
658 0.39
659 0.38
660 0.37
661 0.36
662 0.31
663 0.31
664 0.32
665 0.31
666 0.3
667 0.29
668 0.28
669 0.3
670 0.28
671 0.25
672 0.26
673 0.23
674 0.19
675 0.19
676 0.18
677 0.15
678 0.16
679 0.16
680 0.15
681 0.17
682 0.17
683 0.2
684 0.2
685 0.25
686 0.28
687 0.34
688 0.4
689 0.42
690 0.49
691 0.48
692 0.49
693 0.49
694 0.52
695 0.48
696 0.42
697 0.4
698 0.32
699 0.36
700 0.37
701 0.3
702 0.29
703 0.26
704 0.23
705 0.21
706 0.22
707 0.16
708 0.14
709 0.15
710 0.1
711 0.11
712 0.11
713 0.13
714 0.12
715 0.12
716 0.13
717 0.13
718 0.13