Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RNT2

Protein Details
Accession G0RNT2    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-253VWKNGRKTKHDTKVIYKKCPQKMLQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
163-169GKKRGRT
178-179KR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR008251  Chromo_shadow_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG tre:TRIREDRAFT_109088  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01393  Chromo_shadow  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
cd18657  CSD_Swi6  
Amino Acid Sequences MPPALSDEEASDFESAPPVKPSRNSASRSVSDADDASTKPRRNGRAAAKKDLKEVDDDVDIDDDVDVKDADEEDEEDEEGLEDDVFIVEAIKKHMIDEDVWTDDASFTGLTMANWEGYDKKSDMTWEPEENLVESAGEILSAYLESIGGREKIFEETQEASRGKKRGRTTSATPGATKRSRRNGTHPADSAPPATADKWSPPAGSWEDEIQTIDACEDEGSGRLVVYLVWKNGRKTKHDTKVIYKKCPQKMLQFYERHVKIIREENKALTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.17
4 0.21
5 0.23
6 0.27
7 0.3
8 0.37
9 0.41
10 0.48
11 0.51
12 0.53
13 0.58
14 0.55
15 0.56
16 0.51
17 0.42
18 0.36
19 0.32
20 0.26
21 0.21
22 0.2
23 0.22
24 0.27
25 0.28
26 0.33
27 0.4
28 0.44
29 0.47
30 0.56
31 0.61
32 0.64
33 0.67
34 0.72
35 0.73
36 0.69
37 0.69
38 0.64
39 0.53
40 0.46
41 0.41
42 0.33
43 0.26
44 0.25
45 0.2
46 0.17
47 0.15
48 0.12
49 0.1
50 0.08
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.05
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.05
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.03
74 0.04
75 0.05
76 0.06
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.11
82 0.12
83 0.11
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.15
88 0.14
89 0.13
90 0.12
91 0.11
92 0.09
93 0.06
94 0.04
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.11
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.12
110 0.13
111 0.18
112 0.2
113 0.18
114 0.19
115 0.2
116 0.19
117 0.18
118 0.16
119 0.1
120 0.07
121 0.06
122 0.05
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.02
127 0.02
128 0.02
129 0.02
130 0.02
131 0.02
132 0.02
133 0.03
134 0.04
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.07
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.12
143 0.14
144 0.15
145 0.2
146 0.2
147 0.19
148 0.24
149 0.28
150 0.28
151 0.32
152 0.37
153 0.41
154 0.47
155 0.51
156 0.52
157 0.57
158 0.62
159 0.57
160 0.53
161 0.46
162 0.48
163 0.47
164 0.48
165 0.45
166 0.49
167 0.54
168 0.57
169 0.63
170 0.66
171 0.67
172 0.67
173 0.61
174 0.53
175 0.48
176 0.45
177 0.37
178 0.27
179 0.22
180 0.16
181 0.15
182 0.14
183 0.13
184 0.14
185 0.18
186 0.18
187 0.18
188 0.17
189 0.21
190 0.22
191 0.23
192 0.22
193 0.2
194 0.19
195 0.19
196 0.19
197 0.15
198 0.12
199 0.1
200 0.09
201 0.07
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.12
214 0.14
215 0.16
216 0.23
217 0.27
218 0.32
219 0.39
220 0.44
221 0.45
222 0.51
223 0.59
224 0.62
225 0.68
226 0.7
227 0.74
228 0.8
229 0.82
230 0.82
231 0.8
232 0.79
233 0.78
234 0.8
235 0.75
236 0.74
237 0.76
238 0.76
239 0.77
240 0.73
241 0.69
242 0.71
243 0.66
244 0.6
245 0.53
246 0.46
247 0.43
248 0.48
249 0.51
250 0.49
251 0.51