Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RTW1

Protein Details
Accession G0RTW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-67APITPAQLSAPRKKRKRSKKTTASRGPTALHydrophilic
106-129RIESCIQRYRSRRRIQARRATYLNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-63PRKKRKRSKKTTASRG
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12, nucl 10.5, pero 2, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018606  Arb1  
Gene Ontology GO:0033167  C:ARC complex  
GO:0031047  P:RNA-mediated gene silencing  
KEGG tre:TRIREDRAFT_81420  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09692  Arb1  
Amino Acid Sequences MPEIDESVAPTKHLLPVEVAAESEDDAYDDVEDDAPDAPITPAQLSAPRKKRKRSKKTTASRGPTALPKNRGNGFEEYFADPPMTPAEAMQEKQEIYAPDIPFERRIESCIQRYRSRRRIQARRATYLNDYLFLGGVDTNPSAYTGLDQKDLKQLTPAQRREATARDVVYNGSGAGDRFYDGDKTKWTVDFAGVAAGFFSTRLIVLTGLHPKPMEEAISVVENFLRYVLHHDVCPEYEESVKKALDICQMARDEWTSLNTLQTALPGVFNPAATELFVEFDPYSWDSSQFRVPEGFDAKSVFYSSVAMLDDNKMFEHLAGRAVELVNQYECALEVTAVHLPPEEVIQRFKKLAITAPGDKTFRLMPLGKLTLKPATIEDGWVQRGTVHPLQGKEVDLYFEQNILKSLRPGIKMVLEIGDLGADVCFVKSIQKIMPTFYTFLPQELMVQFKLPQENDRPAPSVHNPTMEDNQGAEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.19
3 0.21
4 0.22
5 0.21
6 0.19
7 0.15
8 0.14
9 0.13
10 0.11
11 0.09
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.07
16 0.07
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.09
25 0.09
26 0.09
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.19
32 0.25
33 0.34
34 0.44
35 0.53
36 0.61
37 0.71
38 0.81
39 0.85
40 0.9
41 0.91
42 0.92
43 0.92
44 0.95
45 0.95
46 0.95
47 0.92
48 0.86
49 0.78
50 0.71
51 0.68
52 0.66
53 0.63
54 0.6
55 0.56
56 0.57
57 0.59
58 0.57
59 0.53
60 0.49
61 0.44
62 0.4
63 0.38
64 0.35
65 0.31
66 0.29
67 0.25
68 0.19
69 0.17
70 0.16
71 0.14
72 0.1
73 0.09
74 0.15
75 0.17
76 0.18
77 0.19
78 0.2
79 0.19
80 0.19
81 0.23
82 0.18
83 0.19
84 0.26
85 0.24
86 0.23
87 0.26
88 0.27
89 0.27
90 0.28
91 0.26
92 0.2
93 0.23
94 0.28
95 0.32
96 0.39
97 0.43
98 0.47
99 0.52
100 0.61
101 0.68
102 0.72
103 0.74
104 0.75
105 0.78
106 0.83
107 0.86
108 0.87
109 0.84
110 0.8
111 0.74
112 0.68
113 0.61
114 0.57
115 0.47
116 0.37
117 0.3
118 0.24
119 0.21
120 0.17
121 0.14
122 0.07
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.11
133 0.13
134 0.17
135 0.17
136 0.18
137 0.25
138 0.26
139 0.24
140 0.23
141 0.28
142 0.34
143 0.44
144 0.45
145 0.44
146 0.46
147 0.48
148 0.48
149 0.45
150 0.39
151 0.33
152 0.31
153 0.26
154 0.23
155 0.22
156 0.19
157 0.15
158 0.11
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.1
168 0.11
169 0.13
170 0.14
171 0.16
172 0.18
173 0.18
174 0.18
175 0.15
176 0.15
177 0.14
178 0.12
179 0.11
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.03
188 0.03
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.08
194 0.16
195 0.16
196 0.16
197 0.16
198 0.16
199 0.17
200 0.17
201 0.15
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.05
213 0.04
214 0.09
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.14
219 0.15
220 0.15
221 0.16
222 0.12
223 0.09
224 0.11
225 0.12
226 0.12
227 0.14
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.15
232 0.17
233 0.17
234 0.17
235 0.18
236 0.19
237 0.18
238 0.18
239 0.16
240 0.13
241 0.12
242 0.13
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.06
252 0.07
253 0.06
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.09
269 0.09
270 0.11
271 0.1
272 0.13
273 0.12
274 0.14
275 0.18
276 0.16
277 0.17
278 0.16
279 0.16
280 0.18
281 0.21
282 0.19
283 0.16
284 0.17
285 0.16
286 0.15
287 0.15
288 0.11
289 0.08
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.08
305 0.11
306 0.1
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.13
311 0.12
312 0.13
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.08
317 0.09
318 0.08
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.07
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.08
328 0.09
329 0.11
330 0.12
331 0.11
332 0.16
333 0.19
334 0.22
335 0.23
336 0.24
337 0.24
338 0.23
339 0.27
340 0.28
341 0.31
342 0.34
343 0.38
344 0.42
345 0.4
346 0.38
347 0.35
348 0.29
349 0.24
350 0.24
351 0.21
352 0.19
353 0.25
354 0.3
355 0.3
356 0.3
357 0.32
358 0.3
359 0.29
360 0.27
361 0.21
362 0.21
363 0.2
364 0.2
365 0.2
366 0.21
367 0.22
368 0.21
369 0.2
370 0.16
371 0.18
372 0.23
373 0.23
374 0.25
375 0.26
376 0.27
377 0.31
378 0.32
379 0.31
380 0.26
381 0.23
382 0.21
383 0.18
384 0.2
385 0.17
386 0.18
387 0.17
388 0.16
389 0.18
390 0.17
391 0.18
392 0.17
393 0.23
394 0.26
395 0.28
396 0.29
397 0.29
398 0.3
399 0.3
400 0.29
401 0.24
402 0.18
403 0.16
404 0.14
405 0.11
406 0.08
407 0.07
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.04
412 0.05
413 0.05
414 0.09
415 0.11
416 0.15
417 0.17
418 0.24
419 0.25
420 0.29
421 0.35
422 0.34
423 0.35
424 0.32
425 0.36
426 0.29
427 0.3
428 0.27
429 0.22
430 0.23
431 0.22
432 0.25
433 0.18
434 0.19
435 0.21
436 0.23
437 0.3
438 0.27
439 0.32
440 0.36
441 0.43
442 0.47
443 0.48
444 0.47
445 0.42
446 0.47
447 0.47
448 0.5
449 0.45
450 0.45
451 0.44
452 0.46
453 0.5
454 0.46
455 0.4