Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RKM2

Protein Details
Accession G0RKM2    Localization Confidence Low Confidence Score 5.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-80LEDLAPHRRRQARKQALAQSTSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 10, plas 8, extr 5, nucl 1, cyto 1, cyto_nucl 1, pero 1, E.R. 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006369  Protohaem_IX_farnesylTrfase  
IPR016315  Protohaem_IX_farnesylTrfase_mt  
IPR000537  UbiA_prenyltransferase  
IPR030470  UbiA_prenylTrfase_CS  
IPR044878  UbiA_sf  
Gene Ontology GO:0031966  C:mitochondrial membrane  
GO:0008495  F:protoheme IX farnesyltransferase activity  
GO:0006784  P:heme A biosynthetic process  
KEGG tre:TRIREDRAFT_28159  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01040  UbiA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00943  UBIA  
CDD cd13957  PT_UbiA_Cox10  
Amino Acid Sequences PLGAVFFLQNRLLARSSCLDSVVPRRNSRATSTSSSTSPSNSTPTTPPPNFTSQTPQSLEDLAPHRRRQARKQALAQSTSSEAPLPPDASSLLTSAAASQPKDSLRRTISTFLSLSKPRLTVLVVLSAMAPYALYPVPEMLTPTMTETPSLSPLTLFFLTTGTALCSASANTLNMLYEPSTDAKMSRTRNRPLVRGLVSNRAAALFAMLCGVGGAAALYFGVNPTVSFLGLSNIVLYAGIYTPLKAVTVFNTWVGAVVGGIPPLMGWAAAAGEAATKDGSWRELLLASDGSSIGGWLLAGLLFAWQFPHFMALSWPIREEYKAAGLRMLAWTNPARNARVALRYSLAFFPLCFGLCAAGVTDWSFAVTSLPINLWLAREAVRFWKYEGHKGSARGLFWASVWHLPGVMILALLHKKGMWSRAWRSVFGEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.25
3 0.28
4 0.26
5 0.26
6 0.24
7 0.27
8 0.36
9 0.42
10 0.44
11 0.45
12 0.5
13 0.54
14 0.56
15 0.57
16 0.53
17 0.5
18 0.5
19 0.51
20 0.49
21 0.45
22 0.45
23 0.39
24 0.36
25 0.32
26 0.28
27 0.28
28 0.26
29 0.28
30 0.3
31 0.36
32 0.44
33 0.42
34 0.44
35 0.43
36 0.49
37 0.47
38 0.46
39 0.47
40 0.42
41 0.48
42 0.47
43 0.44
44 0.38
45 0.38
46 0.35
47 0.32
48 0.33
49 0.35
50 0.39
51 0.4
52 0.47
53 0.53
54 0.61
55 0.65
56 0.71
57 0.72
58 0.74
59 0.81
60 0.82
61 0.8
62 0.76
63 0.66
64 0.57
65 0.49
66 0.41
67 0.32
68 0.23
69 0.17
70 0.16
71 0.18
72 0.17
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.15
78 0.13
79 0.11
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.13
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.17
88 0.2
89 0.25
90 0.26
91 0.29
92 0.3
93 0.33
94 0.36
95 0.38
96 0.36
97 0.35
98 0.34
99 0.3
100 0.32
101 0.31
102 0.3
103 0.28
104 0.27
105 0.23
106 0.24
107 0.22
108 0.19
109 0.17
110 0.18
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.13
115 0.12
116 0.08
117 0.07
118 0.03
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.08
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.11
131 0.13
132 0.12
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.15
137 0.15
138 0.12
139 0.1
140 0.1
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.11
171 0.18
172 0.23
173 0.3
174 0.37
175 0.41
176 0.5
177 0.52
178 0.53
179 0.5
180 0.51
181 0.45
182 0.43
183 0.4
184 0.39
185 0.37
186 0.34
187 0.3
188 0.23
189 0.21
190 0.15
191 0.13
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.11
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.07
243 0.05
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.02
253 0.02
254 0.02
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.05
281 0.04
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.02
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.04
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.1
299 0.15
300 0.18
301 0.18
302 0.19
303 0.18
304 0.19
305 0.19
306 0.19
307 0.15
308 0.2
309 0.22
310 0.21
311 0.21
312 0.2
313 0.21
314 0.23
315 0.21
316 0.13
317 0.15
318 0.17
319 0.18
320 0.24
321 0.26
322 0.25
323 0.25
324 0.28
325 0.29
326 0.33
327 0.32
328 0.28
329 0.28
330 0.27
331 0.28
332 0.26
333 0.24
334 0.17
335 0.15
336 0.15
337 0.14
338 0.14
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.09
343 0.1
344 0.09
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.1
360 0.11
361 0.11
362 0.11
363 0.12
364 0.14
365 0.14
366 0.15
367 0.22
368 0.24
369 0.23
370 0.24
371 0.32
372 0.33
373 0.42
374 0.45
375 0.44
376 0.46
377 0.48
378 0.54
379 0.5
380 0.46
381 0.39
382 0.35
383 0.29
384 0.25
385 0.26
386 0.21
387 0.2
388 0.21
389 0.18
390 0.17
391 0.16
392 0.17
393 0.14
394 0.11
395 0.08
396 0.07
397 0.12
398 0.13
399 0.13
400 0.14
401 0.12
402 0.15
403 0.19
404 0.25
405 0.27
406 0.35
407 0.42
408 0.52
409 0.55
410 0.54
411 0.54