FuNGI

G0RAW1

Protein Details

Accession

G0RAW1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
406-438	PDVVLVKKHYPNRRRNRRRNWKLKRMNKDEGDL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
413-432	KHYPNRRRNRRRNWKLKRMN

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto 8, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005634 C:nucleus GO:0070180 F:large ribosomal subunit rRNA binding GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
KEGG	tre:TRIREDRAFT_120081 -
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MSMDLDDAISIAPVSQQMHTAATILCHNCGAPIDGTTATGAACYDCIKLTNDISQGIQREATIQQCRDCERWLLPPSSWISAMPESRELLALCLKKLRGLNKVRIVDASFIWTEPHSRRVKVKLTVQDAVQQGVLLQQSFEVVYVVAHQQCPECAKSFTPNHWRACVQVRQKVLHKRTFHFLEQLVLKHGAHRETLNIKEAKDGIDFFFSVRNQAEKFVDFLNSVVPVKVKSSQELISMDTHTSKKSYKFTFSAELVPVCRDDLVALPIKLAKQSGNISPLVLCHKIGTAVYLMDPQTLQTAEVSSSIYWRAPFTALADAMELVEFIIMDIEPTPTRKGKWVLAEATVARASDLGVNDKTYFTRTHLGNLLQPGDSAMGYMLSGTNFNNPEFDAIEESNTYSSTVPDVVLVKKHYPNRRRNRRRNWKLKRMNKDEGDLLPKKADQERMDKEYEMFLRDVEEDEELRAALALYKNPKKTNDEEMSIAETEDDEEDGVPGVNMDELLDDFDELTMED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.1
3	0.13
4	0.14
5	0.15
6	0.16
7	0.16
8	0.14
9	0.14
10	0.2
11	0.19
12	0.19
13	0.18
14	0.18
15	0.17
16	0.18
17	0.18
18	0.13
19	0.13
20	0.15
21	0.14
22	0.15
23	0.14
24	0.13
25	0.1
26	0.1
27	0.09
28	0.06
29	0.07
30	0.08
31	0.08
32	0.09
33	0.11
34	0.14
35	0.17
36	0.19
37	0.23
38	0.24
39	0.24
40	0.25
41	0.27
42	0.27
43	0.25
44	0.23
45	0.18
46	0.19
47	0.2
48	0.26
49	0.29
50	0.3
51	0.32
52	0.35
53	0.4
54	0.4
55	0.39
56	0.37
57	0.33
58	0.39
59	0.4
60	0.4
61	0.35
62	0.39
63	0.4
64	0.37
65	0.35
66	0.26
67	0.25
68	0.27
69	0.29
70	0.26
71	0.25
72	0.23
73	0.23
74	0.25
75	0.2
76	0.17
77	0.22
78	0.21
79	0.19
80	0.23
81	0.23
82	0.25
83	0.3
84	0.34
85	0.37
86	0.43
87	0.51
88	0.56
89	0.59
90	0.55
91	0.53
92	0.49
93	0.41
94	0.34
95	0.28
96	0.2
97	0.17
98	0.17
99	0.15
100	0.18
101	0.18
102	0.27
103	0.27
104	0.3
105	0.36
106	0.42
107	0.49
108	0.51
109	0.57
110	0.57
111	0.59
112	0.58
113	0.53
114	0.52
115	0.45
116	0.39
117	0.3
118	0.22
119	0.15
120	0.15
121	0.15
122	0.09
123	0.08
124	0.07
125	0.07
126	0.07
127	0.07
128	0.05
129	0.04
130	0.04
131	0.06
132	0.09
133	0.1
134	0.11
135	0.11
136	0.12
137	0.13
138	0.16
139	0.17
140	0.16
141	0.16
142	0.18
143	0.25
144	0.28
145	0.35
146	0.43
147	0.48
148	0.48
149	0.5
150	0.49
151	0.44
152	0.48
153	0.48
154	0.44
155	0.42
156	0.44
157	0.45
158	0.52
159	0.59
160	0.59
161	0.59
162	0.57
163	0.54
164	0.57
165	0.58
166	0.52
167	0.46
168	0.39
169	0.36
170	0.33
171	0.31
172	0.26
173	0.23
174	0.21
175	0.2
176	0.22
177	0.18
178	0.17
179	0.17
180	0.18
181	0.21
182	0.23
183	0.26
184	0.25
185	0.24
186	0.25
187	0.25
188	0.22
189	0.19
190	0.18
191	0.13
192	0.13
193	0.13
194	0.11
195	0.14
196	0.12
197	0.14
198	0.13
199	0.14
200	0.13
201	0.16
202	0.17
203	0.14
204	0.15
205	0.14
206	0.14
207	0.12
208	0.12
209	0.1
210	0.1
211	0.1
212	0.09
213	0.08
214	0.07
215	0.09
216	0.14
217	0.14
218	0.14
219	0.17
220	0.17
221	0.19
222	0.2
223	0.2
224	0.16
225	0.17
226	0.16
227	0.15
228	0.15
229	0.13
230	0.14
231	0.15
232	0.18
233	0.23
234	0.26
235	0.28
236	0.29
237	0.32
238	0.34
239	0.33
240	0.31
241	0.26
242	0.24
243	0.2
244	0.18
245	0.15
246	0.11
247	0.09
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.08
252	0.1
253	0.09
254	0.09
255	0.11
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.09
260	0.1
261	0.12
262	0.14
263	0.16
264	0.16
265	0.15
266	0.15
267	0.15
268	0.16
269	0.14
270	0.12
271	0.1
272	0.1
273	0.1
274	0.1
275	0.1
276	0.07
277	0.06
278	0.07
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.07
284	0.08
285	0.08
286	0.07
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.07
291	0.08
292	0.06
293	0.07
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.1
302	0.12
303	0.11
304	0.11
305	0.11
306	0.1
307	0.09
308	0.08
309	0.06
310	0.04
311	0.03
312	0.03
313	0.02
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.04
318	0.05
319	0.06
320	0.08
321	0.11
322	0.12
323	0.14
324	0.19
325	0.22
326	0.25
327	0.31
328	0.35
329	0.34
330	0.34
331	0.35
332	0.3
333	0.29
334	0.25
335	0.19
336	0.13
337	0.11
338	0.1
339	0.1
340	0.1
341	0.12
342	0.12
343	0.13
344	0.14
345	0.15
346	0.15
347	0.15
348	0.15
349	0.15
350	0.21
351	0.2
352	0.23
353	0.26
354	0.27
355	0.28
356	0.3
357	0.28
358	0.22
359	0.21
360	0.18
361	0.14
362	0.13
363	0.1
364	0.07
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.11
373	0.13
374	0.13
375	0.14
376	0.13
377	0.14
378	0.14
379	0.15
380	0.14
381	0.13
382	0.14
383	0.13
384	0.14
385	0.13
386	0.12
387	0.12
388	0.09
389	0.09
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.1
394	0.13
395	0.14
396	0.17
397	0.2
398	0.24
399	0.3
400	0.38
401	0.46
402	0.54
403	0.63
404	0.7
405	0.79
406	0.85
407	0.9
408	0.93
409	0.95
410	0.96
411	0.97
412	0.97
413	0.96
414	0.96
415	0.95
416	0.94
417	0.92
418	0.91
419	0.83
420	0.76
421	0.7
422	0.63
423	0.62
424	0.54
425	0.47
426	0.39
427	0.36
428	0.36
429	0.36
430	0.39
431	0.35
432	0.42
433	0.47
434	0.5
435	0.52
436	0.49
437	0.45
438	0.43
439	0.41
440	0.34
441	0.27
442	0.21
443	0.21
444	0.2
445	0.21
446	0.16
447	0.16
448	0.13
449	0.14
450	0.14
451	0.12
452	0.11
453	0.1
454	0.08
455	0.1
456	0.12
457	0.17
458	0.26
459	0.33
460	0.4
461	0.45
462	0.5
463	0.52
464	0.55
465	0.61
466	0.58
467	0.55
468	0.51
469	0.49
470	0.47
471	0.41
472	0.36
473	0.25
474	0.18
475	0.16
476	0.13
477	0.11
478	0.08
479	0.07
480	0.08
481	0.08
482	0.08
483	0.07
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.06
488	0.05
489	0.06
490	0.06
491	0.08
492	0.08
493	0.08
494	0.08
495	0.08

G0RAW1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer