Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RH46

Protein Details
Accession G0RH46    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
406-434AWQRHIKGAAHKRVMKKKKRLALVPVDQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
412-425KGAAHKRVMKKKKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG tre:TRIREDRAFT_59994  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
PF12874  zf-met  
Amino Acid Sequences MAAHAPPAEPLLVVLGSTGTGKSELAVELARRFKGEIINSDAMQLYDGLPIITNKISHEERHGIPHHLLGHIPLDDAPWDVEKFKTEASKVIGEIRSRGNLPILVGGTQYYVDPLLFKDVILDDVKADPSLSFPILEQPTDVLLEELKKVDPIMAERWHPNDRRKIQRSLEIYLHTGRPASELYAEQVQRKAAAAQDAGTSLPWEKLLFRVYSERETLTARLDSRVDKMLDAGLLNEVQELFDMKQRKAAEGQILDMTKGIWQSIGYKQFEPYMSAKQEGKGPEELEKLKNSGLEDMKTATRRYANYQTKWIRLKQIPRLKEQGPGAFDSLYVVDSTDVSQFKTKVIEPAAEVTAKFLAGEPRPMPTELSDVARELLTRVSEPPPKETPAKKTCEICQTVCVTEQAWQRHIKGAAHKRVMKKKKRLALVPVDQSPDDRSDAEASSEPDVTSLFAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.07
3 0.07
4 0.08
5 0.08
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.08
10 0.09
11 0.09
12 0.1
13 0.13
14 0.14
15 0.2
16 0.25
17 0.25
18 0.24
19 0.25
20 0.26
21 0.31
22 0.33
23 0.32
24 0.36
25 0.39
26 0.38
27 0.39
28 0.36
29 0.29
30 0.25
31 0.2
32 0.12
33 0.09
34 0.1
35 0.08
36 0.09
37 0.09
38 0.11
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.19
43 0.21
44 0.22
45 0.28
46 0.32
47 0.32
48 0.4
49 0.42
50 0.39
51 0.38
52 0.4
53 0.35
54 0.3
55 0.28
56 0.22
57 0.21
58 0.18
59 0.17
60 0.13
61 0.12
62 0.11
63 0.12
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.15
70 0.16
71 0.17
72 0.21
73 0.2
74 0.23
75 0.26
76 0.28
77 0.27
78 0.32
79 0.33
80 0.29
81 0.31
82 0.3
83 0.29
84 0.27
85 0.27
86 0.22
87 0.2
88 0.19
89 0.19
90 0.17
91 0.14
92 0.13
93 0.13
94 0.11
95 0.1
96 0.09
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.14
108 0.15
109 0.14
110 0.1
111 0.12
112 0.12
113 0.11
114 0.11
115 0.08
116 0.09
117 0.11
118 0.1
119 0.09
120 0.09
121 0.16
122 0.17
123 0.17
124 0.15
125 0.14
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.11
140 0.15
141 0.17
142 0.2
143 0.22
144 0.27
145 0.33
146 0.37
147 0.41
148 0.47
149 0.53
150 0.61
151 0.64
152 0.68
153 0.65
154 0.67
155 0.64
156 0.58
157 0.53
158 0.44
159 0.41
160 0.35
161 0.31
162 0.24
163 0.2
164 0.16
165 0.13
166 0.12
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.11
171 0.16
172 0.17
173 0.17
174 0.18
175 0.17
176 0.16
177 0.16
178 0.15
179 0.11
180 0.12
181 0.11
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.08
188 0.06
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.08
194 0.11
195 0.1
196 0.11
197 0.16
198 0.18
199 0.2
200 0.21
201 0.19
202 0.18
203 0.19
204 0.18
205 0.15
206 0.15
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.15
212 0.18
213 0.16
214 0.14
215 0.14
216 0.13
217 0.12
218 0.11
219 0.09
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.09
230 0.12
231 0.12
232 0.17
233 0.17
234 0.18
235 0.19
236 0.21
237 0.22
238 0.2
239 0.21
240 0.19
241 0.19
242 0.18
243 0.16
244 0.14
245 0.1
246 0.09
247 0.08
248 0.05
249 0.05
250 0.08
251 0.14
252 0.2
253 0.21
254 0.22
255 0.22
256 0.25
257 0.25
258 0.25
259 0.23
260 0.23
261 0.22
262 0.24
263 0.25
264 0.23
265 0.27
266 0.25
267 0.25
268 0.22
269 0.21
270 0.22
271 0.25
272 0.27
273 0.25
274 0.25
275 0.23
276 0.22
277 0.22
278 0.19
279 0.21
280 0.2
281 0.18
282 0.18
283 0.19
284 0.21
285 0.22
286 0.22
287 0.19
288 0.21
289 0.22
290 0.28
291 0.36
292 0.42
293 0.42
294 0.52
295 0.54
296 0.58
297 0.61
298 0.58
299 0.56
300 0.53
301 0.59
302 0.59
303 0.63
304 0.6
305 0.61
306 0.64
307 0.56
308 0.56
309 0.51
310 0.46
311 0.39
312 0.37
313 0.32
314 0.26
315 0.24
316 0.19
317 0.15
318 0.11
319 0.09
320 0.07
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.11
325 0.11
326 0.12
327 0.15
328 0.16
329 0.17
330 0.19
331 0.19
332 0.21
333 0.22
334 0.22
335 0.2
336 0.23
337 0.24
338 0.22
339 0.21
340 0.17
341 0.15
342 0.13
343 0.12
344 0.1
345 0.14
346 0.15
347 0.21
348 0.19
349 0.22
350 0.24
351 0.25
352 0.25
353 0.2
354 0.23
355 0.2
356 0.23
357 0.21
358 0.19
359 0.2
360 0.19
361 0.17
362 0.14
363 0.14
364 0.12
365 0.12
366 0.14
367 0.2
368 0.26
369 0.27
370 0.33
371 0.35
372 0.38
373 0.45
374 0.48
375 0.52
376 0.55
377 0.6
378 0.6
379 0.6
380 0.62
381 0.64
382 0.63
383 0.55
384 0.52
385 0.48
386 0.44
387 0.41
388 0.35
389 0.26
390 0.27
391 0.32
392 0.3
393 0.32
394 0.34
395 0.35
396 0.4
397 0.44
398 0.43
399 0.47
400 0.53
401 0.58
402 0.63
403 0.68
404 0.71
405 0.78
406 0.84
407 0.84
408 0.85
409 0.84
410 0.84
411 0.86
412 0.84
413 0.83
414 0.83
415 0.82
416 0.79
417 0.73
418 0.68
419 0.59
420 0.53
421 0.47
422 0.39
423 0.31
424 0.24
425 0.22
426 0.21
427 0.22
428 0.24
429 0.24
430 0.23
431 0.23
432 0.24
433 0.21
434 0.18
435 0.18