Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5A346

Protein Details
Accession Q5A346    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-31MANSHRNTLKHDHKPFKSKHATKGQIKARIKHydrophilic
44-69SKSSKVVSKLERKNLSKQQRDNKILEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-45HKPFKSKHATKGQIKARIKGKVEKSSNSSGGSK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012948  AARP2CN  
IPR039761  Bms1/Tsr1  
IPR007034  BMS1_TSR1_C  
IPR030387  G_Bms1/Tsr1_dom  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0043021  F:ribonucleoprotein complex binding  
GO:0034511  F:U3 snoRNA binding  
GO:0000479  P:endonucleolytic cleavage of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000461  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG cal:CAALFM_CR08490WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08142  AARP2CN  
PF04950  RIBIOP_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51714  G_BMS1  
Amino Acid Sequences MANSHRNTLKHDHKPFKSKHATKGQIKARIKGKVEKSSNSSGGSKSSKVVSKLERKNLSKQQRDNKILETKLTKKLFEGNSGAEKIVTIITLTNDLSAVDIANRLFNEQEDTSNESITRFDFGYPSVTNINIAKFKTNLKVIIPKQNNMISILDAAQVSDFVLLGISATEEIGENSFGETVLRALIAQGISTTIGVLPNIVSAYPKRNLQLDVKQSLQSFYHHFFPSRDGSSNRGSGTDSGGNKLYSLELDSDNSNCLRIICQKFPQSITWRDSRGWLVADKVEIFNPNGMPVENQQQMMVVEGMVRGVGFNVNRLVHLPGLGDFQLHKLEKLARKARGNSSRNHRGGMDIDTGNDGDAEETFLPNEQQESLDELNPDEGIDMGTMEDDDDFLNNDNFGVRSEGKIYFDNGNSNGTSSSSTGKKLVPRGTSEYQGRWFVDDVLDEDASDLEEQREGEGEEEEDANIVDDDMMVEDNMEADDITDSIHDSEMMHVDLSPEEESRQLEEYRSLAKDDLEFPDEIELHPNESAIERLKGFRGVKSLGNCDWDYDEYDPEAPSILKRLFQVSNYKATKNKVNKQFIKQTEITAGNRVRLYIIIPPGASNNVSSVIGSCSSVPFPVYELLEHEHKLGVCNFSFEAWQDYEKPIINKEQIIVQYGPRRQIIQPLYNQANNNPNNVHKLENFVHHNQGGGGAIIATAITPVLFTNSPTLFFKIHPDADDSSNSNGGSVEFVGKGTYLGSDAKRIMVQRVVLTGHPIKIHKRVVTIRYMFFNREDINYFKAVSLFTKNSGRVGFIKESLGTHGYFKANFDGKLTSQDVVAMSLYKRSWPEVSTAWNKFNY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.82
3 0.83
4 0.84
5 0.81
6 0.8
7 0.81
8 0.83
9 0.81
10 0.85
11 0.83
12 0.82
13 0.79
14 0.77
15 0.73
16 0.72
17 0.69
18 0.68
19 0.69
20 0.69
21 0.71
22 0.69
23 0.68
24 0.68
25 0.66
26 0.61
27 0.54
28 0.45
29 0.46
30 0.43
31 0.38
32 0.33
33 0.35
34 0.37
35 0.37
36 0.43
37 0.46
38 0.52
39 0.6
40 0.68
41 0.71
42 0.71
43 0.77
44 0.8
45 0.82
46 0.81
47 0.81
48 0.82
49 0.83
50 0.85
51 0.78
52 0.76
53 0.74
54 0.66
55 0.63
56 0.61
57 0.57
58 0.6
59 0.59
60 0.52
61 0.45
62 0.51
63 0.48
64 0.46
65 0.43
66 0.38
67 0.41
68 0.42
69 0.4
70 0.31
71 0.28
72 0.22
73 0.18
74 0.14
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.12
93 0.12
94 0.17
95 0.16
96 0.19
97 0.19
98 0.25
99 0.24
100 0.25
101 0.24
102 0.2
103 0.2
104 0.18
105 0.17
106 0.12
107 0.12
108 0.12
109 0.12
110 0.17
111 0.16
112 0.18
113 0.18
114 0.17
115 0.19
116 0.2
117 0.23
118 0.22
119 0.22
120 0.23
121 0.24
122 0.28
123 0.31
124 0.33
125 0.32
126 0.33
127 0.41
128 0.43
129 0.52
130 0.52
131 0.48
132 0.5
133 0.51
134 0.47
135 0.4
136 0.36
137 0.26
138 0.23
139 0.21
140 0.17
141 0.13
142 0.12
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.06
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.09
190 0.15
191 0.17
192 0.19
193 0.21
194 0.23
195 0.27
196 0.32
197 0.38
198 0.4
199 0.41
200 0.41
201 0.42
202 0.4
203 0.39
204 0.33
205 0.27
206 0.24
207 0.23
208 0.27
209 0.25
210 0.26
211 0.25
212 0.28
213 0.31
214 0.3
215 0.31
216 0.27
217 0.3
218 0.32
219 0.34
220 0.3
221 0.26
222 0.24
223 0.21
224 0.23
225 0.25
226 0.21
227 0.21
228 0.22
229 0.21
230 0.2
231 0.19
232 0.15
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.11
238 0.12
239 0.12
240 0.13
241 0.13
242 0.12
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.19
247 0.24
248 0.27
249 0.33
250 0.37
251 0.4
252 0.42
253 0.46
254 0.43
255 0.44
256 0.44
257 0.42
258 0.4
259 0.38
260 0.38
261 0.33
262 0.29
263 0.24
264 0.21
265 0.18
266 0.16
267 0.17
268 0.16
269 0.14
270 0.13
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.12
275 0.12
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.17
281 0.17
282 0.17
283 0.16
284 0.16
285 0.16
286 0.16
287 0.14
288 0.08
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.04
294 0.03
295 0.03
296 0.06
297 0.05
298 0.07
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.12
303 0.13
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.08
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.09
313 0.14
314 0.13
315 0.13
316 0.13
317 0.2
318 0.24
319 0.33
320 0.38
321 0.4
322 0.45
323 0.5
324 0.57
325 0.61
326 0.6
327 0.58
328 0.6
329 0.64
330 0.6
331 0.57
332 0.47
333 0.39
334 0.37
335 0.34
336 0.28
337 0.18
338 0.17
339 0.16
340 0.16
341 0.14
342 0.12
343 0.08
344 0.04
345 0.04
346 0.06
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.1
358 0.11
359 0.12
360 0.12
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.1
365 0.06
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.04
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.11
390 0.12
391 0.14
392 0.14
393 0.16
394 0.15
395 0.16
396 0.17
397 0.15
398 0.16
399 0.14
400 0.14
401 0.12
402 0.1
403 0.1
404 0.09
405 0.11
406 0.11
407 0.12
408 0.13
409 0.15
410 0.18
411 0.23
412 0.27
413 0.26
414 0.28
415 0.34
416 0.34
417 0.37
418 0.36
419 0.32
420 0.3
421 0.3
422 0.27
423 0.21
424 0.19
425 0.15
426 0.13
427 0.11
428 0.1
429 0.1
430 0.09
431 0.08
432 0.08
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.06
437 0.04
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.04
453 0.04
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.03
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.04
476 0.05
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.08
488 0.09
489 0.1
490 0.12
491 0.11
492 0.11
493 0.12
494 0.13
495 0.16
496 0.16
497 0.15
498 0.13
499 0.13
500 0.14
501 0.15
502 0.16
503 0.15
504 0.14
505 0.14
506 0.15
507 0.15
508 0.13
509 0.14
510 0.12
511 0.11
512 0.11
513 0.11
514 0.09
515 0.1
516 0.11
517 0.09
518 0.11
519 0.1
520 0.11
521 0.13
522 0.18
523 0.19
524 0.19
525 0.21
526 0.22
527 0.25
528 0.27
529 0.3
530 0.25
531 0.29
532 0.27
533 0.24
534 0.24
535 0.21
536 0.2
537 0.17
538 0.17
539 0.13
540 0.14
541 0.13
542 0.11
543 0.11
544 0.09
545 0.08
546 0.12
547 0.12
548 0.12
549 0.13
550 0.18
551 0.18
552 0.21
553 0.3
554 0.28
555 0.37
556 0.38
557 0.4
558 0.39
559 0.41
560 0.48
561 0.48
562 0.55
563 0.55
564 0.63
565 0.68
566 0.71
567 0.78
568 0.72
569 0.7
570 0.62
571 0.53
572 0.49
573 0.46
574 0.39
575 0.37
576 0.34
577 0.3
578 0.29
579 0.28
580 0.22
581 0.18
582 0.18
583 0.16
584 0.17
585 0.15
586 0.15
587 0.15
588 0.15
589 0.17
590 0.16
591 0.11
592 0.1
593 0.1
594 0.1
595 0.1
596 0.09
597 0.1
598 0.1
599 0.1
600 0.09
601 0.09
602 0.09
603 0.1
604 0.09
605 0.08
606 0.09
607 0.11
608 0.11
609 0.1
610 0.12
611 0.15
612 0.17
613 0.17
614 0.16
615 0.16
616 0.15
617 0.18
618 0.18
619 0.19
620 0.16
621 0.18
622 0.17
623 0.16
624 0.16
625 0.14
626 0.16
627 0.14
628 0.15
629 0.15
630 0.17
631 0.19
632 0.22
633 0.22
634 0.21
635 0.25
636 0.26
637 0.25
638 0.24
639 0.27
640 0.25
641 0.28
642 0.26
643 0.25
644 0.31
645 0.32
646 0.36
647 0.32
648 0.34
649 0.3
650 0.38
651 0.4
652 0.39
653 0.41
654 0.45
655 0.48
656 0.49
657 0.49
658 0.45
659 0.47
660 0.42
661 0.41
662 0.36
663 0.34
664 0.35
665 0.36
666 0.35
667 0.26
668 0.31
669 0.31
670 0.35
671 0.38
672 0.36
673 0.4
674 0.36
675 0.36
676 0.29
677 0.27
678 0.21
679 0.14
680 0.11
681 0.06
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.03
686 0.03
687 0.03
688 0.03
689 0.03
690 0.03
691 0.07
692 0.07
693 0.08
694 0.14
695 0.14
696 0.17
697 0.19
698 0.22
699 0.2
700 0.21
701 0.27
702 0.28
703 0.3
704 0.28
705 0.3
706 0.31
707 0.32
708 0.35
709 0.3
710 0.27
711 0.27
712 0.25
713 0.21
714 0.19
715 0.16
716 0.14
717 0.12
718 0.12
719 0.09
720 0.1
721 0.1
722 0.1
723 0.09
724 0.08
725 0.08
726 0.07
727 0.12
728 0.13
729 0.17
730 0.17
731 0.19
732 0.22
733 0.23
734 0.25
735 0.25
736 0.26
737 0.23
738 0.26
739 0.26
740 0.23
741 0.28
742 0.28
743 0.27
744 0.28
745 0.3
746 0.33
747 0.39
748 0.46
749 0.42
750 0.47
751 0.52
752 0.53
753 0.59
754 0.59
755 0.54
756 0.55
757 0.55
758 0.49
759 0.43
760 0.44
761 0.36
762 0.34
763 0.35
764 0.3
765 0.31
766 0.3
767 0.29
768 0.24
769 0.23
770 0.21
771 0.2
772 0.25
773 0.23
774 0.26
775 0.32
776 0.33
777 0.36
778 0.35
779 0.36
780 0.32
781 0.36
782 0.35
783 0.3
784 0.32
785 0.29
786 0.29
787 0.3
788 0.29
789 0.23
790 0.21
791 0.24
792 0.25
793 0.24
794 0.25
795 0.29
796 0.3
797 0.3
798 0.3
799 0.3
800 0.28
801 0.34
802 0.34
803 0.27
804 0.23
805 0.25
806 0.23
807 0.19
808 0.19
809 0.15
810 0.13
811 0.17
812 0.18
813 0.2
814 0.21
815 0.24
816 0.27
817 0.25
818 0.3
819 0.29
820 0.38
821 0.43
822 0.47