FuNGI

G0RA79

Protein Details

Accession

G0RA79

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-29	PSPAPAPASQSKRDRKRQVLVERLST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
225-229	KKRKR

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013907 Sds3
Gene Ontology	GO:0005654 C:nucleoplasm
KEGG	tre:TRIREDRAFT_103949 -
Pfam	View protein in Pfam PF08598 Sds3

Amino Acid Sequences

MDRPSPAPAPASQSKRDRKRQVLVERLSTMSDKMQRDRDLTYRDQLSKIQYEVGLVQRFDPYAVNALEKADELLREYRQAQGPPVLAEGARSLVDMAGIRFPEFMDEVEDLIEVRDFQLVQSKNEYERKVQEYKNTHAYKVETAKREHRALTETLRDRLINSLTQKKNRLNREKEVLEINDSSALLLNPSQFSLTNPASPGGAHGKRATRLRKDAEELQVFADGKKRKRNPGEDDGSPAPSRRALDPNSTTPLWQSEKARAAAKQNGPVYSIDKLFTEKELSLHYNSAALAAHQYVLRNRVNGSESRDGSTPSNPESNDADKDDAESQPPSAAPMMERQVSHATRSTRGGASQNFLDDKILGIEGIANFELPANLDLMHAQEPPKMPPPVPQQYLKPYPRSSDQNFPVPLSQDDISSDLSVMSFFKQYDQTHKPGAHLDAPSGLRKVLEAVAVPYHQSRYVAFTSAAREDPEHLRDVLGIPLSNLRDQSSPVAMSRQNSGQGGVPMSRQGTTGSARGKGRRG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.7
3	0.79
4	0.81
5	0.82
6	0.85
7	0.87
8	0.88
9	0.87
10	0.83
11	0.79
12	0.72
13	0.64
14	0.56
15	0.47
16	0.38
17	0.35
18	0.36
19	0.34
20	0.37
21	0.44
22	0.45
23	0.47
24	0.5
25	0.51
26	0.5
27	0.5
28	0.51
29	0.51
30	0.5
31	0.49
32	0.49
33	0.47
34	0.44
35	0.41
36	0.36
37	0.29
38	0.27
39	0.29
40	0.32
41	0.3
42	0.26
43	0.26
44	0.25
45	0.25
46	0.24
47	0.22
48	0.16
49	0.17
50	0.18
51	0.18
52	0.17
53	0.17
54	0.17
55	0.16
56	0.16
57	0.12
58	0.11
59	0.13
60	0.16
61	0.17
62	0.2
63	0.2
64	0.25
65	0.28
66	0.3
67	0.3
68	0.31
69	0.31
70	0.28
71	0.29
72	0.23
73	0.18
74	0.17
75	0.15
76	0.12
77	0.1
78	0.09
79	0.08
80	0.07
81	0.09
82	0.09
83	0.09
84	0.11
85	0.11
86	0.11
87	0.11
88	0.11
89	0.12
90	0.12
91	0.11
92	0.11
93	0.11
94	0.11
95	0.11
96	0.11
97	0.09
98	0.09
99	0.09
100	0.06
101	0.06
102	0.07
103	0.06
104	0.07
105	0.15
106	0.16
107	0.18
108	0.23
109	0.25
110	0.3
111	0.37
112	0.39
113	0.36
114	0.41
115	0.45
116	0.48
117	0.48
118	0.51
119	0.51
120	0.54
121	0.59
122	0.55
123	0.49
124	0.45
125	0.44
126	0.42
127	0.44
128	0.46
129	0.41
130	0.43
131	0.5
132	0.53
133	0.54
134	0.49
135	0.43
136	0.4
137	0.38
138	0.39
139	0.4
140	0.37
141	0.36
142	0.36
143	0.33
144	0.3
145	0.3
146	0.27
147	0.22
148	0.24
149	0.32
150	0.37
151	0.42
152	0.49
153	0.53
154	0.59
155	0.65
156	0.7
157	0.67
158	0.68
159	0.71
160	0.65
161	0.6
162	0.57
163	0.47
164	0.4
165	0.33
166	0.27
167	0.19
168	0.18
169	0.15
170	0.11
171	0.1
172	0.07
173	0.07
174	0.08
175	0.07
176	0.07
177	0.08
178	0.07
179	0.09
180	0.14
181	0.15
182	0.15
183	0.15
184	0.16
185	0.15
186	0.14
187	0.16
188	0.18
189	0.18
190	0.18
191	0.21
192	0.23
193	0.27
194	0.35
195	0.4
196	0.38
197	0.44
198	0.47
199	0.47
200	0.49
201	0.5
202	0.5
203	0.45
204	0.39
205	0.32
206	0.31
207	0.27
208	0.23
209	0.24
210	0.22
211	0.25
212	0.34
213	0.38
214	0.44
215	0.53
216	0.61
217	0.62
218	0.67
219	0.67
220	0.59
221	0.59
222	0.52
223	0.46
224	0.37
225	0.3
226	0.21
227	0.17
228	0.18
229	0.15
230	0.19
231	0.19
232	0.25
233	0.28
234	0.3
235	0.32
236	0.31
237	0.29
238	0.24
239	0.26
240	0.22
241	0.21
242	0.2
243	0.21
244	0.25
245	0.27
246	0.28
247	0.26
248	0.28
249	0.33
250	0.33
251	0.34
252	0.32
253	0.3
254	0.3
255	0.28
256	0.26
257	0.2
258	0.19
259	0.13
260	0.12
261	0.13
262	0.12
263	0.12
264	0.12
265	0.11
266	0.11
267	0.13
268	0.15
269	0.14
270	0.14
271	0.13
272	0.12
273	0.12
274	0.12
275	0.09
276	0.07
277	0.06
278	0.06
279	0.07
280	0.06
281	0.08
282	0.08
283	0.14
284	0.15
285	0.15
286	0.15
287	0.17
288	0.19
289	0.2
290	0.25
291	0.27
292	0.27
293	0.28
294	0.28
295	0.27
296	0.26
297	0.26
298	0.22
299	0.17
300	0.2
301	0.18
302	0.2
303	0.22
304	0.23
305	0.22
306	0.22
307	0.21
308	0.18
309	0.2
310	0.19
311	0.16
312	0.15
313	0.13
314	0.12
315	0.11
316	0.11
317	0.1
318	0.09
319	0.09
320	0.08
321	0.11
322	0.14
323	0.15
324	0.15
325	0.17
326	0.23
327	0.24
328	0.25
329	0.26
330	0.26
331	0.26
332	0.28
333	0.29
334	0.23
335	0.24
336	0.28
337	0.24
338	0.25
339	0.23
340	0.23
341	0.21
342	0.2
343	0.18
344	0.13
345	0.12
346	0.1
347	0.09
348	0.06
349	0.05
350	0.07
351	0.07
352	0.08
353	0.08
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.06
359	0.06
360	0.05
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.08
365	0.1
366	0.1
367	0.1
368	0.13
369	0.15
370	0.18
371	0.24
372	0.24
373	0.23
374	0.3
375	0.39
376	0.44
377	0.47
378	0.47
379	0.46
380	0.52
381	0.62
382	0.59
383	0.57
384	0.51
385	0.51
386	0.54
387	0.57
388	0.53
389	0.53
390	0.52
391	0.53
392	0.52
393	0.5
394	0.46
395	0.4
396	0.35
397	0.29
398	0.25
399	0.18
400	0.17
401	0.18
402	0.17
403	0.14
404	0.14
405	0.1
406	0.09
407	0.09
408	0.09
409	0.09
410	0.09
411	0.09
412	0.12
413	0.18
414	0.2
415	0.29
416	0.34
417	0.37
418	0.42
419	0.43
420	0.42
421	0.4
422	0.42
423	0.38
424	0.33
425	0.3
426	0.29
427	0.3
428	0.31
429	0.27
430	0.24
431	0.18
432	0.18
433	0.19
434	0.14
435	0.14
436	0.12
437	0.13
438	0.16
439	0.16
440	0.18
441	0.17
442	0.18
443	0.17
444	0.17
445	0.16
446	0.19
447	0.21
448	0.22
449	0.21
450	0.21
451	0.25
452	0.27
453	0.28
454	0.23
455	0.22
456	0.24
457	0.29
458	0.29
459	0.28
460	0.25
461	0.24
462	0.23
463	0.23
464	0.23
465	0.19
466	0.16
467	0.14
468	0.19
469	0.21
470	0.22
471	0.21
472	0.2
473	0.19
474	0.22
475	0.25
476	0.23
477	0.23
478	0.23
479	0.28
480	0.28
481	0.28
482	0.31
483	0.31
484	0.31
485	0.3
486	0.3
487	0.28
488	0.28
489	0.29
490	0.26
491	0.24
492	0.23
493	0.24
494	0.23
495	0.19
496	0.18
497	0.19
498	0.21
499	0.26
500	0.27
501	0.32
502	0.38

G0RA79

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer