FuNGI

G0RDP4

Protein Details

Accession

G0RDP4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
420-439	NCKFTHVKTKCKFNPCLNPT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto_nucl 9, cyto 5, mito 4, cysk 3, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR040366 Nab2/ZC3H14 IPR043094 Nab2/ZC3H14_N_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0046872 F:metal ion binding GO:0008143 F:poly(A) binding GO:1900364 P:negative regulation of mRNA polyadenylation GO:0043488 P:regulation of mRNA stability
KEGG	tre:TRIREDRAFT_75764 -
Pfam	View protein in Pfam PF14608 zf-CCCH_2

Amino Acid Sequences

MSVEIGLGTPLADALSAAIQPKLVEVGWGTGGGDESALAEYIILMLVNGKTQDQIAAELSGDLLNLPLDDPVVHEFSRWLFEQIHLLNAHGAQGNSGDSMGDTSQGDAAGAMDTEMGSSNAPELNAPTGPRSMRNGNMRGGRDKRMFGQMSKAMDRSNDNVLHRVRTQTGGERINTHGRAPPSGPRGGRGGMMRNHNNNNRGMPVGPMGGAPGAPGFPQWPMPQGHPSQLDVMALLEQQSQMMLELSQQMMNNGNRGFGHQRRGKSLFERTQDPRHKNNFRRGQGQGQGQGQSDANGEDSNMEGGAEGEDVDMGGKREPPNPDETVCKYNLHCTNKDCKFAHQSPAAPPGTSVDVNDVCSFGAACKNRKCVGRHPSPAARLAHQSEQDCKFFPNCQNPRCPFKHPSMPLCRNGADCTTPNCKFTHVKTKCKFNPCLNPTCAFAHEEGQQGGFKDKVWTPGQGQEHVSERKFVDENAEEQLIRPDTENKQEMAQDQEITA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.05
2	0.06
3	0.07
4	0.08
5	0.09
6	0.09
7	0.09
8	0.1
9	0.11
10	0.1
11	0.1
12	0.1
13	0.12
14	0.12
15	0.12
16	0.12
17	0.1
18	0.11
19	0.1
20	0.09
21	0.06
22	0.06
23	0.06
24	0.06
25	0.06
26	0.05
27	0.05
28	0.05
29	0.05
30	0.04
31	0.03
32	0.05
33	0.06
34	0.08
35	0.09
36	0.09
37	0.09
38	0.1
39	0.12
40	0.11
41	0.13
42	0.13
43	0.13
44	0.12
45	0.12
46	0.12
47	0.1
48	0.09
49	0.07
50	0.06
51	0.05
52	0.05
53	0.05
54	0.05
55	0.05
56	0.05
57	0.07
58	0.1
59	0.13
60	0.13
61	0.13
62	0.14
63	0.15
64	0.19
65	0.18
66	0.18
67	0.15
68	0.17
69	0.23
70	0.23
71	0.26
72	0.23
73	0.22
74	0.21
75	0.2
76	0.21
77	0.16
78	0.15
79	0.11
80	0.11
81	0.11
82	0.1
83	0.1
84	0.08
85	0.06
86	0.08
87	0.07
88	0.08
89	0.07
90	0.08
91	0.09
92	0.08
93	0.08
94	0.07
95	0.07
96	0.06
97	0.05
98	0.05
99	0.04
100	0.04
101	0.04
102	0.05
103	0.05
104	0.05
105	0.05
106	0.06
107	0.07
108	0.07
109	0.07
110	0.08
111	0.1
112	0.11
113	0.12
114	0.13
115	0.15
116	0.16
117	0.19
118	0.23
119	0.25
120	0.3
121	0.37
122	0.39
123	0.42
124	0.47
125	0.48
126	0.51
127	0.51
128	0.52
129	0.47
130	0.45
131	0.43
132	0.45
133	0.44
134	0.36
135	0.4
136	0.37
137	0.38
138	0.38
139	0.36
140	0.28
141	0.28
142	0.29
143	0.25
144	0.26
145	0.26
146	0.25
147	0.3
148	0.31
149	0.32
150	0.31
151	0.31
152	0.26
153	0.25
154	0.26
155	0.26
156	0.31
157	0.31
158	0.31
159	0.31
160	0.33
161	0.36
162	0.35
163	0.3
164	0.27
165	0.25
166	0.26
167	0.25
168	0.28
169	0.26
170	0.3
171	0.29
172	0.27
173	0.28
174	0.27
175	0.28
176	0.24
177	0.25
178	0.25
179	0.32
180	0.35
181	0.38
182	0.45
183	0.47
184	0.48
185	0.44
186	0.41
187	0.35
188	0.31
189	0.25
190	0.19
191	0.15
192	0.12
193	0.11
194	0.09
195	0.08
196	0.07
197	0.06
198	0.05
199	0.04
200	0.04
201	0.03
202	0.04
203	0.04
204	0.05
205	0.08
206	0.08
207	0.11
208	0.13
209	0.15
210	0.2
211	0.2
212	0.24
213	0.22
214	0.23
215	0.21
216	0.2
217	0.17
218	0.13
219	0.12
220	0.08
221	0.07
222	0.06
223	0.05
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.03
231	0.04
232	0.05
233	0.06
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.12
238	0.12
239	0.14
240	0.13
241	0.14
242	0.12
243	0.15
244	0.2
245	0.19
246	0.27
247	0.29
248	0.31
249	0.36
250	0.39
251	0.39
252	0.38
253	0.44
254	0.41
255	0.4
256	0.44
257	0.43
258	0.5
259	0.56
260	0.57
261	0.57
262	0.6
263	0.67
264	0.68
265	0.74
266	0.74
267	0.69
268	0.7
269	0.64
270	0.61
271	0.58
272	0.54
273	0.48
274	0.41
275	0.39
276	0.33
277	0.31
278	0.24
279	0.18
280	0.15
281	0.11
282	0.09
283	0.07
284	0.07
285	0.06
286	0.06
287	0.05
288	0.05
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.03
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.04
300	0.04
301	0.05
302	0.09
303	0.11
304	0.15
305	0.18
306	0.2
307	0.25
308	0.27
309	0.28
310	0.29
311	0.32
312	0.31
313	0.31
314	0.3
315	0.26
316	0.32
317	0.38
318	0.39
319	0.39
320	0.39
321	0.48
322	0.5
323	0.57
324	0.5
325	0.48
326	0.51
327	0.51
328	0.53
329	0.48
330	0.47
331	0.42
332	0.5
333	0.45
334	0.36
335	0.32
336	0.27
337	0.25
338	0.23
339	0.19
340	0.15
341	0.15
342	0.17
343	0.18
344	0.16
345	0.12
346	0.12
347	0.12
348	0.08
349	0.14
350	0.17
351	0.24
352	0.29
353	0.35
354	0.39
355	0.46
356	0.49
357	0.52
358	0.58
359	0.61
360	0.63
361	0.65
362	0.68
363	0.65
364	0.67
365	0.59
366	0.52
367	0.47
368	0.44
369	0.41
370	0.39
371	0.38
372	0.38
373	0.4
374	0.39
375	0.35
376	0.33
377	0.3
378	0.31
379	0.37
380	0.41
381	0.45
382	0.49
383	0.58
384	0.61
385	0.68
386	0.67
387	0.67
388	0.61
389	0.6
390	0.65
391	0.62
392	0.67
393	0.69
394	0.71
395	0.69
396	0.68
397	0.62
398	0.53
399	0.49
400	0.42
401	0.35
402	0.31
403	0.32
404	0.36
405	0.36
406	0.36
407	0.34
408	0.36
409	0.37
410	0.41
411	0.47
412	0.47
413	0.56
414	0.61
415	0.71
416	0.75
417	0.79
418	0.79
419	0.78
420	0.8
421	0.77
422	0.79
423	0.72
424	0.65
425	0.6
426	0.55
427	0.47
428	0.38
429	0.32
430	0.27
431	0.26
432	0.27
433	0.24
434	0.23
435	0.23
436	0.21
437	0.23
438	0.2
439	0.17
440	0.19
441	0.21
442	0.26
443	0.27
444	0.3
445	0.31
446	0.39
447	0.42
448	0.41
449	0.41
450	0.37
451	0.42
452	0.45
453	0.42
454	0.39
455	0.35
456	0.36
457	0.35
458	0.32
459	0.33
460	0.29
461	0.3
462	0.3
463	0.32
464	0.27
465	0.26
466	0.32
467	0.26
468	0.24
469	0.24
470	0.26
471	0.29
472	0.38
473	0.41
474	0.35
475	0.37
476	0.39
477	0.39
478	0.4
479	0.38

G0RDP4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer