Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RDH1

Protein Details
Accession G0RDH1    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-27AAAPVRKKKLPFKPTALRNVAPHydrophilic
61-87RIVAAERERKLNKKKQKQAEEERHLSDHydrophilic
417-436QEPEGKRKKLRIKLVAKGMDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-75RKLNKKK
156-163SKSSKRRR
422-427KRKKLR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022617  Rad60/SUMO-like_dom  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
KEGG tre:TRIREDRAFT_120794  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11976  Rad60-SLD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50053  UBIQUITIN_2  
Amino Acid Sequences MSDEVAAAPVRKKKLPFKPTALRNVAPVSKPATTAEDGKKGEGDDDGDGLDLFRQSREMERIVAAERERKLNKKKQKQAEEERHLSDMAEKQLLESDEQHHEENTAVLTLKSSAGFEDAQATPVDDSLALEGDGFSRELVTPPPSKRSRRDSDQGSKSSKRRRSAAEPLEDDPFHATPSGAPLIDLDSASESESDFDDDGVDAEEKDVGTAAPPSAQQREDSVEFVGSGTLSGDILSPTPRAQTTTEMEEDDDEFVEYVRKAEAQRARDKDMMQLDSEKTVEKAAAAQIMVQSSIPGTKPACIKYLFNKPLRLIRDSWIALQRRKGVQLPITSDNDIVLTWQQKRVYTNSTLLSLGIRPQGDGKIIADEYSKGGLLEGRTKVALEAWTAEGFRQWEDEEEMRLRREAGELPEEEPTQEPEGKRKKLRIKLVAKGMDVVKLSVLPETTVETLVIGFQTQRSVASDKDVSIWFDGERLEEHQTMEDAGIDEMDTLEVHIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.67
3 0.7
4 0.74
5 0.79
6 0.83
7 0.86
8 0.83
9 0.73
10 0.67
11 0.65
12 0.6
13 0.52
14 0.46
15 0.4
16 0.34
17 0.35
18 0.32
19 0.3
20 0.27
21 0.34
22 0.37
23 0.4
24 0.4
25 0.4
26 0.39
27 0.34
28 0.33
29 0.26
30 0.22
31 0.15
32 0.15
33 0.13
34 0.12
35 0.11
36 0.11
37 0.1
38 0.09
39 0.09
40 0.08
41 0.1
42 0.11
43 0.17
44 0.21
45 0.22
46 0.23
47 0.23
48 0.25
49 0.26
50 0.29
51 0.26
52 0.29
53 0.29
54 0.36
55 0.4
56 0.47
57 0.55
58 0.61
59 0.7
60 0.74
61 0.82
62 0.84
63 0.89
64 0.91
65 0.92
66 0.92
67 0.91
68 0.86
69 0.78
70 0.69
71 0.58
72 0.48
73 0.41
74 0.34
75 0.28
76 0.24
77 0.21
78 0.19
79 0.23
80 0.24
81 0.21
82 0.18
83 0.19
84 0.23
85 0.25
86 0.26
87 0.22
88 0.21
89 0.2
90 0.19
91 0.15
92 0.11
93 0.09
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.08
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.14
105 0.13
106 0.14
107 0.13
108 0.14
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.1
127 0.14
128 0.19
129 0.22
130 0.31
131 0.38
132 0.44
133 0.51
134 0.58
135 0.62
136 0.64
137 0.7
138 0.7
139 0.73
140 0.75
141 0.74
142 0.72
143 0.7
144 0.7
145 0.72
146 0.7
147 0.65
148 0.62
149 0.63
150 0.64
151 0.67
152 0.68
153 0.66
154 0.62
155 0.57
156 0.55
157 0.48
158 0.4
159 0.32
160 0.24
161 0.17
162 0.14
163 0.12
164 0.08
165 0.12
166 0.12
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.11
172 0.1
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.09
202 0.11
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.17
207 0.17
208 0.17
209 0.15
210 0.13
211 0.12
212 0.12
213 0.1
214 0.06
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.09
229 0.1
230 0.13
231 0.15
232 0.17
233 0.18
234 0.17
235 0.17
236 0.16
237 0.15
238 0.12
239 0.09
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.07
248 0.07
249 0.14
250 0.19
251 0.24
252 0.32
253 0.35
254 0.39
255 0.4
256 0.4
257 0.39
258 0.38
259 0.34
260 0.26
261 0.25
262 0.21
263 0.2
264 0.2
265 0.15
266 0.11
267 0.1
268 0.09
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.08
284 0.08
285 0.11
286 0.14
287 0.16
288 0.19
289 0.19
290 0.21
291 0.25
292 0.36
293 0.4
294 0.41
295 0.43
296 0.42
297 0.47
298 0.48
299 0.46
300 0.37
301 0.32
302 0.35
303 0.32
304 0.33
305 0.34
306 0.36
307 0.35
308 0.38
309 0.4
310 0.36
311 0.38
312 0.37
313 0.35
314 0.35
315 0.37
316 0.38
317 0.37
318 0.37
319 0.35
320 0.32
321 0.27
322 0.23
323 0.18
324 0.13
325 0.11
326 0.13
327 0.14
328 0.18
329 0.2
330 0.22
331 0.25
332 0.28
333 0.3
334 0.3
335 0.32
336 0.3
337 0.3
338 0.28
339 0.25
340 0.22
341 0.18
342 0.16
343 0.16
344 0.14
345 0.13
346 0.14
347 0.15
348 0.15
349 0.16
350 0.14
351 0.14
352 0.14
353 0.14
354 0.13
355 0.12
356 0.13
357 0.12
358 0.12
359 0.08
360 0.09
361 0.1
362 0.11
363 0.17
364 0.17
365 0.17
366 0.17
367 0.17
368 0.17
369 0.17
370 0.16
371 0.11
372 0.12
373 0.13
374 0.14
375 0.14
376 0.14
377 0.14
378 0.14
379 0.13
380 0.13
381 0.11
382 0.12
383 0.17
384 0.18
385 0.2
386 0.23
387 0.25
388 0.25
389 0.25
390 0.24
391 0.2
392 0.21
393 0.21
394 0.21
395 0.24
396 0.24
397 0.25
398 0.28
399 0.27
400 0.26
401 0.23
402 0.22
403 0.2
404 0.23
405 0.23
406 0.29
407 0.39
408 0.46
409 0.52
410 0.59
411 0.65
412 0.7
413 0.79
414 0.8
415 0.79
416 0.79
417 0.82
418 0.78
419 0.69
420 0.64
421 0.55
422 0.48
423 0.39
424 0.31
425 0.22
426 0.17
427 0.17
428 0.14
429 0.13
430 0.1
431 0.1
432 0.13
433 0.14
434 0.13
435 0.13
436 0.11
437 0.11
438 0.11
439 0.1
440 0.08
441 0.07
442 0.07
443 0.1
444 0.1
445 0.11
446 0.14
447 0.16
448 0.16
449 0.22
450 0.23
451 0.22
452 0.26
453 0.27
454 0.25
455 0.24
456 0.25
457 0.18
458 0.18
459 0.17
460 0.15
461 0.15
462 0.16
463 0.2
464 0.2
465 0.21
466 0.21
467 0.21
468 0.21
469 0.19
470 0.17
471 0.13
472 0.11
473 0.1
474 0.09
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.06